硅橡胶在电痕化导致下的表面结构变化

研究揭示硅橡胶电气跟踪降解机制的前沿科学新闻 背景介绍:研究动机及问题 随着电力传输和配电系统的快速发展,高分子复合绝缘子已逐渐取代传统玻璃和陶瓷绝缘子,成为户外高压输电领域中的首选材料。这其中,基于硅橡胶的复合绝缘子因其重量轻、耐热性高、化学稳定性佳及疏水性能(hydrophobicity)的优秀表现,备受工程界的青睐。它们不仅在生产安装过程中具有较高的性价比,同时也能在长期运行中表现出优越的抗老化特性。然而,这些绝缘材料在实际的运行条件下会因受电气和环境应力(例如高电压、多变的天气因素、盐雾腐蚀等)的影响而逐渐退化,最终可能导致设备的失效甚至电网故障。因此,深入了解硅橡胶材料的退化机制,研究其材料结构随退化发生的重要变化,具有重要的科学意义和应用价值。 为了应对这一问题,本文研究基于实际...

跨九种模态的生物医学对象联合分割、检测和识别的基础模型

解码生物医学图像分析的未来:多模态联合分割、检测和识别的基础模型 背景介绍 在生物医学研究中,图像分析已成为推动生物医学发现的重要工具,能够跨越从亚细胞器到器官层面的多尺度研究。然而,传统的生物医学图像分析方法大多将分割(segmentation)、检测(detection)和识别(recognition)作为独立的任务分别处理,这种割裂式的方法不仅限制了任务间交互的信息共享,也增加了处理复杂多样的生物医学图像数据的难度。 例如,传统的分割方法通常依赖人工指定的边界框(bounding box)来标注感兴趣目标的区域,这对形状不规则或数量庞大的目标(如病理全片图像中的所有细胞)来说是具有挑战性的。此外,忽略目标检测和语义识别(metadata-like semantic informatio...

EvoAI实现蛋白质序列空间的极端压缩与重建

蛋白序列空间的极端压缩与重建:EvoAI的突破性研究 背景介绍 蛋白质的设计和优化已经成为生物技术、医学和合成生物学领域中的核心挑战之一。蛋白质的功能由其序列和结构决定,但这一功能性的序列空间(sequence space)非常复杂且高维,包含极大量的可能性。探索这一领域的关键性问题在于如何有效地解析和压缩这片几乎无穷大的序列空间,进而识别与功能密切相关的特征。以往的方法包括直接进化(directed evolution)、深度突变扫描(deep mutational scanning, DMS)、位点饱和突变(site-saturation mutagenesis)等实验策略,虽为揭示基因型与表型的关系提供了重要的见解,但在序列空间覆盖范围、准确性和高维分析能力方面受到显著限制。而计算方法...

评估大型语言模型在基因集功能发现中的应用

基于大语言模型探索基因集合功能发现:GPT-4的表现优异 学术背景 在功能基因组学(functional genomics)领域,基因集合富集分析(gene set enrichment analysis)是理解基因功能及其相关生物学过程的重要方法。然而,当前的富集分析主要依赖于文献整理的基因功能数据库,例如Gene Ontology (GO)等,这些数据库存在一定的局限性:数据不完整且更新速度有限。这导致了许多基因集合无法通过传统工具有效解析,这些未曾被明确标注的基因集合正是潜在产生重要生物学新见解的源泉。 在这种背景下,近年来生成式人工智能(generative artificial intelligence),尤其是诸如GPT-4的“大语言模型”(large language mode...

使用自监督深度学习解决冷冻电镜中的偏好取向问题

克服单粒子冷冻电镜中的优选取向问题:深度学习的创新解法 背景介绍 近年来,单粒子冷冻电子显微镜(Single-Particle Cryo-EM)技术因其能够解析生物大分子在接近天然状态下的原子分辨率结构,已成为结构生物学领域的核心技术。然而,在实际应用中,研究者一直面临一个棘手的技术瓶颈,即“优选取向”(Preferred Orientation)问题。这一问题主要由于生物分子在冷冻电镜网格上分布不均,导致在某些方向上的数据采样不足。这种取向偏差通常是由样品制备过程中分子与空气-水界面(Air-Water Interface, AWI)或支撑膜-水界面的相互作用引起的。 优选取向问题在三维重构中显得尤为突出,因为它带来的各向异性(Anisotropy)会使三维结构受损,甚至失真,具体表现为二...

多尺度足迹揭示顺式调控元件在细胞分化和衰老过程的作用

多尺度足迹揭示顺式调控元件在细胞分化和衰老过程的作用 背景介绍 基因表达的调控是细胞命运和疾病发生的关键机制之一,而顺式调控元件(cis-regulatory elements, CREs)在这一过程中扮演了重要角色。CREs通过结合多种效应蛋白(如转录因子和核小体)来动态调控基因的表达。然而,现有的研究方法在测量这些效应蛋白在基因组范围内的结合动态时存在局限性,尤其是在单细胞水平上。这导致我们难以全面理解CREs的结构如何与其功能相关联,尤其是在细胞分化和衰老过程中。 为了解决这一问题,来自Broad Institute of MIT and Harvard、Harvard University等机构的研究团队开发了一种名为PRINT的计算方法,能够从染色质可及性数据中识别DNA-蛋白质相...