急性髓系白血病（AML）是成人中最常见的白血病类型。尽管大多数AML患者在接受标准化疗后能够达到完全缓解，但难治性和复发性疾病仍然是一个严峻的问题。过去十年中，免疫疗法在癌症治疗中得到了广泛应用，尤其是嵌合抗原受体T细胞（CAR-T）疗法在治疗血液系统恶性肿瘤，特别是B细胞恶性肿瘤方面取得了显著成功。然而，CAR-T细胞疗法在AML中的应用效果相对有限，其中一个主要限制因素是CAR-T细胞的耗竭（exhaustion）。CAR-T细胞耗竭被认为是影响其疗效的主要因素之一，如何减轻耗竭、维持CAR-T细胞的效应功能和持久性，从而实现持久的临床疗效，是当前的核心挑战。 T细胞在体内发挥保护作用，负责清除识别的抗原。然而，在某些情况下，T细胞的功能可能会受到耗竭的抑制。T细胞耗竭可能由多种因素引起...
单细胞分析揭示老年与年轻小鼠前列腺的差异 学术背景 前列腺是男性生殖系统的重要组成部分，随着年龄的增长，前列腺会发生增生，可能导致尿道受压，进而引发排尿功能障碍及相关症状，并增加前列腺癌的风险。尽管前列腺老化的重要性不言而喻，但其分子机制尚未完全阐明。单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术为揭示细胞异质性和衰老过程中的基因表达变化提供了强有力的工具。尽管已有大量关于前列腺的单细胞研究，但这些研究尚未系统地应用于小鼠前列腺老化的表征。由于获取无疾病的人类前列腺组织较为困难，小鼠作为与人类具有遗传和生理相似性的模式生物，为研究衰老机制提供了替代方案。 论文来源 该研究由Yang Li、Yuhong Ding等来自华中科技大学同济医学院附属同济医院的研究团队完成，并于2024年发表在《Biom...
学术背景 糖尿病是一种全球性的健康问题，影响着超过5亿人。无论是1型糖尿病（T1D）还是2型糖尿病（T2D），其共同特征是功能性胰岛素分泌的β细胞数量显著减少。因此，恢复或增加β细胞数量被认为是治疗糖尿病的关键策略之一。目前，尽管通过胰腺移植、胰岛移植或干细胞衍生的β细胞移植等方法取得了一定进展，但这些方法成本高、供体稀缺，且难以大规模应用。因此，开发能够促进内源性β细胞再生的药物成为了研究热点。 近年来，研究发现小分子药物如DYRK1A抑制剂（如哈明碱）能够促进β细胞增殖，并增强其分化和功能。然而，这些药物在体内促进β细胞再生的具体机制尚不明确。本文通过单细胞RNA测序技术，研究了DYRK1A抑制剂对胰岛细胞的影响，特别是α细胞向β细胞转分化的可能性。 论文来源 本文由Esra Karak...
肺腺癌中凋亡小体清除特性及其预后与免疫治疗的关联研究 背景与研究动机 肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因，其中肺腺癌（Lung Adenocarcinoma，LUAD）是最常见的组织学亚型。由于疾病的隐匿性和缺乏特异性，大多数肺癌患者确诊时已处于晚期，传统治疗方式（如手术、放疗和化疗）的疗效有限，患者总体生存率较低。近年来，免疫治疗尤其是免疫检查点抑制剂（Immune Checkpoint Inhibitors，ICIs）为非小细胞肺癌（NSCLC）患者带来了希望，但其疗效仍受限于肿瘤微环境（Tumor Microenvironment，TME）的免疫抑制作用。 凋亡小体清除（Efferocytosis，ER）是由吞噬细胞清除凋亡细胞的生物过程，在肿瘤进展中起关键作用。研究表明，ER促进肿瘤免...
2024年发表在《Cancer Cell International》上的《Machine Learning and Single-cell RNA Sequencing Reveal Relationship Between Intratumor CD8+ T Cells and Uveal Melanoma Metastasis》的学术报告 研究背景及目的 葡萄膜黑色素瘤（Uveal Melanoma, UM）是成人最常见的眼内恶性肿瘤。在接受放射治疗或手术治疗后，原发性UM的局部复发率较低。然而，约40%的患者在治疗后会出现远端转移，特别是在肝脏，导致高达50%的死亡率（4至5年内）。当前，针对UM转移风险的评估主要依赖多基因模型，这些模型多采用机器学习方法，基于基因表达谱（Gene ...
探索人类和牛类早期胚胎中X染色体上XIST的沉默和抑制因子 研究背景 X染色体失活是哺乳动物中的一种剂量补偿机制，其目的是在雌性和雄性个体之间平衡X染色体上基因的表达量。XIST基因位点能够触发附加X染色体的转录沉默，使其成为不活动的X。然而，如何保护每个细胞中一个活动X染色体免受自身XIST基因位点失活的影响，在所有哺乳动物中仍未完全阐明。先前有关常染色体重复的研究表明，在人类染色体19短臂上可能存在抑制活动X上XIST的基因。 为了验证这一假设，研究者们分析了使用单细胞RNA测序数据得出的人类胚胎和牛胚胎中的候选基因的转录时间。研究结果确认了在两性胚胎中XIST是从未来活动X表达，且在多能性因子上调期间，即人和牛胚胎的4-8个细胞和团球期间，在两性胚胎中的XIST位点都被抑制。这些数据支...
单细胞RNA测序揭示出血性脑卒中后脑周水肿免疫景观的演变 研究背景 脑出血性中风(ICH)是全球健康威胁之一，以其高残疾率和死亡率而闻名。ICH所导致的次生脑损伤中，围血肿水肿(PHE)的形成是其致命性的重要因素。然而，PHE的具体病理生理机制尚不完全清楚。本研究目的在于详细描绘人类PHE组织中的免疫细胞群体的转录概况，并探索不同类型免疫细胞在显微层面的差异。 论文来源 论文由张鹏、高丛等共同撰写，由Daojing Li负责通讯，论文来自Jining Medical University附属医院。该论文发表于2024年的Journal of Neuroinflammation，DOI为10.1186/s12974-024-03113-8。 研究方法及流程 该研究共纳入9名基底节ICH患者，根...
研究背景 本研究围绕晚发性低睾酮血症（LOH）展开，致力于揭示与年龄相关的睾丸功能偏差，例如LOH的机制尚未完全理解。研究采用单细胞RNA测序技术，对患有LOH的人类睾丸进行分析，确定了支持细胞（SCs）作为睾丸微环境中的关键代谢协调员。研究发现老年SCs中的溶酶体酸度降低，导致自噬和吞噬通路受损，SCs积累了代谢物，包括胆固醇，并且炎症基因表达上升，因此将这些细胞称为发生病理转变的SCs。通过饮食诱导的高脂肪压力能够在小鼠中重现LOH特征。显著的是，研究通过药物干预涉及SCs的efferent ductular注射和系统性TRPML1激动剂管理，恢复了溶酶体功能，从而在高脂饮食诱导的LOH小鼠中纠正了睾酮缺陷和相关异常。这一发现强调了SCs在睾丸衰老中的中心作用，并提出了LOH的有希望的治...
关于人类卵巢老化时空转录组变化及FOXP1调控作用的研究报告 学术背景 随着全球人均寿命的不断增加，女性在更年期面临的健康问题愈发受到关注。卵巢老化是其中一项重要问题，与骨质疏松、心血管疾病、肥胖、肿瘤、阿尔茨海默病及糖尿病等多种健康问题密切相关。为了探索延缓卵巢老化的治疗策略，需要全面了解卵巢的细胞组成、分子特性及其时空变化。然而，目前对于人类卵巢老化如何影响细胞和分子层面的理解仍然有限。本研究通过整合单细胞RNA测序（single-cell RNA sequencing，简称 scRNA-seq）和空间转录组学（spatial transcriptomics，简称ST-seq），系统地表征了人类卵巢老化过程中八种细胞类型的时空分子特征。 论文来源 该研究发表在2024年4月9日的《Nat...
引言 脊索瘤是一种罕见且局部侵袭性强的间叶源性肿瘤,被认为起源于原始脊索的残余组织。脊索瘤的发病率约为每百万人中有0.8例,好发于骶骨和颅底区域。目前,最佳治疗方案是尽可能的手术切除后辅以放射治疗。但由于肿瘤具有浸润性生长特点且常邻近重要的神经血管结构,彻底切除存在一定困难。因此,很多患者术后常发生局部复发甚至远处转移,预后较差。鉴于此,阐明脊索瘤的分子生物学特征,从而开发更有效的治疗方法十分必要。 研究背景 脊索瘤组织中显著的基质丰富特征可能与其发展进展密切相关。之前的回顾性研究表明,肿瘤-基质比值与脊索瘤的侵袭性表型、抑制性免疫微环境及不良预后呈正相关。作为基质细胞的主要组分,肿瘤相关成纤维细胞(CAF)在肿瘤微环境中扮演重要角色。然而,CAF对脊索瘤生物学行为的影响尚未阐明。 单细胞R...