AlphaFoldを用いた阻害性タンパク質フラグメントのハイスループット発見

高精度で蛋白フラグメントの抑制活性を予測する新方法:FragFoldの応用 学術背景 蛋白質間相互作用は細胞生命活動において重要な役割を果たし、ペプチド(peptides)や蛋白フラグメント(protein fragments)は特定の蛋白質界面に結合して、蛋白質機能を調節したり、甚至抑制剤として機能したりします。近年、高スループット実験技術の発展により、生細胞中での大量の蛋白フラグメントの抑制活性を測定することが可能になりました。しかし、これまで計算方法が存在せず、どの蛋白フラグメントが目標蛋白質と結合し、抑制作用を発揮するか、さらにはその結合モードを予測することはできませんでした。この研究領域の空白を埋めるために、研究者は新しい計算ツールを開発しました。 AlphaFoldの登場は蛋白質...

ω-3脂肪酸が2型糖尿病患者の高中性脂肪血症、リピドミクス、および腸内マイクロバイオームに与える影響

Omega-3脂肪酸対2型糖尿病患者の脂質および腸内細菌叢への影響に関する研究 背景紹介 2型糖尿病(Type 2 Diabetes, T2D)は、世界中で一般的な代謝疾患であり、高トリグリセライド血症(Hypertriglyceridemia, HTG)などの脂質異常を伴うことが多い。脂質異常は心血管疾患(Cardiovascular Disease, CVD)の重要なリスク要因であり、特に高トリグリセライド(Triglycerides, TG)レベルは心血管イベントの発生と密接に関連しています。ステアチン系薬剤がコレステロール制御において著しい効果を示しているものの、高トリグリセライド血症は依然として解決すべき臨床的な問題です。 オメガ-3脂肪酸、特に魚油に豊富に含まれるエイコサペンタエ...

GNAO1脳症の亜鉛治療:臨床前プロファイリングと臨床例

GNAO1(Gタンパク質αサブユニットO1)遺伝子の突然変異は、重度の小児脳症の主要な原因の一つと考えられています。この脳症は通常、てんかん、運動障害、発達遅延、知的障害などの症状を示し、既存の治療法では効果が限定的です。GNAO1遺伝子がコードするGαOタンパク質は、神経細胞のシグナル伝達に重要な役割を果たしており、その突然変異によりシグナル伝達に異常が生じ、一連の神経系疾患を引き起こします。これまでの研究では、亜鉛塩(zinc salts)がGNAO1突然変異タンパク質の機能異常を部分的に矯正できることが示されていますが、その具体的な作用メカニズムや臨床応用の安全性は十分に検証されていません。 本稿では、系統的な前臨床研究と初の人間試験を通じて、亜鉛塩がGNAO1関連脳症の治療における有...

G-四重鎖はエネルギー地形を再形成することでタンパク質の折りたたみを触媒する

G-四重鎖が蛋白質折りたたみを触媒する研究報告 学術的背景 蛋白質の折りたたみは、生物体内で複雑かつ未解決の問題である。多くの蛋白質はin vitro(体外)での折りたたみ速度が非常に遅く、生理条件での許容範囲をはるかに超えている。この課題に対処するために、ATP(アデノシン三リン酸)依存の分子シャペロン(chaperonins)が蛋白質の折りたたみを加速し、生理的に許容される時間内に完了すると考えられている。しかし、この能力がATP依存のシャペロンにのみ限られるかどうかは未解明である。本研究の核心は、他の分子がATP依存のシャペロンと同様に蛋白質の折りたたみを触媒し、細胞がより短時間で蛋白質の折りたたみを完了するのを助けるかどうかを探索することである。 G-四重鎖(G-quadruplex...

タリンABSSとF-アクチン相互作用の生化学的および構造的基盤

学術的背景 細胞生物学において、フォーカルアデヘッション(focal adhesions, FAs)は細胞と細胞外基質(ECM)の間の重要な接続点であり、インテグリン受容体を介して細胞内のアクチン骨格とつながり、細胞移動や極性化に重要な役割を果たします。Talinはフォーカルアデヘッションの中心的なタンパク質で、インテグリン受容体とアクチン骨格を直接つなぎます。Talinタンパク質には3つのアクチン結合部位(actin-binding sites, ABSs)があり、これらの部位はフォーカルアデヘッションの形成と成熟の過程で異なる役割を果たします。しかし、TalinがどのようにF-アクチンと相互作用するのか、特にTalinのABSsがF-アクチンにどのように結合するのかについては、まだ完全に...

天然条件下でのγD-クリスタリンにおける部分未折りのN末端ドメイン構造

人γD-晶状体蛋白変異体が天然条件下で部分的に展開した中間体を形成する研究 学術背景 人γD-晶状体蛋白(γD-crystallin)は、眼の水晶体において構造的な役割を果たすタンパク質であり、水晶体の透明性と安定性を維持するために重要です。このタンパク質は、生涯を通じて折り畳まれた状態を保つ必要があり、これが維持されないと凝集やタンパク質沈殿が発生し、白内障の原因となります。しかし、先天性白内障と関連付けられたいくつかのγD-晶状体蛋白変異体は、天然条件下で部分的に展開した中間体を形成することが知られており、これはタンパク質の凝集と白内障の形成につながる可能性があります。これらの変異体のエネルギー風景(energy landscape)とその白内障形成における役割をよりよく理解するために、...