高グレード胃腸膵腫瘍の包括的ゲノムおよびトランスクリプトーム特性評価

高グレード胃腸膵腫瘍の包括的ゲノムおよびトランスクリプトーム特性評価

高度胃腸膵神経内分泌腫瘍の総合的な遺伝子および転写組特性の研究報告 研究の背景 高度胃腸膵神経内分泌腫瘍(high-grade gastro-entero-pancreatic neuroendocrine neoplasms, HG GEP-NENs)は、神経内分泌分化の特徴を持つ異質性のある悪性腫瘍である。WHO 2019 [1]および2022 [2]基準によると、GEP-NENsは現在、神経内分泌腫瘍(NETs)、神経内分泌癌(NECs)、および混合型非神経内分泌-神経内分泌腫瘍の三種類に分類されている。国際臨床ガイドライン[3, 4]では、GEP-NET G3とGEP-NECsを包括的な概念としてHG GEP-NENsとして認めているが、GEP-NET G3とGEP-NECsの予後お...

全自動マルチモーダルMRIベースのマルチタスク学習によるグリオーマセグメンテーションとIDHジェノタイピング

全自動マルチモーダルMRIベースのマルチタスク学習によるグリオーマセグメンテーションとIDHジェノタイピング

全自動マルチモーダルMRI多タスク学習によるグリオーマ分割とIDH遺伝子分類の研究報告 研究背景 グリオーマは中枢神経系で最も一般的な原発性脳腫瘍で、世界保健機関(WHO)2016年分類によると、グリオーマは低悪性度グリオーマ(LGG、グレードIIおよびIII)と高悪性度グリオーマ(HGG、グレードIV)に分類されます。イソクエン酸デヒドロゲナーゼ(Isocitrate Dehydrogenase, IDH)変異の状態はグリオーマにおける最も重要な予後指標の一つです。臨床研究では、IDH変異を持つ低悪性度グリオーマ患者の予後は通常、野生型患者よりも良好であることがわかっています。従来のグリオーマの手動セグメンテーションは時間と労力を要するもので、正確なIDH遺伝子分類と正確なグリオーマ分割は...

グリオブラストーマ患者の総生存時間予測のための画像表現型と遺伝子型のディープラーニング

グリオブラストーマ患者の総生存時間予測のための画像表現型と遺伝子型のディープラーニング

世界的に見て、悪性脳腫瘍の中で最も一般的で致命的なのは膠芽腫(Glioblastoma, GBM)です。近年、機械学習技術を通じて術前の単一モダリティまたは多モダリティの画像表現型に基づいてGBM患者の総生存時間(Overall Survival, OS)を予測しようとする研究が続けられています。これらの機械学習方法は予測において一定の進展を遂げましたが、多くの研究では放射線学に基づくOS予測方法に含まれる腫瘍の遺伝子型情報を考慮しておらず、この情報は予後に強い指示作用を持っています。この問題を解決するために、Tang Zhenyu、Xu Yuyun、Jin Lei などの研究者が2020年6月に《IEEE Transactions on Medical Imaging》に「Deep Lea...

CHD2は小児神経膠腫における神経-膠芽腫相互作用を調節する

CHD2調節小児膠腫における神経元-膠腫相互作用に関する研究報告 背景紹介 高グレード膠腫(High-grade gliomas, HGG)は成人および小児患者にとって致命的な疾患です。近年の研究により、神経活動が多様な高グレード膠腫サブグループの進展を促進することが示されています。しかし、このプロセスを調節するエピジェネティックなメカニズムは未解明のままです。本文では、新たなエピジェネティック調節メカニズムであるChromodomain Helicase DNA-binding Protein 2(CHD2)が、腫瘍関連H3.1K27M変異を特徴とするびまん性中線膠腫(Diffuse Midline Glioma, DMG)において、神経元-膠腫相互作用を調節する役割について報告します。 ...

セントジュードサバイバーシップポータル:小児がん生存者からの大規模な臨床およびゲノムデータセットの共有と分析

セントジュードサバイバーシップポータル:小児がん生存者からの大規模な臨床およびゲノムデータセットの共有と分析

St. Jude Survivorship Portal: 小児癌サバイバーの大規模臨床およびゲノムデータの分析と共有 研究背景 アメリカにおいて、小児癌の5年生存率は1970年代の約60%から今日の85%以上に上昇しました。生存率が著しく向上したにもかかわらず、これらの小児癌サバイバーは癌及びその治療に起因する様々な健康リスクに直面しています。これらのリスクには、早期死亡、器官機能障害、新たな腫瘍、不良な社会経済的結果、心理社会的課題、及び全体的な生活の質の低下が含まれます。これらの問題に対処するため、主要な研究はその潜在的な原因、関連リスク、および最も感受性の高い患者亜群を特定することに焦点を当てています。 これに関連する大規模縦断研究として、St. Jude Lifetime Coho...

インシリコ飽和変異原性によるクローン造血ドライバーミューテーションの同定

引言 健康な造血過程では、一群の造血幹細胞(Hematopoietic Stem Cells、略してHSC)が血液関連のすべての系統に貢献します。しかし、年齢が上がるにつれて、この過程はしばしばクローン性造血(Clonal Hematopoiesis、略してCH)を引き起こし、特定のHSCクローンの拡張により多くの血細胞や血小板が占められます。このクローン拡張現象は、生命過程でHSCが獲得する体細胞変異によって駆動され、高齢者において高度に一般的です。CHに関連する遺伝子変異はHSCに成長の優位性を与え、造血過程で正の選択を受けます(1-13)。近年、多くの研究がCHが血液悪性腫瘍の発症、心血管疾患、全死因死亡率、実体腫瘍、および感染症のリスク増加と関連していることを示しています(2, 7,...