METTL3 médie la glycolyse induite par le flux athérogène dans les cellules endothéliales

Médecine, Système cardiovasculaire, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie, Immunologie,
glycolyse   cellules endothéliales   athérosclérose   METTL3   flux   modification de l'ARN   reprogrammation métabolique  

I. Contexte de la recherche L’athérosclérose est la base pathologique principale des maladies cardiovasculaires, étroitement liée au dysfonctionnement des cellules endothéliales vasculaires (ECs). Les facteurs hémodynamiques jouent un rôle clé dans la sélectivité régionale de l’athérosclérose : la contrainte de cisaillement oscillante (OS) (comme a...

DeepRNA-Twist : Prédiction des angles de torsion de l'ARN guidée par un modèle de langage avec un réseau d'attention-inception

Sciences de l'information, Informatique, Intelligence artificielle, Sciences de la vie, Biochimie, Génie biologique, Biophysique,
 

I. Contexte académique et motivation de la recherche Avec le développement rapide des sciences de la vie et de la bioinformatique, l’étude de la structure et de la fonction des molécules d’ARN est devenue un domaine d’actualité. L’ARN n’est pas seulement le vecteur de l’information génétique, il joue également un rôle clé dans de nombreux processus...

Protocole de résolution de problèmes : Prédiction précise de la séparation de phase au niveau des résidus à l'aide d'incorporations de modèles de langage et de conformation de protéines

Sciences de la vie, Biochimie, Génétique, Biophysique,
séparation de phase   modèle de langage   prédiction au niveau des résidus   incorporations conformationnelles   régions intrinsèquement désordonnées  

I. Contexte académique et importance de la recherche Ces dernières années, la séparation de phase liquide-liquide des protéines (phase separation, PS), en tant que mécanisme clé de régulation des biomolécules intracellulaires, a suscité une vaste attention dans le domaine des sciences de la vie. La séparation de phase ne favorise pas seulement la f...

HSSPPI : Modélisation hiérarchique et spatiale-séquentielle pour la prédiction des sites d'interaction protéine-protéine

Sciences de l'information, Informatique, Intelligence artificielle, Sciences de la vie, Biochimie, Génie biologique, Génétique,
sites d'interaction protéine-protéine   graphe hiérarchique   forme spatiale   forme séquentielle   fusion de caractéristiques  

Introduction générale : Révéler les goulets d’étranglement et les opportunités de la prédiction des interactions protéiques Les protéines, en tant que molécules centrales de l’activité vitale, participent à presque tous les processus biologiques et fonctions cellulaires, y compris l’expression des gènes, la transcription de l’ARN, la synthèse de l’...

TopoQA : une approche basée sur l'apprentissage profond topologique pour l'évaluation de la qualité des interfaces de structures de complexes protéiques

Sciences de l'information, Informatique, Intelligence artificielle, Sciences de la vie, Biochimie, Génie biologique, Biophysique,
Évaluation de la qualité   Interface protéique   Homologie persistante   Réseau de neurones graphiques   Données topologiques  

Contexte académique L’analyse de la structure tridimensionnelle des complexes protéiques constitue un enjeu central en biologie structurale moderne, dans la recherche des mécanismes moléculaires, la conception de médicaments, voire la création de protéines artificielles. La fonction des protéines dépend le plus souvent de leur structure, et de nomb...

Identification des gènes du cancer par l'intégration d'un modèle de langage causal avec l'inférence causale basée sur les données omiques

Sciences de l'information, Intelligence artificielle, Médecine, Oncologie, Sciences de la vie, Biochimie, Génétique,
gènes du cancer   causalité   modèle de langage   multi-omique   apprentissage causal  

L’identification précise des gènes du cancer constitue une difficulté centrale dans la recherche fondamentale du cancer et dans le domaine de la médecine de précision. Récemment, une équipe de recherche de l’Université du Jilin et de l’Université des Sciences et Technologies du Zhejiang a publié dans la revue Briefings in Bioinformatics un article ...