基于外周血单核细胞DNA甲基化的早期肺腺癌诊断新方法 背景介绍 肺腺癌（Lung Adenocarcinoma, LUAD）是全球癌症相关死亡的主要原因之一，占肺癌病例的约40%。尽管近年来肺腺癌的治疗取得了显著进展，但其预后仍然不佳，主要原因之一是早期诊断的困难。大多数患者在首次就诊时已进入晚期，导致治疗效果不佳。目前，低剂量计算机断层扫描（Low-Dose Computed Tomography, LDCT）是早期肺腺癌筛查的常用工具，但其假阳性率高达96.4%，且现有的血清生物标志物（如CEA）在早期肺腺癌诊断中的敏感性和特异性较低。因此，开发一种非侵入性、高效的早期肺腺癌诊断方法具有重要意义。 DNA甲基化（DNA Methylation）是一种常见的表观遗传修饰，在基因表达的调控中...

胶质母细胞瘤的表观遗传多样性 学术背景 胶质母细胞瘤（Glioblastoma）是最常见的原发性恶性脑肿瘤，尽管经过数十年的研究，其预后仍然极差，诊断后的平均生存期仅为14个月。胶质母细胞瘤的显著异质性是其治疗进展缓慢的主要原因之一。这种异质性不仅体现在肿瘤内部（即同一肿瘤内不同细胞和分子群体的多样性），还体现在不同患者之间的肿瘤差异。传统上，这种患者间的异质性主要归因于不同患者中发生的遗传事件。然而，越来越多的研究表明，表观遗传调控（epigenetic regulation）在胶质母细胞瘤的生物学中扮演着重要角色，并且显著影响了肿瘤的异质性。 表观遗传调控是指在不改变DNA序列的情况下，通过DNA甲基化（DNA methylation）、染色质重塑（chromatin remodelin...

Dppa4基因在垂体神经内分泌肿瘤中的致癌作用 学术背景 垂体神经内分泌肿瘤（Pituitary Neuroendocrine Tumors, PitNETs）是一种常见的颅内肿瘤，通常具有激素分泌功能，是导致人类性腺功能减退和不孕的重要原因之一。尽管大多数PitNETs可以通过手术和药物治疗得到控制，但部分肿瘤表现出对治疗的不敏感性或复发，甚至表现出侵袭性行为，如周围组织的广泛浸润或远处转移。目前，PitNETs的侵袭性机制尚不明确，尤其是肿瘤干细胞在其中的作用尚未得到充分研究。 近年来，研究表明，肿瘤干细胞可能在PitNETs的侵袭性和耐药性中发挥重要作用。胚胎干细胞调控基因Dppa4（Developmental Pluripotency-Associated 4）在某些癌症中过度表达，...

全基因组范围甲基化研究揭示PTSD相关的新DNA甲基化位点：23个军民队列的Meta分析 学术背景及研究目标 创伤后应激障碍（Posttraumatic Stress Disorder, PTSD）是一种严重的精神疾病，通常发生在个人经历极端创伤事件后。PTSD的症状包括侵入性记忆、对触发记忆情境的回避或情感麻木，以及持续的高警觉反应，这些特征可能显著影响心理与生理健康。PTSD已被证明与慢性疾病风险增加相关，如心血管疾病等，这与其患者自我保健水平较低、药物依从性差及更高的物质使用率有关。 尽管大多数人遭遇过创伤事件，但只有少数发展为PTSD，这表明遗传和环境因素对PTSD的发生具有重要作用。以往的全基因组关联研究（Genome-Wide Association Studies, GWAS）...

棉花种群水平DNA甲基化多态性研究揭示表观基因组对复杂性状的贡献 背景与研究动机 在过去几十年中，基因组和基因多样性通过全基因组关联研究（GWAS）被广泛研究，为理解作物性状变异提供了理论基础。然而，DNA甲基化等表观遗传修饰在调控作物性状方面的作用依旧相对不明确。DNA甲基化，是一种重要的表观遗传标记，通过在胞嘧啶（Cytosine）上加上甲基基团，调控基因表达、维持基因组稳定性，并在多种作物的农艺性状中起关键作用。研究发现，基因组甲基化水平的多态性与生态适应性状有关，但在自然作物种群中，表观遗传变异对作物性状的贡献仍然需要更深入的探索。 基于此需求，来自浙江大学和阿里巴巴集团等研究机构的科学家们开展了一项系统的研究，首次在207个棉花品种中生成了高质量的甲基组、转录组和基因组数据，扩展了...