AIFM1变异导致线粒体功能障碍及核黄素缺乏不耐受

AIFM1基因错义变异导致线粒体功能障碍与核黄素缺乏不耐受 研究背景 线粒体是具双膜结构的细胞器,存在于有核真核细胞中,主要通过氧化磷酸化产生三磷酸腺苷(ATP)来提供细胞能量。线粒体拥有自己的基因组,编码着参与线粒体呼吸链复合物的13种蛋白质,其他线粒体蛋白则由核基因组编码并被导入到线粒体。其中,凋亡诱导因子(Apoptosis-Inducing Factor, AIFM1)是一种由X连锁AIFM1基因编码的线粒体黄素蛋白,参与无胱天蛋白酶的细胞死亡,并调控呼吸链复合物的生物合成。 研究表明,AIFM1基因的突变与多种临床表型相关,但核黄素(即维生素B2)治疗的效果仍存在争议。本研究旨在探索AIFM1基因c.1019T > C变异导致线粒体功能障碍的机制,并评估核黄素补充对该变异的影响。 ...

欧洲参考网络中罕见神经疾病的NGS质量保证

质量保证在未来高级测序诊断中的应用 背景介绍 过去十年中,下一代测序(Next-Generation Sequencing,NGS)在诊断稀有神经病(Rare Neurological Diseases,RND)领域取得了革命性进展。然而,技术、解释和报告标准的缺乏给确保全球一致和高质量的诊断带来了挑战。为了应对这一问题,欧洲稀有神经疾病参考网络(European Reference Network for Rare Neurological Diseases,ERN-RND)与欧洲分子遗传学质量网络(European Molecular Genetics Quality Network,EMQN)合作,建立了一个基于NGS的外部质量评估方案用于RNDs的诊断。 在21世纪,NGS方法逐渐成...

基于下一代测序的乳腺癌聚合风险评分位点基因分型局限性

基于下一代测序的乳腺癌聚合风险评分位点基因分型局限性 背景介绍 在遗传性乳腺癌(Breast Cancer, BC)的预测中,多基因风险评分(Polygenic Risk Scores, PRSs)正在日益广泛地应用,作为个体风险预测的一个重要工具。PRS的计算依赖于精确再现变异等位基因频率(Allele Frequencies, AFs),从而准确地预测PRSS的值。然而,目前使用下一代测序技术(Next-Generation Sequencing, NGS)进行多基因风险评分基因型分析时,存在不少技术上的限制。本研究的背景在于这些技术挑战,对改进和优化乳腺癌风险评估模型具有重要意义。 研究来源及作者背景 本研究由来自德国遗传性乳腺癌和卵巢癌联盟(German Consortium for...

利用计算方法增强PAX6基因错义变异的解释

通过计算方法提高对PAX6基因错义变异的解释 背景介绍 PAX6基因是一种高度保守的转录因子,在眼睛发育中起着重要作用。PAX6的杂合失功能变异可导致一系列眼科疾病,包括无虹膜症。然而,许多PAX6基因的错义变异目前被分类为不确定意义的变异(VUS),这对分子诊断提出了重大挑战。虽然计算工具可以用来评估基因变异的影响,但其预测的准确性有所不同。在这项研究中,作者们评估和优化了计算预测工具在PAX6错义变异方面的性能。 来源介绍 这篇文章由Nadya S. Andhika、Susmito Biswas、Claire Hardcastle等人完成,来自曼彻斯特大学生物科学学院进化、感染与基因组学研究所,曼彻斯特大学附属NHS基金会信托,欧洲分子生物学实验室(EMBL-EBI)等多个机构。这篇论文...

6224个未解决的罕见疾病外显子测序中的结构变异检测和临床解释

结构变异检测及在6224个未解决的罕见病外显子中的临床解释 研究背景 罕见病的诊断与研究一直是遗传学和临床医学的重要挑战。结构变异(SVs),包括大片段缺失、重复、倒位、易位以及更复杂的事件,均可能破坏基因功能,导致罕见疾病。然而,目前的外显子测序(ES)在处理小体内变异如单核苷酸变异(SNVs)和短于50个碱基对的插入-缺失(indels)方面的分析流程,对于SVs则尚不成熟。本研究旨在提高诊断率,尤其是通过检测和解释ES数据中的SV来解决尚未诊断出的罕见病病例。 研究来源 本研究由German Demidov, Steven Laurie等人联合完成,涉及来自不同研究机构的专家学者共同努力。文章发表于2024年在《European Journal of Human Genetics》上,...