一、研究背景与意义 近十余年来，表观遗传学在细胞命运调控及疾病发生发展中的作用日益凸显。作为表观遗传调控的重要一环，RNA水平的修饰，尤其是N6-甲基腺苷（N6-methyladenosine, m6A）修饰，已被证实广泛存在于真核生物mRNA内部，并在调控mRNA稳定性、剪接、输出、降解及翻译等多个环节中发挥关键作用。然而，尽管诸多m6A修饰上的“写手”（writers）、“橡皮擦”（erasers）及“阅读器”（readers）已被逐步发现，m6A“阅读器”YTHDF2在人类胚胎干细胞（human embryonic stem cells, hESCs）自我更新及分化中的具体作用与机制，却依然存在诸多未解之谜。 干细胞作为再生医学的重要基础，其多能性（pluripotency）和分化能力...

背景介绍 在细胞生物学中，理解细胞对扰动的不同响应至关重要。扰动（perturbation）是指通过基因编辑、化学物质、环境变化或机械力等方式改变细胞状态，从而研究其功能。然而，现有的方法在量化单细胞水平的异质性响应时存在局限性，尤其是在部分基因扰动（partial gene perturbation）和剂量效应（dosage effect）的分析上表现不佳。为了解决这一问题，研究者开发了一种新的计算方法——扰动响应评分（Perturbation-Response Score, PS），旨在更准确地量化单细胞扰动响应的异质性，并揭示细胞内在和外在因素对扰动结果的影响。 论文来源 本论文由Bicna Song、Dingyu Liu等多名研究者共同完成，作者来自多个知名机构，包括Children...

精神疾病的细胞类型分类：新研究揭示精神分裂症等复杂脑部疾病的细胞基础 学术背景 精神疾病，如精神分裂症、抑郁症和双相情感障碍，是全球范围内的重要公共卫生问题。这些疾病通常由多种遗传和环境因素共同导致，且治疗手段有限。尽管全基因组关联研究（GWAS）已经识别出数千个与精神疾病相关的遗传位点，但这些位点的生理意义仍不明确。近年来，单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）技术的发展，使得研究者能够在单细胞水平上解析基因表达，从而更深入地理解精神疾病的细胞基础。然而，如何将GWAS数据与单细胞转录组数据结合起来，确定哪些细胞类型与精神疾病的发生密切相关，仍然是一个巨大的挑战。 本研究旨在通过结合GWAS和snRNA-seq数据，系统地分析精神分裂症等精神疾病的细胞...

研究背景 在神经科学领域，amyotrophic lateral sclerosis (ALS) 和 frontotemporal lobar degeneration (FTLD) 是两种具有高度异质性的神经退行性疾病。研究表明，在这些疾病中，c9orf72基因中的非编码六核苷酸重复扩展是最常见的遗传原因。然而，这种重复扩展在转录组层面的具体后果仍不完全清楚。尽管已有研究揭示c9orf72重复扩展可能通过减少基因表达、形成RNA焦点和聚合二肽重复蛋白（DPR）等机制引发疾病，但这些机制何以导致广泛的临床和病理学变异，目前尚无定论。 近来，研究人员逐渐注意到小脑在ALS和FTLD研究中的重要性。尽管小脑传统上被认为在这些疾病中较为不受影响，最新的研究表明，TDP-43蛋白在这一脑区的水平有所...

对前列腺癌患者进行转录组分析：基于前列腺特异膜抗原正电子发射断层扫描/计算机断层扫描的非局限性疾病研究 学术背景 前列腺癌是一种常见的男性恶性肿瘤，其诊断和治疗对患者的预后至关重要。转录组分析是一种用于了解基因表达水平的技术，近年来被广泛应用于癌症研究中。Decipher基因分类器是一种预后生物标志物，用于估计前列腺癌患者根治性手术（RP）或放射治疗后的转移风险。当前研究的兴起源自于对Decipher测试在前列腺特异膜抗原正电子发射断层扫描/计算机断层扫描（PSMA PET/CT）时代的预后能力的兴趣。鉴于PSMA PET/CT在检测非局限性疾病方面的高特异性和灵敏性，研究者们希望通过这一先进的分子成像技术，评估Decipher评分与非局限性疾病检测之间的关系。 研究来源 这项研究由John...