La protéine de liaison à l'ARN avec épissage multiple (RBPMS) favorise l'épissage du phénotype contractile dans les cellules musculaires lisses vasculaires dérivées de cellules souches embryonnaires humaines

Médecine, Système cardiovasculaire, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie,
protéine de liaison à l'ARN   cellules musculaires lisses vasculaires   épissage   cellules souches embryonnaires   phénotype contractile  

Le rôle crucial de la protéine de liaison à l’ARN RBPMS dans les cellules musculaires lisses vasculaires Contexte académique Les cellules musculaires lisses vasculaires (Vascular Smooth Muscle Cells, VSMCs) constituent les principaux éléments structurels des grandes artères. Dans les vaisseaux sanguins sains, les VSMCs possèdent un phénotype contra...

SCICONE : Appel de nombre de copies et reconstruction de l'histoire des événements à cellule unique

Sciences de l'information, Informatique, Médecine, Oncologie, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Génie biologique, Génétique,
séquençage unicellulaire   variation du nombre de copies   évolution tumorale   modèle SCICONE   séquençage à faible profondeur  

Au cours du développement des tumeurs, les altérations du nombre de copies génomiques (Copy Number Alterations, CNAs) sont un facteur clé qui influence l’hétérogénéité et l’évolution tumorales. Comprendre ces variations est essentiel pour développer des méthodes de diagnostic et de traitement personnalisées du cancer. Le séquençage unicellulaire of...

Sul-BERTGRU : Une méthode d'apprentissage profond intégrant BERT amélioré par l'entropie de l'information et GRU multidirectionnel pour la prédiction des sites de S-sulfhydration

Sciences de l'information, Intelligence artificielle, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie,
apprentissage profond   sites de S-sulfhydration   entropie de l'information   BERT   GRU multidirectionnel   modification des protéines   bioinformatique  

Contexte Les modifications post-traductionnelles des protéines (Post-Translational Modifications, PTMs) sont des mécanismes clés dans la régulation des activités cellulaires, incluant la transcription génique, la réparation de l’ADN et les interactions protéiques. Parmi ces modifications, la cystéine (Cysteine), un acide aminé rare, participe à div...

Évaluation unifiée de la polarisation des cellules immunitaires à l'échelle d'une seule cellule

Sciences de l'information, Informatique, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Immunologie,
séquençage d'ARN monocellulaire   polarisation des cellules immunitaires   induite par les cytokines   méthode computationnelle   infiltration tumorale   transcriptome   embeddings cellulaires  

Les cellules immunitaires subissent un processus de polarisation induit par les cytokines en réponse à divers stimuli, ce qui modifie leurs profils transcriptionnels et leurs états fonctionnels. Ce processus dynamique joue un rôle central dans les réponses immunitaires, tant dans la santé que dans les maladies. Cependant, il manque actuellement une...

Alignement de trajectoire de la dynamique d'expression génique

Médecine, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie, Génie biologique, Immunologie, Génétique, Microbiologie,
expression génique   transcriptomique unicellulaire   alignement de trajectoire   bioinformatique   gènes différentiellement exprimés  

Le séquençage de l’ARN monocellulaire (single-cell RNA sequencing, scRNA-seq) a fourni une résolution sans précédent pour étudier la dynamique de l’expression génique au cours du développement et de la différenciation cellulaire. Cependant, en raison de la complexité des processus biologiques, les trajectoires de développement cellulaire dans diffé...

Inhibition de l'intervention des points de contrôle cellulaires via des fibres courtes injectables pour inverser la sénescence des cellules neurales

Médecine, Neurologie, Neurochirurgie, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie, Génie biologique,
sénescence des cellules neurales   point de contrôle   fibres courtes   moelle épinière   homéostasie du génome  

Contexte Les lésions de la moelle épinière (Spinal Cord Injury, SCI) représentent un défi majeur dans le domaine médical, en particulier en ce qui concerne la récupération des fonctions neurologiques. Des études ont montré que les neurones jouent un rôle clé dans la régénération de la moelle épinière. Cependant, dans un environnement pathologique c...