基于多组学数据的肺癌脑转移代谢脆弱性研究

肺癌脑转移的多组学整合分析揭示代谢脆弱性作为新型治疗靶点 学术背景 肺癌是全球范围内发病率和死亡率最高的癌症之一,尤其是肺癌脑转移(Lung Cancer Brain Metastases, LC-BMs)是肺癌患者常见的并发症,且预后极差。尽管近年来肺癌的治疗手段有所进步,但针对脑转移的标准治疗方案仍然有限,疗效不佳。因此,深入理解肺癌脑转移的分子机制和肿瘤微环境,对于开发新的治疗策略至关重要。 肺癌脑转移的发生机制复杂,涉及基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等多个层面的变化。近年来,随着多组学技术的发展,研究人员能够从多个维度全面解析肿瘤的分子特征,从而为精准治疗提供新的思路。然而,目前关于肺癌脑转移的多组学研究仍然较少,尤其是针对原发肺癌与脑转移病灶的配对分析更为稀缺。因此,本研究旨在通...

基因组医学中的CRISPR引导序列再注释:EXORCISE算法的应用与验证

基因组医学中的CRISPR引导序列再注释:EXORCISE算法的应用与验证 学术背景 CRISPR-Cas9技术自问世以来,彻底改变了基因筛选领域,尤其是在研究基因必需性和化学-遗传相互作用方面。通过设计针对特定基因的引导RNA(guide RNA, gRNA),CRISPR-Cas9系统能够在细胞中引入精确的基因敲除,从而帮助研究人员理解基因功能及其在疾病中的作用。然而,CRISPR库的设计通常基于参考基因组,而实际研究的细胞系(尤其是癌症细胞系)往往存在基因组变异,这可能导致CRISPR引导序列的错配或偏差,进而影响实验结果的准确性。 为了解决这一问题,Simon Lam等人开发了一种名为EXORCISE(Exome-Guided Re-annotation of Nucleotide ...

基于长读长测序的多重耐药微生物基因组监测

基于长读长测序的多重耐药微生物基因组监测研究 学术背景 多重耐药微生物(Multidrug-Resistant Organisms, MDROs)是全球公共卫生的重大威胁。这些微生物对多种抗生素产生耐药性,导致感染难以治疗,增加了医疗负担。为了有效监测和控制MDROs的传播,准确识别其耐药基因、分子类型变化以及传播路径至关重要。传统的分子分型方法,如脉冲场凝胶电泳(Pulsed-Field Gel Electrophoresis, PFGE)和多位点序列分型(Multi-Locus Sequence Typing, MLST),虽然在过去发挥了重要作用,但其分辨率较低、操作复杂且成本高昂。近年来,基于全基因组测序(Whole-Genome Sequencing, WGS)的方法逐渐成为主流,...

CD30对生发中心B细胞动态及IgG1转换B细胞扩展的影响

CD30对生发中心B细胞动态及IgG1转换B细胞扩展的影响 背景介绍 CD30(也称为TNFRSF8)是肿瘤坏死因子受体(TNF-R)超家族的成员之一,最初被认为是霍奇金淋巴瘤的标志物。然而,随后的研究发现,CD30也表达在其他淋巴瘤(如弥漫性大B细胞淋巴瘤和原发性渗出性淋巴瘤)以及活化的B细胞和T细胞表面。在生理条件下,表达CD30的B细胞数量非常少,主要存在于生发中心(GC)或非GC表型的B细胞中,且通常位于GC内部或边缘。 CD30通过与CD30配体(CD30-L,也称为CD153)的相互作用激活,CD30-L由活化的T细胞等细胞表达。CD30和CD30-L以三聚体结构相互作用,进而招募TNF-R相关因子(TRAF)并激活NF-κB、MAPK和JAK/STAT等信号通路。然而,CD30...

结核病中kynurenine-AHR通过抑制STAT1-CXCL9/CXCL10轴减少T细胞浸润并诱导延迟的T细胞免疫反应

结核病(Tuberculosis, TB)是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis, Mtb)引起的一种全球性健康问题,每年导致数百万人感染和死亡。尽管现代医学在结核病的诊断和治疗方面取得了显著进展,但Mtb的免疫逃逸机制仍然是其能够在宿主体内长期存活并引发慢性感染的关键原因之一。Mtb通过延迟宿主T细胞的免疫反应,尤其是T细胞向感染部位的招募,从而逃避宿主的免疫清除。这种延迟的T细胞反应被认为是Mtb建立其生态位并逃避免疫系统攻击的主要策略之一。 在结核感染过程中,适应性免疫反应,特别是CD4+ T细胞和CD8+ T细胞的作用至关重要。CD4+ T细胞通过分泌干扰素-γ(IFN-γ)激活巨噬细胞,增强其杀菌能力,而CD8+ T细胞则可以直接杀死被感染的细胞,减...