高スループットな原位対逐次シーケンスによる細胞内解像度での空間マルチオミクス

高スループットな原位対逐次シーケンスによる細胞内解像度での空間マルチオミクス

サブセル解像度の空間多オミクスハイスループットインシチュペアシーケンシング 研究背景と目的 生物医学研究の進展に伴い、多オミクス技術は細胞機能や疾患メカニズムの理解においてますます注目されています。しかし、現在の多くのインシチュシーケンシング法は一種類の生体分子の空間情報の解読に限られ、多種の生体分子(例えば、DNA、RNA、タンパク質、小分子)の同時検出には課題が残っています。さらに、4n(4は4種類の蛍光染料、nはシーケンシングまたはハイブリダイゼーションの回数)デコード能力の制約により、ハイスループット空間オミクスはコストと検出効率の面でまだ改良の余地があります。この問題を解決するために、本論文では新しいハイスループットターゲットインシチュシーケンシング法である多オミクスインシチュペア...

空間の豊富化とゲノム解析によりNOMO1が筋萎縮性側索硬化症と関連していることが明らかになりました

空間の豊富化とゲノム解析によりNOMO1が筋萎縮性側索硬化症と関連していることが明らかになりました

空間富集とゲノム分析が明らかにするNOMO1と筋萎縮性側索硬化症の関連性 序論 運動ニューロン病(ALS)は、脳と脊髄の運動ニューロンが徐々に失われる深刻な神経変性疾患です。大多数の孤発性ALS患者において、その遺伝的素因は未だ確定していませんが、TDP-43蛋白病理学は多数のALS患者(> 97%)の主要な特徴です。さらに、ALSと関連する25以上の遺伝子が報告されているにもかかわらず、約90%の孤発性ALS患者は既知の変異で説明することができません。既存の研究は、脳組織構造の複雑性が細胞間相互作用、生物学的機能および病理学の基礎であることを示しており、細胞タイプと領域の脆弱性を理解することが精密医療において極めて重要です。 研究の背景と目的 本研究の目的は、ALS関連遺伝子が脳の特定の領...

遺伝子がアルツハイマー病のリスクに影響を与える機構:晩期の構造的脳形態の変調

近年、アルツハイマー病(AD)は全世界の高齢者集団に影響を与える主要な健康問題になっています。その関連する神経病理学的変化は��臨床症状が発現する何十年も前から始まることができます。ADの危険性と脳の形態との関係をより広範に探るため、研究チームは二重サンプルメンデルランダム化(Two-Sample Mendelian Randomisation, MR)研究を行い、遺伝的な敏感性が脳構造に影響を与え、ADの危険性を増加させるかどうかを調査しました。 研究背景 ADの病理学的変化は、通常はまず内側側頭葉で始まり、その後、前頭葉、頂葉、側頭葉新皮質、および皮質下領域へと広がっていきます。病気が臨床的に診断される20年前から、脳内β-アミロイド蛋白の蓄積が可能になります。したがって、疾患���臨床...

統合的な分子および空間分析が、その場および浸潤性肢端メラノーマの進化動態と腫瘍-免疫相互作用を明らかにする

統合的な分子および空間分析が、その場および浸潤性肢端メラノーマの進化動態と腫瘍-免疫相互作用を明らかにする

分子および空間分析の統合が原位および侵襲性の末端黒色腫の進化力学と腫瘍-免疫相互作用を明らかにする 論文の学術的背景 黒色腫は皮膚がんの一種であり、その中でも末端黒色腫(Acral Melanoma, AM)は手掌、足底、爪下などの非暴露部位に発生し、アジア人に特に多く見られます。しかし、このタイプの黒色腫は進行が遅く診断されることが多く、そのため予後が非常に悪いです。末端黒色腫(AM)の早期発見と予防は患者の予後を大幅に改善することができます。近年、浸潤性末端黒色腫(Invasive Acral Melanoma, IAM)のゲノム特性に関する研究は多く行われていますが、早期原位末端黒色腫(Acral Melanoma In Situ, AMIS)に関する理解はまだ非常に限られています。そ...

臨床およびゲノムベースの意思決定支援システムを用いた骨髄異形成症候群患者における同種造血幹細胞移植の最適なタイミングの定義

臨床およびゲノムベースの意思決定支援システムを用いた骨髄異形成症候群患者における同種造血幹細胞移植の最適なタイミングの定義

背景紹介 骨髄異形成症候群(Myelodysplastic Syndromes、MDS)は、骨髄造血幹細胞に由来する異質性疾患の一群で、血球の生成が減少するのが特徴です。近年の治療の進展にもかかわらず、全合致同種造血幹細胞移植(Allogeneic Hematopoietic Stem-Cell Transplantation, HSCT)がMDSを潜在的に治癒し得る唯一の方法です。しかし、移植操作には無視できない罹患率および死亡率が伴うことが多いため、患者の正確な選択が重要です。伝統的には、臨床での決定は修訂版国際予後スコアリングシステム(Revised International Prognostic Scoring System, IPSS-R)に基づいています。このシステムは臨床特性...

新規診断IDH野生型グリオブラストーマの分子サブグループにおける切除範囲の閾値

新規診断IDH野生型グリオブラストーマの分子サブグループにおける切除範囲の閾値

IDH野生型神経膠腫における異なる分子サブタイプの手術切除度の閾値に関する研究 はじめに 神経膠腫(glioblastoma、GBM)は成人における最も一般的な悪性脳腫瘍です。手術切除、放射線療法、化学療法が現在の標準的治療法ですが、GBMの予後は依然として非常に悪く、中央生存期間は約15ヶ月に過ぎません。ますます多くの研究が、腫瘍切除度がGBM患者の予後に影響を与える重要な因子の1つであることを示しています。しかしながら、従来の研究はIDH遺伝子ステータスとMGMTメチル化ステータスに焦点を当ててきましたが、他の分子生物学的サブタイプと切除度との関係は無視されてきました。 研究デザイン 本研究では、138例のIDH野生型の新規GBM患者を対象としました。半自動ソフトウェアを使用して術前・術...