392,522人の男性における前立腺特異抗原レベルのゲノムワイド関連研究により、新しい遺伝子座が同定され、祖先グループ間での予測が改善される

多民族全ゲノム関連研究が前立腺特異抗原レベルの新ロケウスを特定し、血統間の予測を改善 研究背景と問題提起 前立腺特異抗原(Prostate-Specific Antigen, PSA)は前立腺によって分泌されるタンパク質であり、そのレベルは通常前立腺がんのスクリーニングに使用されます。しかし、PSAレベルは前立腺がんだけでなく、良性前立腺肥大、局所的な炎症や感染症、前立腺体積、年齢、および遺伝的要因にも影響を受けます。したがって、PSAスクリーニングは1994年にアメリカ食品医薬品局(FDA)によって前立腺がんスクリーニングに承認されましたが、その過剰診断や治療による害が前立腺がん特異的死亡率の低下に与える利点が議論されています。 研究によると、スクリーニングで検出された前立腺がんの約20%...

プロトン共役葉酸トランスポーター (SLC46A1) の不活性化変異と機能回復を伴う補償変異の機序的洞察

研究背景と問題提起 遺伝性葉酸吸収不良 (Hereditary Folate Malabsorption, HFM) は、腸管での葉酸の吸収障害および脳脊髄液中での葉酸輸送の阻害を主な特徴とする希少な常染色体劣性遺伝病です。この疾患は、プロトン結合葉酸輸送体(Proton-Coupled Folate Transporter, PCFT-SLC46A1)をコードする遺伝子に機能喪失変異が生じることで引き起こされます。これらの変異がPCFTの構造と機能に及ぼす影響を理解することは、HFMの病理メカニズムを解明するために極めて重要です。 近年、鶏由来PCFT(Gallus Gallus PCFT, GPCFT)の高解像度構造が冷凍電子顕微鏡技術によって取得され、これは人間のPCFT(Human ...

大規模全ゲノムシーケンス研究における多形質レアバリアント分析の統計的フレームワーク

多重性状罕见変異分析の新フレームワーク:Multistaar 研究背景と問題の説明 次世代シークエンシング技術の進歩と全ゲノムシークエンシング(Whole-Genome Sequencing, WGS)コストの低下により、研究者たちは希少変異が複雑な人間の特性に与える影響をより深く探求できるようになりました。しかし、単一性状分析方法は、多民族サンプルや複雑な遺伝的構造を対象とした希少変異関連の検出において十分な統計的効力に欠けています。さらに、多くの遺伝的変異は多重効果(pleiotropy)を持ち、つまり1つの遺伝子が複数の性状に影響を与えるため、複数の性状を同時に解析する方法が必要となります。 既存の多重性状希少変異分析方法は、単一性状分析よりも高い統計的効力を示していますが、大規模WG...

汗腺炎の全組織外植モデルの炎症的景観

研究背景 隠蔽性毛包炎の研究現状と課題 隠蔽性毛包炎(Hidradenitis Suppurativa, HS)は、比較的一般的で高度に病態化する炎症性皮膚疾患です。世界中でおよそ1%の人口が影響を受け、特に女性とマーガイナライズされたグループにおいてより一般的です。HSの病理メカニズムは複雑であり、遺伝、免疫、内分泌、環境などの要素が関与しています。具体的なリスク要因には肥満、喫煙、家族歴などが含まれます。 HSの主な特徴は、病変部位に嚢胞と線維化が出現することであり、患者の生活品質に深刻な影響を与え、炎症性腸疾患や心理障害などの複数の共病を伴います。さらに、HS患者の5年生存率は他の炎症性皮膚疾患患者よりも高いです。TNF-α阻害剤アダリムマブなどの特定のサイトカインに対する生物療法がH...

薬剤耐性結核患者のQT間隔評価のための時間変動補正因子の開発と検証

発展と検証:耐性結核患者のQT間隔評価に用いる時間変動補正係数 学術的背景と研究動機 活動性結核(Tuberculosis, TB)の治療中、患者はしばしば頻脈(Tachycardia)を示し、この現象は病状が回復するにつれて弱まります。心拍数(Heart Rate, HR)の上昇はQT間隔(QT Interval)の測定結果に影響を与え、標準的な補正係数(Correction Factors, CFs)、例えばフリデリシア公式(Fridericia’s formula, QTcf)を使用すると、QT延長(QT Prolongation)の正確な評価に影響を与える可能性があります。Oliveroらは未治療の結核患者向けの補正係数を提案しましたが、これらの定数補正係数は治療期間中のQTとHRの...