GCduo : Un logiciel open-source pour l'analyse des données GC × GC–MS

Chimie, Chimie analytique, Chimie computationnelle,
GC × GC–MS   chromatographie multidimensionnelle   métabolomique   chimiométrie   PARAFAC   PARAFAC2   logiciel open-source  

Contexte académique et motivation de la recherche Avec la demande croissante de l’analyse d’échantillons complexes, la chromatographie, notamment la chromatographie en phase gazeuse bidimensionnelle couplée à la spectrométrie de masse (GC×GC–MS, Gas Chromatography coupled with Mass Spectrometry), s’impose comme une technologie de pointe dans des do...

DockEM : Une méthode améliorée pour le raffinement de l'amarrage protéine-ligand à l'échelle atomique exploitant les cartes de densité Cryo-EM de résolution faible à moyenne

Chimie, Chimie pharmaceutique, Chimie computationnelle, Sciences de la vie, Biochimie, Biophysique,
amarrage protéine-ligand   cryo-EM   amarrage moléculaire   criblage de médicaments   biologie structurale  

Contexte académique et motivations de la recherche Ces dernières années, le docking protéine–ligand s’est imposé comme une technologie clé pour le criblage virtuel de médicaments et le développement de nouveaux médicaments basés sur la structure. L’application à grande échelle des technologies de criblage à haut débit a certes amélioré l’efficacité...

Un potentiel de machine à comité bayésien clairsemé pour les composés organiques contenant de l'oxygène

Chimie, Chimie organique, Chimie physique, Chimie computationnelle, Génie chimique, Science des matériaux,
apprentissage automatique   machine à comité bayésien   composés organiques contenant de l'oxygène   potentiels interatomiques   chimie computationnelle  

Contexte académique Dans le domaine de la science des matériaux et de la chimie, il est essentiel de comprendre les propriétés des matériaux à l’échelle atomique. Cependant, les méthodes traditionnelles de calcul des potentiels interatomiques, telles que la théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT), bien que précises, sont extrêmement coûteus...

GutBugDB : une ressource web pour prédire la biotransformation des molécules biotiques et xénobiotiques médiée par le microbiome intestinal humain

Chimie, Chimie pharmaceutique, Chimie computationnelle, Sciences de l'information, Intelligence artificielle, Médecine, Système gastro-intestinal, Pharmacie, Sciences de la vie, Biochimie, Microbiologie,
biotransformation   base de données   microbiome intestinal humain   apprentissage automatique   métabolisme des xénobiotiques  

Ces dernières années, le rôle crucial du microbiote intestinal humain (Human Gut Microbiota, HGM) dans le métabolisme des médicaments et des nutriments a été progressivement reconnu. Le microbiote intestinal influence non seulement la biodisponibilité des médicaments administrés par voie orale, mais participe également à la biotransformation des mé...

Perspectives mécanistiques sur les mutations inactivatrices du transporteur de folate couplé aux protons (SLC46A1) et les mutations compensatoires rétablissant la fonction

Chimie, Chimie physique, Chimie pharmaceutique, Chimie computationnelle, Médecine, Sciences de la vie, Biochimie, Génétique,
Transporteur de folate couplé aux protons   Mutations inactivatrices   Restauration fonctionnelle   Simulation de dynamique moléculaire   Malabsorption héréditaire de folate  

Contexte de la recherche et problématique L’absorption maladive héréditaire de la folate (Hereditary Folate Malabsorption, HFM) est une maladie génétique rare à transmission autosomique récessive, caractérisée par un déficit d’absorption de la folate au niveau de l’intestin et une obstruction du transport de la folate dans le liquide céphalorachidi...