蛋白质-蛋白质互作预测的新进展:HSSPPI模型从分层与空间-序列双视角全面解析蛋白互作位点
背景介绍:揭示蛋白互作预测的瓶颈与机遇 蛋白质(Protein)作为生命活动的核心分子,几乎参与了所有生物学过程与细胞功能,包括基因表达、RNA转录、DNA合成以及免疫反应等。蛋白分子之间的相互作用(Protein-Protein Interactions, PPI)以及特定位点上的互动(Protein-Protein Interaction Sites, PPIS)决定了多样且精确的生理活动。例如,药物设计、蛋白功能注释、疾病分子机制探索、以及全局蛋白互作网络构建等,都以高质量的PPI和PPIS信息为基础。 然而,传统基于生物实验(如X射线晶体学、质谱等)对PPI位点进行检测的方法耗时高、成本昂贵,并且面临样品复杂性高和可扩展性不足的问题。随着蛋白数据库的快速扩充及疾病防治需求的日益迫切,...