创建互补综合网络用于快速筛选适用于新发疾病爆发的可用药物

新型药物重新定位方法的网络构建与应用研究 背景 在COVID-19大流行期间,研究人员和制药公司致力于开发治疗和疫苗。药物重新定位由于捷径被认为是快速有效的应对策略。药物重新定位试图发现已批准药物的新用途,被认为比传统药物发现路径更廉价且更迅速[1–3]。例如,瑞德西韦和地塞米松就是两种成功的重新定位药物[4–6]。虽然全球疫情逐渐转向地方性阶段,病毒传播仍在继续。快速发现候选药物并提供给医学或制药领域的专家进行研究的重要性已被COVID-19大流行深刻地提醒了我们[7]。 随着生物学机制的进步和生物医学知识的收集,更准确和精确的基于计算的药物重新定位成为可能。网络药物学(network medicine)通过观察生物实体(如药物、基因和疾病)之间的复杂关系,提供候选药物[8–11]。但在新...

使用多视角自适应加权图卷积网络预测非小细胞肺癌的免疫治疗效果

非小细胞肺癌的免疫疗法疗效预测:多视角自适应加权图卷积网络研究报告 背景介绍 肺癌是一种具有极高发病率和较差预后效果的恶性肿瘤,长期以来其致命率居高不下。在所有的肺癌患者中,非小细胞肺癌(Non-Small Cell Lung Cancer,简称NSCLC)约占85%。作为一种新兴的治疗手段,肿瘤免疫疗法为癌症患者提供了新的治疗思路。然而,免疫疗法费用高昂,且仅有约20%到50%的患者能够通过免疫疗法获得满意的疗效。此外,在治疗过程中,免疫性肺炎和肝炎等副作用可能发生。因此,在患者接受免疫疗法治疗前预测其疗效具有重要意义。 近年来,以机器学习为基础的放射组学在预测NSCLC免疫疗法的疗效方面表现出潜力。放射组学特征已经被证明为有效预测免疫疗法疗效的代理标志物。然而,大多数研究仅考虑了个体患者...

罗兰癫痫中丘脑皮层连接减少

罗兰癫痫中丘脑皮层连接减少

罗兰蒂克型癫痫的丘脑皮层神经连接减少 罗兰蒂克型癫痫(Rolandic Epilepsy, RE),亦即带有中颞棘波的自限性癫痫(self-limited epilepsy with centrotemporal spikes, SELECTS),是最常见的局部发育性癫痫脑病。这种癫痫通常伴随短暂的轻度至严重的认知症状,以及由感觉运动皮层引发的睡眠栓道棘波和癫痫发作。尽管大多数患有RE的儿童在活动期内能够通过正式测试检测到认知缺陷,这些癫痫发作和认知问题最终会自限并消失。然而,仍有许多问题未得到解答,例如:具体的神经机制是什么,哪些因素决定了症状的消失以及这种癫痫的长期影响是什么。正是在这种背景下,本研究旨在更深入地探索解决罗兰蒂克型癫痫症状的神经连接变化。 研究来源 本研究由位于波士顿的多...

唾液睾酮水平与痛觉在健康成年人中呈现性别特异性关联,但在偏头痛患者中不存在

唾液睾酮水平与疼痛感知在健康成人中表现出性别特异性关联,而在偏头痛患者中则无这种关联 引言 了解疼痛的复杂性和性别在疼痛感知中扮演的角色对医学研究具有重要意义。痛感是一种与实际或潜在组织损伤相关的不愉快的感觉和情感体验,可以受多种内在和外界因素影响,如基因、情绪状态、性别差异等。尤其是在性激素如何调节疼痛方面,已有大量研究表明睾酮与减轻疼痛存在关联。然而,性别在这些关联中的具体角色仍存在很大未知。这促使研究人员探讨健康成人和偏头痛患者中唾液睾酮水平和疼痛感知之间的关联。 研究背景与目的 本文作者关注性别特异性唾液睾酮与疼痛感知的关联,选择偏头痛作为研究对象,因为这是一种常见的疼痛障碍,全球患病率约为15%。研究的目的是探讨在健康个体和偏头痛患者中,唾液睾酮水平是否与疼痛感知存在性别特异性关联...

单细胞皮层形态脑网络:表型关联和神经生物学基础

研究背景与问题 陈述 本文是一项关于单一被试形态学脑网络在表型关联性及神经生物学基础方面的研究。该研究结合了多模态和多尺度数据,揭示了形态学脑网络与性别的差异、其作为个体特异性标志的潜力以及其与基因表达、层特异性细胞结构和化学结构的关系。这些发现深化了我们对单被试形态学脑网络作用和起源的理解,并为其在未来个性化脑联结组研究中的应用提供了有力依据。 形态学脑网络指的是基于结构性磁共振成像(structural magnetic resonance imaging,简写为sMRI)估算的脑区域之间的形态学关系。最早的研究通过计算一个群体中某形态学指标(如灰质体积,皮层厚度或表面积)的区域间协方差来估算这些关系,但这种基于群体的方法忽略了个体间的差异,导致了形态学脑网络所揭示的神经生物学意义不明确...

组蛋白H3K9ac特异性重编程调控食管鳞状细胞癌进展与转移

关于组蛋白H3赖氨酸9位乙酰化(H3K9ac)特异性重编程在食管鳞状细胞癌(ESCC)进展与转移中的作用机制 背景介绍 食管癌是全球范围内最为普遍和侵袭性的恶性肿瘤之一,每年导致超过50万癌症相关死亡病例,位列癌症致死原因第六位。食管鳞状细胞癌(ESCC)占所有食管癌病例的近90%,主要影响东亚和非洲地区的人群。尽管近几十年在治疗上取得了显著进展,ESCC的总体5年生存率仍低于20%,这主要源于ESCC早期症状不明显、多数患者在确诊时已是局部晚期或存在区域性淋巴结转移,容易导致肿瘤病灶复发或远处转移,最终致病。 目前已知大多数人类癌症是由基因突变和表观遗传改变共同作用的结果,包括DNA甲基化和组蛋白翻译后修饰(PTMs)。ESCC的基因组异常已被广泛研究,但缺乏驱动突变,因此基因组指导的治疗...

通过质粒基因疗法修饰肿瘤微环境来增强抗肿瘤免疫

由Guilan Shi、Jody Synowiec、Julie Singh和Richard Heller组成的研究团队在《Cancer Gene Therapy》上发表了一篇题为“Modification of the tumor microenvironment enhances immunity with plasmid gene therapy”的论文。本篇论文的研究背景源于目前肿瘤免疫治疗领域的挑战性问题,如肿瘤细胞逃避免疫监视,尤其是通过MHC-I分子和PD-L1的表达调控,阻碍T细胞的杀伤作用。因此,研究这些分子的上调机制及其应用潜力具有重要的临床意义。 研究背景与动机 肿瘤细胞通常通过干扰MHC介导的抗原呈递和表达抑制性受体如PD-L1来逃避免疫监视。在肿瘤发生和进展过程中,M...

施旺细胞来源的多效蛋白刺激成纤维细胞在丛状神经纤维瘤中过度增殖和胶原沉积

本研究探讨了神经纤维瘤病1型(neurofibromatosis type 1, NF1)相关的丛状神经纤维瘤(plexiform neurofibroma, PNF)中Schwann细胞和成纤维细胞之间的相互作用。研究的背景源于NF1的高发病率,约影响全球1/3000的新生儿,并伴随一系列独特的临床表现。PNF是NF1患者中常见的周围神经鞘瘤,约50%的患者罹患此疾病,并严重影响其生活质量。尽管经过数十年的研究,PNF依然无法治愈。现有的治疗方法主要针对NF1相关的Schwann细胞,并取得了一些临床疗效。然而,许多治疗方法,如选择性MEK抑制剂Selumetinib,仅对部分患者有效,且长期使用会导致耐药性。这促使研究人员将目光转向PNF中的成纤维细胞及其在肿瘤中异常增殖和胶原沉积的作用...

GRIN2A 突变是预测多种癌症中免疫检查点抑制剂受益者的新指标

GRIN2A 突变是多种癌症中免疫检查点抑制剂受益者的分层新指标 背景介绍 免疫检查点抑制剂(ICIs)治疗通过调节细胞毒性T淋巴细胞抗原4(CTLA-4)和程序性细胞死亡(配体)1(PD-(L)1)通路,已经在多种癌症治疗中取得了革命性进展。然而,尽管ICIs疗效显著,不同肿瘤患者之间的临床反应仍存在显著差异。因此,识别预测ICI反应的可靠生物标志物对于开发更精准的治疗干预措施是迫在眉睫的。在现今的研究中,已有多种生物标志物被联系到ICI反应,包括免疫检查点水平、肿瘤突变负荷(TMB)、非整倍性评分、插入缺失变异和单核苷酸变异(SNV)新抗原负荷、微卫星不稳定性、淋巴细胞浸润、特定基因突变和拷贝数变异(CNA)。但是,这些生物标志物在实际应用中仍有局限性。 N-甲基-D-天冬氨酸受体(NM...

维甲酸和EZH2抑制剂协同作用对膀胱癌细胞的抗癌效应

研究简介 近日,发表在《Cancer Gene Therapy》期刊上的一篇题为”Retinoids and EZH2 inhibitors cooperate to orchestrate anti-oncogenic effects on bladder cancer cells”的论文引起了同行的广泛关注。这篇论文探讨了视黄酸(retinoic acid)和EZH2抑制剂在膀胱癌细胞中的联合应用,及其在抗癌治疗中的潜在作用。 研究背景 膀胱癌(bladder cancer)是一种高度异质性、易多灶性复发且高度转移的恶性肿瘤类型。由于传统疗法的反复和频繁的抗药性问题,膀胱癌患者的预后一直不理想。近年来,肿瘤基因组分析的进展揭示了膀胱癌中具有重要作用的基因突变特征,特别是在染色质调控基因方...