EpicPred——基于注意力机制的多实例学习预测表位驱动的T细胞受体表型

T细胞受体(TCR)在适应性免疫系统中起着至关重要的作用,它们通过与特定抗原表位(epitope)结合来识别病原体。理解TCR与表位之间的相互作用对于揭示免疫反应的生物学机制以及开发T细胞介导的免疫疗法具有重要意义。然而,尽管TCR的CDR3区域在表位识别中的重要性已被广泛认可,但如何准确预测与特定疾病或表型相关的TCR-表位相互作用仍是一个挑战。为此,研究人员开发了EpicPred,一种基于注意力机制的多实例学习(Multiple Instance Learning, MIL)模型,旨在预测与癌症或COVID-19患者严重程度相关的TCR-表位相互作用。 论文来源 该论文由Jaemin Jeon、Suwan Yu、Sangam Lee、Sang Cheol Kim、Hye-Yeong Jo...

全食物植物性饮食降低转移性乳腺癌患者的氨基酸水平

植物性全食物饮食对转移性乳腺癌患者氨基酸水平的影响 研究背景 癌症细胞的生长和存活依赖于大量的代谢需求,尤其是对氨基酸的需求。肿瘤通过从周围微环境中摄取氨基酸来满足其需求,而饮食中的氨基酸摄入量可能影响血清中的氨基酸水平。研究表明,植物性饮食比动物性饮食含有更少的氨基酸,但植物性饮食是否能够降低癌症患者血清中的氨基酸水平尚不明确。因此,研究人员希望通过一项临床试验,探讨植物性全食物饮食对转移性乳腺癌患者血清氨基酸水平的影响,并评估这种饮食方式对癌症治疗的潜在协同作用。 论文来源 这篇论文由Tashjaé Q. Scales等人撰写,研究团队来自University of Rochester Medical Center和Wilmot Cancer Institute等机构。论文于2024年发...

脑屏障在肿瘤转移过程中的作用:突破界限

肿瘤脑转移中的脑屏障作用 背景介绍 脑转移(Brain Metastases, BMs)是成人中最常见的颅内肿瘤,其发生率是原发性脑肿瘤的3至10倍。尽管采用了包括手术切除、放疗和化疗在内的多种治疗手段,脑转移的预后仍然较差,治疗难度较大。脑转移主要来源于肺癌(20-56%)、乳腺癌(5-20%)和黑色素瘤(7-16%),但也可能来自其他类型的癌症。脑转移的过程涉及多个步骤,包括局部侵袭、进入血液或淋巴系统、外渗到正常组织以及远端部位的定植。到达大脑后,循环肿瘤细胞(Circulating Tumor Cells, CTCs)需要突破血脑屏障(Blood-Brain Barrier, BBB)。 血脑屏障的选择性通透性对治疗药物的渗透构成了重大挑战,限制了脑转移的治疗效果。因此,理解肿瘤细胞...

CXXC5在癌症中的信号整合功能

CXXC5在癌症中的信号整合功能 学术背景 CXXC5(CXXC型锌指蛋白5)是ZF-CXXC蛋白家族的成员之一,在细胞信号网络中扮演着信号整合和信息传递的关键角色。CXXC5通过调控多种信号通路(如Wnt/β-catenin、TGF-β/BMP、ATM/p53等)和基因表达,参与细胞增殖、分化、凋亡和代谢等过程。其异常表达或功能失调与多种病理过程相关,尤其是癌症的发生和发展。然而,CXXC5在癌症中的具体作用机制及其潜在的治疗价值尚未完全阐明。因此,本文旨在全面综述CXXC5在细胞信号网络中的功能,特别是在癌症中的作用,并探讨其作为治疗靶点的潜力。 论文来源 本文由Zihao An、Jiepu Wang、Chengzuo Li和Chao Tang共同撰写,作者来自浙江大学医学院附属儿童医院...

癌症患者出血事件的发病率、风险因素及预后影响:一项前瞻性队列研究

癌症患者出血风险的发病率、危险因素及预后影响:基于维也纳癌症、血栓和出血研究的前瞻性队列研究综述 学术背景与研究动机 癌症患者常伴随血栓和止血功能紊乱(hemostatic dysregulation),但相关研究数据主要集中在癌症相关静脉血栓栓塞(cancer-associated venous thromboembolism,VTE),而关于出血事件的数据较为稀缺。由于出血事件在临床上的潜在危害性,如死亡风险的明显增加,深入理解其风险因素及临床模式对临床决策具有重要意义。此外,抗凝治疗作为预防和治疗VTE的重要手段,提高了癌症患者的出血风险,进一步使得全方位评估血栓与出血的风险成为必要。现有血栓和出血风险评估工具多基于非癌症人群,无法为癌症患者提供准确的预测模型。 为填补这一数据空白,研...