Appariement de modèles amortis des conformations moléculaires à partir d’images de cryomicroscopie électronique à l’aide de l’inférence basée sur la simulation

Sciences de l'information, Intelligence artificielle, Médecine, Imagerie médicale, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie, Biophysique,
Cryo-microscopie électronique   biophysique   inférence bayésienne   modélisation moléculaire   appariement de modèles   apprentissage profond   biologie structurale  

Accélérer l’identification structurale monosubmoléculaire grâce à l’inférence par simulation — Reportage scientifique sur l’article « Amortized template matching of molecular conformations from cryoelectron microscopy images using simulation-based inference » Contexte scientifique et importance Dans les domaines de la biologie moléculaire et de la ...

DockEM : Une méthode améliorée pour le raffinement de l'amarrage protéine-ligand à l'échelle atomique exploitant les cartes de densité Cryo-EM de résolution faible à moyenne

Chimie, Chimie pharmaceutique, Chimie computationnelle, Sciences de la vie, Biochimie, Biophysique,
amarrage protéine-ligand   cryo-EM   amarrage moléculaire   criblage de médicaments   biologie structurale  

Contexte académique et motivations de la recherche Ces dernières années, le docking protéine–ligand s’est imposé comme une technologie clé pour le criblage virtuel de médicaments et le développement de nouveaux médicaments basés sur la structure. L’application à grande échelle des technologies de criblage à haut débit a certes amélioré l’efficacité...

Architecture in situ du complexe prohibitin humain

Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biophysique,
complexe prohibitin   membrane interne mitochondriale   biologie structurale   tomographie cryo-électronique   modélisation moléculaire  

Contexte académique Les mitochondries sont les centrales énergétiques des cellules, et l’intégrité de leur membrane interne (mitochondrial inner membrane, MIM) est cruciale pour les fonctions cellulaires. Les prohibitines (PHB) constituent une famille de protéines hautement conservées, comprenant deux sous-types, PHB1 et PHB2, qui jouent un rôle im...

Base structurelle de la reconnaissance du LSD psychédélique au récepteur de dopamine D1

Médecine, Pharmacie, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie, Biophysique,
psychédélique   LSD   récepteur de dopamine D1   biologie structurale   GPCR  

Base structurelle de la reconnaissance de LSD par le récepteur D1 de la dopamine Contexte de l’étude et problématique Le LSD (diéthylamide de l’acide lysergique) est un hallucinogène bien connu qui agit principalement sur divers récepteurs de neurotransmetteurs, y compris les récepteurs 5-HT (sérotonine) et les récepteurs de la dopamine, produisant...