双向表观遗传编辑揭示基因调控的层次结构 背景和研究动机 在人类基因组中，非编码元件如增强子（enhancer）在基因调控中的作用已被广泛认知。然而，目前常用的CRISPR干扰方法在研究非编码元件和遗传相互作用方面仍存在一些局限性。主要是因为传统的CRISPR方法，如CRISPR干扰（CRISPRi）和CRISPR激活（CRISPRa），仅能一次性进行单个位点的编辑。这限制了研究人员对基因调控网络中相互作用的深入理解。因此，本研究致力于开发一种可以双向编辑表观遗传特性的系统，以解决这些问题。 来源和作者信息 这篇题为”Bidirectional Epigenetic Editing Reveals Hierarchies in Gene Regulation”的研究论文，发表于《Nature ...

ARID1A Loss与B细胞命运及淋巴瘤发生 背景介绍 本文研究了ARID1A（AT-Rich Interactive Domain 1A）在B细胞命运决定与淋巴瘤发生中的关键作用。ARID1A是血糖重建复合体（BAF, BRG1/Brahma-associated factors）中的重要亚基，其突变常见于多种人类恶性肿瘤中。以往研究表明，BAF复合体通过调节染色质可达性，影响基因表达和细胞命运。然而，ARID1A突变在功能丧失后的具体机制仍不清楚，特别是在B细胞中的表现。本研究旨在揭示ARID1A突变如何影响B细胞的发育并推动淋巴瘤的发生，以及探索ARID1A缺失是否可以作为潜在的治疗靶点。 论文来源 本文由Darko Barisic、Christopher R. Chin、Cem M...

这项研究探讨了转录因子Meis2在小鼠胚胎发育过程中参与调控γ-氨基丁酸能(GABA)能神经元发育分化的作用机制。研究人员综合应用了CRISPR/Cas9敲低、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、谱系示踪等技术,发现Meis2在胚胎基底节细胞区的投射神经元前体细胞中高表达,有利于这些前体细胞分化为外侧基底节来源的GABA能投射神经元。 Meis2与Dlx5家族转录因子协同作用,结合特定的顺式调控元件(cis-regulatory elements,cREs),激活与投射神经元分化相关的基因enhancer区域,从而诱导投射神经元命运。相比之下,在内侧基底节区,Lhx6转录因子的表达则抑制了Meis2-Dlx5复合物对这些enhancer的激活,促进了GABA能interneuron的分化...