单细胞RNA测序揭示外周血中细胞类型特异性剪接调控与自身免疫及炎症性疾病的关系 背景介绍 近年来，基因组研究的飞速发展带来了对复杂性状遗传基础的更深入认识。然而，对于大多数与复杂疾病相关的基因组关联位点（GWAS loci），它们的功能机制仍未完全解明。这些位点大多位于非编码基因组区域，而非直接编码蛋白质的区域。因此，理解转录后事件，例如选择性剪接（alternative splicing, AS），如何影响基因表达以及复杂疾病的遗传风险，显得至关重要。选择性剪接是调控基因功能和生成基因表达多样性的关键机制，而其在特定细胞类型和遗传背景中的作用目前研究较少。 此外，大规模的单细胞RNA测序（single-cell RNA sequencing, scRNA-seq）技术为无偏地检测单细胞层面...

探索宫颈腺癌的流行病学、诊断与治疗挑战及发病机制 学术背景 宫颈癌是全球女性健康的重要威胁之一，其发病率在发展中国家尤为突出。宫颈癌的主要组织学类型包括鳞状细胞癌（Squamous Cell Carcinoma, SCC）和宫颈腺癌（Cervical Adenocarcinoma, CA），其中CA的发病率虽然较低，但其侵袭性强、复发率高、预后较差，且早期诊断率低，给临床管理带来了巨大挑战。近年来，尽管宫颈癌的整体发病率有所下降，但CA的发病率却相对上升，尤其是在高收入国家。此外，CA与SCC在发病机制、肿瘤异质性和肿瘤免疫微环境（Tumor Immune Microenvironment, TME）等方面存在显著差异，但目前对这些差异的理解仍较为有限。 为了应对这些挑战，Shuhui Li...

基于单细胞RNA测序和Bulk RNA测序的食管鳞状细胞癌预后预测模型研究 研究背景 食管鳞状细胞癌（Esophageal Squamous Cell Carcinoma, ESCC）是全球范围内常见的恶性肿瘤之一，尤其在东亚地区发病率较高。尽管现有的治疗手段包括手术、内镜切除和放化疗等，但患者的预后仍然较差，5年生存率仅为21%。免疫检查点抑制剂等新型疗法仅对20%-30%的患者有效，这表明我们对ESCC的分子机制，尤其是肿瘤微环境（Tumor Microenvironment, TME）的理解仍然不足。葡萄糖代谢异常是ESCC早期的重要特征之一，肿瘤细胞即使在氧气充足的情况下也会进行糖酵解，产生大量乳酸，影响微环境的酸性，进而促进肿瘤生长、血管生成和免疫抑制。因此，深入研究葡萄糖代谢与E...

Ewing肉瘤免疫治疗新靶点的发现 背景介绍 Ewing肉瘤（Ewing’s sarcoma, EWS）是一种常见的儿童骨癌，占儿童癌症的约2%。尽管近年来免疫检查点抑制剂（ICIs）和CAR-T细胞疗法在多种癌症中取得了显著进展，但在Ewing肉瘤中的治疗效果却不尽如人意。Ewing肉瘤的生存率较低，尤其是那些在诊断时已发生转移或对化疗反应不佳的患者，其总体生存率低于30%。因此，寻找新的治疗靶点以改善Ewing肉瘤的治疗效果成为当务之急。 Ewing肉瘤的特征是涉及FET家族基因和ETS家族转录因子（TFs）的基因融合，其中EWSR1-FLI1基因融合在85%的病例中出现。这种基因融合不仅驱动肿瘤的发生，还通过复杂的肿瘤免疫微环境（TIME）影响免疫治疗的效果。因此，深入解析Ewing肉...

脑膜孤立性纤维瘤的单细胞与空间转录组学研究 学术背景 脑膜孤立性纤维瘤（Meningeal Solitary Fibrous Tumors, SFTs）是一种罕见的间叶性肿瘤，起源于中枢神经系统（CNS）的脑膜。尽管SFTs在组织学上与其他脑膜肿瘤（如脑膜瘤）相似，但其独特的临床行为，尤其是局部复发和血行转移的倾向，使得其生物学机制和治疗策略备受关注。目前，SFTs的治疗手段有限，主要依赖手术和放疗，且对于转移性或对标准治疗耐药的SFTs，尚无有效的药物治疗方案。因此，深入了解SFTs的细胞状态和空间转录组结构，对于开发新的治疗靶点具有重要意义。 近年来，单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学技术的快速发展，为研究肿瘤的细胞异质性和微环境提供了新的工具。然而，针对SFTs的单细...