识别UK Biobank中与自杀未遂相关的行为和生理风险因素

研究背景: 自杀是全球性的公共卫生挑战,但关于行为因素和生理因素与自杀企图(suicide attempts,SA)之间的关系仍然存在很大的不确定性。以往的研究往往集中于有限的假设因素,如精神疾病(如抑郁症)、个性和心理特征(如绝望感)以及社会和家庭因素(如低社会支持和生活压力)。这样的狭隘视角可能导致其他风险因素被忽视。为了填补这些研究空白,本研究团队开展了大规模的种系统分析和孟德尔随机化分析,以确定英国生物银行数据集中可能与SA相关的行为和生理风险因素。 研究来源: 此论文由以下研究人员撰写:Bei Zhang、Jia You、Edmund T. Rolls、Xiang Wang、Jujiao Kang、Yuzhu Li、Ruohan Zhang、Wei Zhang、Huifu Wang...

双向表观遗传编辑揭示基因调控层次

双向表观遗传编辑揭示基因调控的层次结构 背景和研究动机 在人类基因组中,非编码元件如增强子(enhancer)在基因调控中的作用已被广泛认知。然而,目前常用的CRISPR干扰方法在研究非编码元件和遗传相互作用方面仍存在一些局限性。主要是因为传统的CRISPR方法,如CRISPR干扰(CRISPRi)和CRISPR激活(CRISPRa),仅能一次性进行单个位点的编辑。这限制了研究人员对基因调控网络中相互作用的深入理解。因此,本研究致力于开发一种可以双向编辑表观遗传特性的系统,以解决这些问题。 来源和作者信息 这篇题为”Bidirectional Epigenetic Editing Reveals Hierarchies in Gene Regulation”的研究论文,发表于《Nature ...

UK Biobank的原则性提炼揭示了人类变异的潜在结构

在本报告中,我们详细评估了一篇刊登于Nature Human Behaviour杂志的科研论文,标题为《原则性提炼英国生物库表型数据揭示人类变异的潜在结构》。该研究由Caitlin E. Carey、Rebecca Shafee、Robbee Wedow等负责,在线发表时间为XX年XX月XX日,出处为https://doi.org/10.1038/s41562-024-01909-5。 研究背景和意义 随着公共和私人对大规模数据收集和整合的投资,近年来出现了称为生物库的数据仓库,将健康成果与成千上万个个体的生物样品关联起来。生物库包含丰富而详细的从电子健康记录(EHR)、自报调查措施、实验室检验和体力及认知评估中提取的数千个变量。尽管这些庞大的资源现在推动了人类健康和疾病的发现,但数据的广度...

多路复用正交基因编辑器(MOBE)系统的开发

以下是《Nature Biotechnology》上发表名为”Multiplexed Orthogonal Base Editor (MOBE) Systems Development(多路复用正交基因编辑器(MOBE)系统的开发)”的学术报告的全文: 近年来,随着基因编辑工具的快速发展,特别是CRISPR-Cas9系统的引入,使得精确修饰特定DNA序列成为可能。当前,引入单碱基变异(Single-Nucleotide Variants,SNVs)作为研究基因功能和疾病关联性的有力工具,尤其在精准医学领域显得尤为重要。现有基因编辑工具在指向性编辑方面已展现出显著效能,但在同时引入多个点突变时常遇到问题,此时需要借助多路复用编辑系统来提升效率。 Quinn T. Cowan、Sifeng Gu...

绘制老年人额叶皮层中具有医学相关性的RNA异构体多样性图谱

学术背景 RNA选择性剪接(RNA isoforms)在基因表达调控中扮演着至关重要的角色。人类蛋白质编码基因平均含有超过八个RNA选择性剪接,这导致了近四种独特的蛋白质编码序列。传统的短读长测序技术由于其在读数长度上的限制,无法准确地组装和定量RNA选择性剪接,这大大简化了基础生物学的理解。越来越多的研究表明,同一基因体的不同选择性剪接在蛋白水平上具有独特的互作网络。尤其是,有研究表明同一基因体的某些选择性剪接在细胞内可以发挥完全不同甚至相反的功能。例如bcl-x基因,其中bcl-xl具有抗凋亡功能,而bcl-xs则具有促凋亡功能。这样看来,明确个体RNA选择性剪接的功能对于理解疾病机制以及开发新的治疗方法至关重要。 研究来源 本研究由多名来自不同机构的科学家共同完成,其中包括Bernar...

用改良核苷酸完全替代自扩增RNA,抑制干扰素反应并提高效力

引言 在新冠疫情的推动下,mRNA疫苗技术取得了显著进展,但其短半衰期和高剂量需求导致了副作用和可及性问题。为了克服这些挑战,自我扩增RNA(self-amplifying RNA, saRNA)成为了研究热点。saRNA利用来自甲病毒的RNA依赖RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase, RdRP)进行自我复制,理论上可以通过减少剂量和注射频率来提高疫苗的效力和安全性。然而,saRNA的早期研究表明,其诱导的强烈干扰素(Interferon, IFN)响应会抑制抗原表达,降低疫苗效力。本研究旨在通过完全替代改性核苷酸,抑制干扰素响应,提高saRNA的长效蛋白表达和疫苗保护效力。 研究背景 本文的研究团队来自波士顿大学,包括生物医学工程系、生物设计中心、病毒学、...