METTL3 médie la glycolyse induite par le flux athérogène dans les cellules endothéliales

Médecine, Système cardiovasculaire, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie, Immunologie,
glycolyse   cellules endothéliales   athérosclérose   METTL3   flux   modification de l'ARN   reprogrammation métabolique  

I. Contexte de la recherche L’athérosclérose est la base pathologique principale des maladies cardiovasculaires, étroitement liée au dysfonctionnement des cellules endothéliales vasculaires (ECs). Les facteurs hémodynamiques jouent un rôle clé dans la sélectivité régionale de l’athérosclérose : la contrainte de cisaillement oscillante (OS) (comme a...

Chrombus-XMBD : un modèle de convolution graphique prédictif du génome 3D à partir des caractéristiques de la chromatine

Sciences de l'information, Informatique, Intelligence artificielle, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Génétique, Biophysique,
génome 3D   modèle de convolution graphique   caractéristiques de la chromatine   interaction à longue distance   généralisabilité du modèle  

Contexte de la recherche et importance disciplinaire Dans les cellules eucaryotes, la structure spatiale tridimensionnelle de la chromatine joue un rôle essentiel dans la régulation de l’expression génique. Grâce à des repliements complexes, la formation de boucles et des réorganisations locales, l’ADN permet à différents éléments géniques (tels qu...

Deep scSTAR : Exploiter l'apprentissage profond pour l'extraction et l'amélioration des caractéristiques associées au phénotype à partir du séquençage d'ARN unicellulaire et des données de transcriptomique spatiale

Sciences de l'information, Intelligence artificielle, Médecine, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Immunologie,
Séquençage d'ARN unicellulaire   Transcriptomique spatiale   Apprentissage profond   Caractéristiques associées au phénotype   Microenvironnement tumoral  

Ces dernières années, des technologies de pointe telles que le séquençage unicellulaire (single-cell RNA sequencing, scRNA-seq) et la transcriptomique spatiale (spatial transcriptomics, ST) ont profondément stimulé le développement des sciences de la vie et de la médecine clinique. Elles ont révélé l’hétérogénéité cellulaire et ont offert de nouvel...

Évaluation comparative des outils d'inférence des aberrations du nombre de copies à l'aide de jeux de données multi-omiques à cellule unique

Sciences de l'information, Intelligence artificielle, Médecine, Oncologie, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Génie biologique, Génétique,
Séquençage ARN unicellulaire   Aberrations du nombre de copies   Hétérogénéité tumorale   Évaluation comparative   Multi-omiques  

I. Contexte et importance de la recherche Dans les domaines de l’oncologie et de la génomique, les altérations du nombre de copies chromosomiques (Copy Number Alterations, CNAs) représentent un type de variation génétique clé qui conduit à la survenue et à la progression du cancer. Les CNAs déterminent non seulement l’hétérogénéité tumorale, mais s...

Révéler une nouvelle caractéristique du cancer par l'évaluation de l'infiltration neuronale dans le cancer

Médecine, Oncologie, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Immunologie, Génétique,
infiltration neuronale   caractéristique du cancer   microenvironnement tumoral   séquençage d'ARN monocellulaire   immunothérapie  

Le cancer, en tant que défi majeur de santé publique mondiale, possède des mécanismes de survenue et de développement complexes. Depuis longtemps, des processus comme l’immunité, l’inflammation et l’angiogenèse du microenvironnement tumoral (tumor microenvironment, TME) ont attiré une large attention, étant considérés comme des déterminants importa...

Inférer les réseaux de régulation génique à partir de données de séquençage d'ARN monocellulaire en série temporelle via des autoencodeurs récurrents causaux de Granger

Sciences de l'information, Informatique, Intelligence artificielle, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Génétique,
séquençage d'ARN monocellulaire   réseau de régulation génique   apprentissage non supervisé   causalité de Granger   autoencodeur variationnel récurrent  

1. Contexte académique et motivation de la recherche Ces dernières années, le séquençage de l’ARN à cellule unique (single-cell RNA sequencing, scRNA-seq) est devenu l’une des technologies les plus disruptives dans le domaine de la recherche scientifique et médicale, permettant aux chercheurs de capturer au niveau d’une cellule unique les subtiles ...