浅い勾配における持続的な仮足分裂は有効な走化性戦略である

学術的背景 走化性(chemotaxis)は、細胞や微生物が化学勾配に沿って方向性を持って移動する重要な行動であり、免疫反応、創傷治癒、病原体感染などの生理的プロセスで重要な役割を果たします。しかし、細胞が複雑な勾配環境で最適な運動モード(例えば偽足分裂やde novo形成)をどのように選択するかはまだ不明です。従来のモデルでは、細胞はグローバルな勾配感知(global gradient sensing)によってナビゲーションを行うと仮定されていましたが、このメカニズムは浅い勾配(shallow gradients)や動的な環境では非効率である可能性があります。 本研究は、アメーバ様細胞(例えば*Dictyostelium discoideum*)の偽足(pseudopod)ダイナミクスに焦...

イントロンRNA構造によるデノボ小分子認識の分子洞察

学術的背景 RNAは遺伝情報のキャリアおよび機能分子として長らく「創薬不可能」なターゲットと見なされてきた。近年、RNA構造生物学の理解が深まるにつれ、科学者らはRNAを標的とする低分子薬の開発を探求し始めた。しかし、この分野には三大核心的課題が存在する:(1)体系的なRNA-リガンド認識原理の不足;(2)大型RNA-低分子複合体の高分解能構造解析の困難;(3)機能性RNAリガンドのスクリーニング手法の限界。 本研究は真菌病原体に広く存在するgroup I intron(I型イントロン)という特殊なRNA構造を対象に、ハイスループットスクリーニング、薬剤化学、クライオ電子顕微鏡技術を統合し、大型触媒RNAに対するデノボリガンド設計と高分解能構造解析を初めて実現した。本成果はRNA標的薬開発に...

ユビキチン非依存的なMidnolin-プロテアソーム経路の構造的洞察

学術的背景 タンパク質恒常性(プロテオスタシス)は細胞の正常な機能維持の中核的メカニズムであり、ユビキチン-プロテアソームシステム(Ubiquitin-Proteasome System, UPS)は異常タンパク質の約80%を分解する役割を担っている。従来の認識では、タンパク質はユビキチン化標識を必要とすると考えられてきた。しかし近年の研究で、EGR1やFOSBなどの転写因子がユビキチン化に依存せず直接分解される現象が発見され、これがリンパ球の発生や悪性腫瘍と密接に関連することが明らかとなった。特にMidnolinタンパク質はこの過程を仲介する鍵因子として同定されたが、その構造的基盤と分子メカニズムは長らく不明であった。 本研究はUT Southwestern Medical Centerの...

環状ペプチド阻害剤が分子接着剤としてGq/11ヘテロ三量体を安定化する機能

学術的背景 Gタンパク質共役型受容体(GPCRs)はヒト体内で最大の膜タンパク質ファミリーであり、異質三量体Gタンパク質(Gα、Gβγサブユニットで構成)を介して細胞外シグナルを伝達する。Gタンパク質は分子スイッチとして機能し、その活性状態はGTP/GDPサイクルによって調節される: - 不活性状態:GαがGDPと結合し、Gβγと安定な複合体を形成 - 活性状態:GPCRがGDP放出を促進した後、GαがGTPと結合し、Gβγから解離 長年、Gタンパク質シグナルを特異的に阻害するツールは不足していた。天然環状ペプチドFR900359(FR)とYM-254890(YM)はGq/11サブファミリーを効率的に阻害するが、その分子メカニズムは完全には解明されていなかった。従来の見解では、これらはGαの...

マイクロバイオームの多様性におけるクロスフィーディングの転換点

学術的背景 微生物群集(microbiome)は地球上で最も多様性に富んだ生態系の一つであり、数百種類の機能的な微生物群集が複雑な資源交換ネットワークを通じて相互作用しています。しかし、長年未解決の核心的な疑問は、この驚異的な多様性がどのように種間の代謝相互作用によって維持されているかということです。特に、クロスフィーディング(cross-feeding)——微生物が代謝副産物を相互に供給するメカニズム——が主要な駆動因子と考えられていますが、そのネットワーク構造が群集の安定性に与える影響は未解明でした。 従来の生態学理論(例えばMayの複雑性-安定性理論)では、微生物群集の高い多様性維持メカニズムを説明することが困難でした。さらに、微生物培養実験でよく見られる「自然の多様性の大部分が実験室...