大规模血浆蛋白组学揭示阿尔茨海默病的诊断生物标志物和通路

一、研究背景与学术意义 阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)作为全球范围内老年痴呆症发病率最高的类型,约占全部痴呆症患者的60%—80%。其主要发病群体为65岁以上人群,特征性病理改变包括淀粉样蛋白β(amyloid-β)斑块的沉积、神经纤维缠结以及广泛的神经元丧失。虽然近年来神经影像、脑脊液检测及基因组学为AD的研究带来诸多进展,但AD的早期诊断与疾病进程的客观监测仍受限于侵入性检测方式(如脑脊液穿刺或脑部PET成像)以及有限的生物标志物储备。血浆由于采集简便、患者依从性高,被视为未来AD无创诊断与动态监测的理想基体。但既往基于血浆的蛋白质组学研究样本量普遍较小,且检出蛋白数有限,掣肘了血浆生物标志物的系统性发现和验证。 此前的多项学者研究(如Walker等人、S...

单细胞ATAC-Seq数据的基因集合评分算法基准测试

基因集合评分工具对单细胞ATAC-seq数据的基准测试 作者: Xi Wang, Qiwei Lian, Haoyu Dong, Shuo Xu, Yaru Su, Xiaohui Wu 单位: Pasteurien College(苏州大学苏州医学院),厦门大学自动化系,福州大学数学与计算机科学学院 通讯作者: xhwu@suda.edu.cn 期刊: 《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》 发布日期: 2024年2月9日(在线公布) 导论 转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)是一种强大且常用的表观基因组技术,通过测序分析全基因组范围内的染色质可及性。近来,单细胞ATAC-seq(scATAC-seq)技术使得研究单细胞中的染色质可及性成为可能,...