生物启发的协同氢解反应在晚期氘代和氚代中的应用

学术背景 氢解反应(hydrogenolysis)是一种通过分子氢的加入来断裂化学键的基础化学反应,广泛应用于生物质、石油等原料的升级转化为高价值化学品和燃料。此外,氢解反应在制药和精细化工行业中也是合成复杂分子结构的关键工具。然而,传统的氢解反应通常依赖于高温高压条件下的多相催化,其选择性有限。近年来,均相催化作为一种有潜力的替代方法,在较温和的条件下提供了更高的选择性。尽管如此,针对碳-卤键(C-X键)的均相氢解反应,尤其是氚代(tritiation)和氘代(deuteration)反应,仍然是一个未解决的挑战。氚代反应在药物研发中尤为重要,因为它可以提供关于药物及其代谢物药代动力学的关键信息。然而,现有的氚代方法主要局限于芳香族系统或与杂原子相邻的位置,而对于更为丰富且易得的烷基氯化物...

靶向ADAR1的小分子治疗前列腺癌的研究

学术背景 前列腺癌(Prostate Cancer, PCA)是男性中最常见的恶性肿瘤之一,尤其是在西方国家,它是导致男性癌症相关死亡的第二大原因。尽管雄激素信号疗法在初期对前列腺癌治疗有效,但大多数患者最终会复发,且目前尚无根治方法。因此,寻找新的治疗靶点和药物成为当前研究的重点。RNA编辑酶ADAR1(Adenosine Deaminase Acting on RNA 1)在多种癌症中被发现具有促癌作用,但其在前列腺癌中的具体功能和潜在的治疗价值尚未被充分探索。本研究旨在揭示ADAR1在前列腺癌中的关键作用,并开发一种有效的小分子抑制剂,为前列腺癌治疗提供新的策略。 论文来源 本论文由Xiao Wang、Jiaxing Li、Yasheng Zhu等来自中国药科大学、明尼苏达大学、马萨诸...

神经降压素受体1的β-arrestin偏向性激动分子机制研究

学术背景 G蛋白偶联受体(GPCRs)是人体细胞表面最丰富的受体家族,也是FDA批准药物中最常见的靶点。GPCRs在疼痛、糖尿病、心血管疾病和癌症等多种疾病的治疗中发挥着重要作用。然而,GPCRs的药物开发面临诸多挑战,尤其是受体亚型选择性和控制靶向及非靶向副作用的问题。传统的正构配体(orthosteric ligands)往往难以解决这些问题,因此,开发作用于正构口袋外的变构调节剂(allosteric modulators)成为一种有前景的策略。变构调节剂可以选择性地增强或抑制内源性配体的信号传导,同时提供优异的受体亚型选择性。 近年来,一类被称为偏向性变构调节剂(biased allosteric modulators, BAMs)的分子引起了广泛关注。BAMs不仅具有变构调节功能,...

GutBugDB:预测人类肠道微生物介导的生物和异生物分子生物转化的网络资源

近年来,人类肠道微生物群(Human Gut Microbiota, HGM)在药物和营养素代谢中的重要作用逐渐被认识到。肠道微生物群不仅影响口服药物的生物利用度,还通过其代谢酶参与药物和生物活性分子的生物转化(biotransformation),从而影响药物的药代动力学和药效学特性。然而,由于肠道微生物群的复杂性和个体间的差异性,确定特定微生物对药物和营养素代谢的具体贡献仍然是一个巨大的挑战。为了解决这一问题,研究人员开发了GutBugDB,这是一个开放获取的数字资源库,旨在预测人类肠道微生物群介导的生物和异生物质(xenobiotic)分子的生物转化。 论文来源 该研究由Usha Longwani、Ashok K. Sharma、Aditya S. Malwe、Shubham K. J...

SP-DTI:基于亚口袋信息的Transformer模型用于药物-靶点相互作用预测

学术背景 药物-靶点相互作用(Drug-Target Interaction, DTI)预测是药物发现中的关键环节,能够显著降低实验筛选的成本和时间。然而,尽管深度学习技术已经提升了DTI预测的准确性,现有方法仍面临两大挑战:泛化能力不足和亚口袋级相互作用的忽视。首先,现有模型在未见过的蛋白质和跨域设置下性能显著下降;其次,当前的分子关系学习往往忽略了亚口袋级别的相互作用,而这些相互作用对于理解结合位点的细节至关重要。为了解决这些问题,研究人员提出了一种名为SP-DTI的新型模型,通过引入亚口袋分析和预训练语言模型,提升了DTI预测的准确性和泛化能力。 论文来源 这篇论文由Sizhe Liu、Yuchen Liu、Haofeng Xu、Jun Xia和Stan Z. Li共同撰写。他们分别来...