在线与线下结合的神经信息学教育:Neurohackademy的经验教训

Neurohackademy:线上与线下结合的神经信息学教育 背景介绍 近年来,人类神经科学进入了一个大数据时代,由于人类连接组计划(Human Connectome Project)、青少年脑认知发育(ABCD)研究等项目科学家们获取了以前难以想象的规模和范围的数据集。这些数据集对于基础和临床研究都有重要的科学潜力。然而,这些数据集也给研究人员带来了各种新的挑战,包括生成、处理、访问、分析和理解这些数据的挑战。其中一个主要挑战是所谓的“大数据技能差距”:使用这些数据集的研究项目需要不同的知识基础和技能集,以及不同于传统小规模实验研究的技术和概念工具。 研究及文章来源 该研究由Ariel Rokem 和 Noah C. Benson共同完成,均为华盛顿大学 eScience Institut...

肿瘤大小不是一切:推动影像组学作为肿瘤学药物开发和临床护理的精准医学标志物

在当今的肿瘤学临床实践和药物开发领域,对肿瘤反应的评估方法正处于革新的边缘。自1981年世界卫生组织(WHO)提出用于评估抗癌药物效果的肿瘤反应分类标准以来,这一领域经历了多次改进。最为人们熟知的,是1995年成立的响应评估标准在实体瘤(RECIST)工作组。该工作组通过与加拿大国家癌症研究所、美国国家癌症研究所以及欧洲癌症研究和治疗组织的合作,建立了基于大量病例数据的循证推荐,推动了RECIST 1.0和1.1版本的发布,这些版本在确定客观响应率等影像学终点方面发挥了重要作用。 然而,随着对肿瘤生物学更深入的理解和诊疗策略的不断演进,传统的依赖大小和数量变化的评估方法显示出其局限性,这就需要新的方法来填补这一空缺。为此,RECIST工作组于2022年5月组织了一次多学科工作坊,聚焦于探讨放...

人工智能辅助的PD-L1肿瘤比例评分在非小细胞肺癌中预测免疫检查点抑制剂响应的临床验证

PD-L1肿瘤比例评分在非小细胞肺癌免疫检查点抑制剂响应预测中的人工智能解读临床验证 在肿瘤治疗和诊断领域,PD-L1(Programmed Death-Ligand 1)肿瘤比例评分(TPS)的评估是一项至关重要的工作,特别是在针对非小细胞肺癌(NSCLC)的免疫检查点抑制剂(ICI)治疗反应预测方面。然而,由病理学家评估PD-L1 TPS受主客观因素的限制,如内观察者/间观察者偏差以及肿瘤内异质性等问题。最近的研究表明,应用人工智能(AI)技术为病理图像提供量化的生物标记物评估能力,预示着AI在病理学诊断中的应用前景。 由首尔国立大学仁川医院的Hyojin Kim博士、Seokhwi Kim博士以及其他作者共同进行的这项研究成果发表在2024年5月9日的《JCO Precision On...

用于脑肿瘤切除的基于机器学习的定量高光谱图像引导

用于脑肿瘤切除的基于机器学习的定量高光谱图像引导

机器学习辅助的定量高光谱成像在脑肿瘤切除中的指导作用研究 背景介绍 恶性胶质瘤的完全切除一直受到肿瘤细胞在浸润区难以区分的挑战。这项研究的背景是:在神经外科手术中,通过使用5-氨基乙酰丙酸(5-aminolevulinic acid,简称5-ALA),可以实现原卟啉IX(protoporphyrin IX,简称PPIX)的荧光引导,从而提高肿瘤的切除率。然而,即使在光谱成像的帮助下,许多低级别胶质瘤和一些高级别肿瘤由于PPIX的低积累,显示出较弱的荧光,这使得肿瘤更难区分。因此,了解不同类别肿瘤组织中的PPIX发射光谱,以及如何利用这些光谱进行分类,具有重要意义。 论文来源 这篇论文发表于《Communications Medicine》期刊(2024年),文章标题为“Towards mac...

基于深度学习的高效自监督对比学习在超声心动图自动诊断中的应用

深度学习在超声心动图自动化诊断中的新突破:对比自监督学习方法的研究报告 研究背景 随着人工智能和机器学习技术的快速发展,它们在医学影像诊断领域发挥着越来越重要的作用。特别地,自监督学习(Self-Supervised Learning, SSL)在处理标签数据稀缺的问题上展示出了显著的效果,这在获取医学影像标签困难和昂贵的情况下具有重要意义。通常,大多数的自监督学习方法都没有针对包含丰富时间信息的视频影像,如超声心动图,进行特别适配和优化。因此,开发出一种针对超声心动图视频的自监督对比学习方法,以提升在小型标签数据集上的自动化医学影像诊断性能,显得尤为迫切和重要。 研究来源 此研究由Gregory Holste、Evangelos K. Oikonomou、Bobak J. Mortazav...

利用大型语言模型评估社交媒体上对胰高血糖素样肽-1受体激动剂的公众看法

在全球范围内,肥胖的流行趋势不断上升,给公共卫生带来了重大的影响。肥胖独立地与心血管疾病的发病率和死亡率相关联,估计每年将为卫生系统带来超过2000亿美元的经济负担。近年来,胰高血糖素样肽-1(GLP-1)受体激动剂因其在体重减轻和心血管风险降低中独立于糖尿病的作用而成为改变实践的治疗方案。在这一背景下,史丹福大学的Sulaiman Somani、Sneha S. Jain、Ashish Sarraju、Alexander T. Sandhu、Tina Hernandez-Boussard和Fatima Rodriguez等人展开了一项关于GLP-1受体激动剂在社交媒体上公众认知的研究,并在《Communications Medicine》2024年发布了他们的研究成果。 该研究采用了大型语...