骨再生领域新进展：PDGFRβ标记骨膜多亚群间充质及周细胞的发现——解读《pdgfr marks distinct mesenchymal and pericyte populations within the periosteum with overlapping cellular features》 一、研究背景与科学问题 骨膜作为骨组织外层的薄层血管化组织，长期以来被认为是骨生长和修复中至关重要的细胞库。近年来，骨膜内间充质干/祖细胞（mesenchymal stem/progenitor cells, MSCs）的多样性与其在骨再生中的作用引发了广泛关注。多项研究已筛选出一系列骨膜祖细胞的表面标志物，包括CD73、CD164、PDPN、PDGFRα（platelet-derived ...

近年来，单细胞测序（single-cell RNA sequencing，scRNA-seq）与空间转录组学（spatial transcriptomics, ST）等前沿技术极大推动了生命科学与临床医学的发展。其揭示了细胞异质性，提供了疾病、发育、免疫等重大领域的全新洞见。然而，大规模单细胞数据由于技术噪声强、批次效应（batch effects）复杂、生物信号多样且杂乱，使得“准确提取与增强与表型相关的特征”成为关键挑战之一。许多传统方法虽主攻降噪、整合，却可能同时削弱乃至丢失关键的表型决策信号，限制了研究者对疾病机制与细胞间互作的深入理解。 一、研究背景与意义 单细胞表型相关特征的识别对于阐明疾病进展、免疫应答、肿瘤耐药等问题至关重要。例如，在癌症免疫治疗、个体化诊疗中，能否准确识别那...

一、研究背景及意义 在肿瘤学和基因组研究领域，染色体拷贝数异常（Copy Number Alterations, CNAs）是导致癌症发生与进展的关键遗传变异类型。CNAs不仅决定了肿瘤的异质性，而且对早期肿瘤检测、肿瘤亚克隆（subclone）演化分析、耐药机制研究等具有重要意义。传统的检测拷贝数变异的方法主要依赖单细胞DNA测序（scDNA-seq），虽分辨率高，但受限于高昂成本及测序覆盖度低，难以在大规模、通量高的实际应用中广泛开展。 随着单细胞RNA测序（single-cell RNA sequencing, scRNA-seq）技术的普及与数据积累，研究者发现，基于scRNA-seq数据在一定条件下也能够反推出潜在的基因组拷贝数变化，这大大拓展了利用已有转录组数据挖掘基因组结构变异...

癌症作为全球重大公共卫生难题，具有复杂的发生发展机制。长期以来，肿瘤微环境（tumor microenvironment，TME）的免疫、炎症、血管生成等过程被广泛关注，被视为肿瘤生物学行为的重要决定因素。近年来，癌症神经科学（cancer neuroscience）成为新兴交叉领域，发现神经系统不仅通过神经介质、递质等调控肿瘤发展，还通过神经－肿瘤细胞的直接或间接互作影响肿瘤的生长、转移与侵袭。尽管诸如“外周神经侵犯（perineural invasion, PNI）”等神经相关现象已受到关注，但系统性量化和评价“神经浸润”在肿瘤疾病中的广泛性、分子特征和临床意义仍处于初级阶段。本文报道正是基于这样的问题意识和科学背景展开，旨在深入探讨神经因素是否可作为肿瘤新标志性特征（cancer ha...

一、学术背景与研究动机 近年来，单细胞RNA测序（single-cell RNA sequencing, scRNA-seq）已成为生命科学与医学研究领域极具突破力的技术之一，使得研究者能够以单个细胞为单位，捕捉到众多细胞间转录水平的微妙差异。这项技术极大地丰富了细胞生物学，对理解细胞分化、发育和疾病发生机制具有重要意义。基于scRNA-seq数据，推断基因调控网络（gene regulatory networks, GRNs），进而揭示转录因子与靶基因间复杂的调控关系，已成为当前生物信息学和系统生物学中的关键问题之一。 然而，scRNA-seq数据本身具有高噪声、高稀疏性和“掉落事件”（dropout events）等特点，带来了极大的数据分析挑战。尤其是在分析时间序列单细胞数据（time...