基于CRISPRi的植物基因表达控制电路

基于CRISPRi的植物基因表达控制电路

学术背景:在植物生物技术领域,传统的基因操作方法侧重于通过持续表达转基因来生产所需的表型和细胞活性。然而,强大的持续启动子可能会导致基因沉默、代谢负担或对产量产生其他不良影响,从而无法充分实现转基因的潜在益处。通过合成生物学方法,构建合成基因回路有望解决这些挑战,合成基因回路通过整合多种输入信号来控制基因输出,增强对基因表达的时空控制。 作者及来源:本研究源自澳大利亚西澳大学分子科学学院的多位研究人员,包括Muhammad Adil Khan、Gabrielle Herring、Jia Yuan Zhu 等,在《Nature Biotechnology》杂志上发表,文章发表日期为接收日期:2022年7月29日,接受日期:2024年4月10日,发布日期和在线更新请查阅文章。 研究流程: 1)首...

多路复用正交基因编辑器(MOBE)系统的开发

以下是《Nature Biotechnology》上发表名为”Multiplexed Orthogonal Base Editor (MOBE) Systems Development(多路复用正交基因编辑器(MOBE)系统的开发)”的学术报告的全文: 近年来,随着基因编辑工具的快速发展,特别是CRISPR-Cas9系统的引入,使得精确修饰特定DNA序列成为可能。当前,引入单碱基变异(Single-Nucleotide Variants,SNVs)作为研究基因功能和疾病关联性的有力工具,尤其在精准医学领域显得尤为重要。现有基因编辑工具在指向性编辑方面已展现出显著效能,但在同时引入多个点突变时常遇到问题,此时需要借助多路复用编辑系统来提升效率。 Quinn T. Cowan、Sifeng Gu...

用改良核苷酸完全替代自扩增RNA,抑制干扰素反应并提高效力

引言 在新冠疫情的推动下,mRNA疫苗技术取得了显著进展,但其短半衰期和高剂量需求导致了副作用和可及性问题。为了克服这些挑战,自我扩增RNA(self-amplifying RNA, saRNA)成为了研究热点。saRNA利用来自甲病毒的RNA依赖RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase, RdRP)进行自我复制,理论上可以通过减少剂量和注射频率来提高疫苗的效力和安全性。然而,saRNA的早期研究表明,其诱导的强烈干扰素(Interferon, IFN)响应会抑制抗原表达,降低疫苗效力。本研究旨在通过完全替代改性核苷酸,抑制干扰素响应,提高saRNA的长效蛋白表达和疫苗保护效力。 研究背景 本文的研究团队来自波士顿大学,包括生物医学工程系、生物设计中心、病毒学、...

原位AAV-SB-CRISPR筛查肿瘤内浸润的原代NK细胞来识别CAR-NK疗法的基因检查点

AAV-SB-CRISPR筛查肿瘤内浸润的原代自然杀伤细胞揭示CAR-NK疗法的遗传性检查点 随着生物技术和基因编辑技术的飞速发展,对于提高自然杀伤(NK)细胞治疗癌症的临床潜力的研究愈发受到关注。尽管在临床治疗中充满潜力,但NK细胞疗法的成功受到多重限制的制约。在《Nature Biotechnology》上发表的一项最新研究中,研究人员基于原代NK细胞执行了一项体内腺相关病毒(AAV)-睡美人(Sleeping Beauty, SB)-CRISPR筛查,针对四种固态肿瘤小鼠模型的肿瘤浸润NK(TINK)细胞展开研究。与此同时,研究人员对TINK细胞进行了单细胞转录组景观的分析,并鉴定出了之前未曾探究的NK细胞亚群和差异表达的TINK基因。 雷鹏、保罗·A·雷瑙尔、贾科莫·斯费鲁扎、罗家杨...

通过选择基因驱动编程肿瘤进化以主动对抗耐药性

选择性基因驱动器编程肿瘤进化以主动对抗药物耐药性 随着肿瘤的发展,针对癌症的靶向疗法通常会因药物抵抗性的进化而失败。本研究展现了一种可重复操纵肿瘤进化以设计治疗机会的方式,即使在遗传异质性预先存在的情况下。我们开发了一种选择性基因驱动器系统,可以稳定地引入到癌细胞中,由两个基因(或开关)组成,将可诱导的适应性优势与共享的适应性成本相耦合。利用随机模型的进化动力学,我们确定了选择性基因驱动器的设计准则,并建造了可以利用多个已批准的酪氨酸激酶抑制剂选择性压力的原型,并采用了多种治疗机制,如前药催化和免疫活性诱导。我们证明选择性基因驱动器能在体外消除多种形式的遗传抗性。最终,我们展示了在小鼠实体瘤模型中,模型引导的开关激活可以有效针对预先存在的抗性。这些结果为进化引导的抗癌治疗确立了选择性基因驱动...