适用于基因组关联研究多性状分析的自适应鲁棒方法

多特征基因组关联研究的自适应鲁棒方法 摘要: 过去十年间的基因组关联研究(GWAS)已识别出数千种与人类性状或疾病相关的遗传变异。然而,许多性状的遗传度仍未能完全解释。传统的单一性状分析方法过于保守,而多性状方法通过整合多个性状的关联证据来提高统计力。GWAS总结性统计数据通常是公开可获取的,因此只使用总结性统计的方法具有更大的使用前景。为了解决已开发的多性状分析方法中存在的不一致表现、计算效率低、并且在考虑大量性状时出现数字问题,我们提出了一种自适应Fisher方法用于总结性统计的多性状分析(MTAFS),这是一种计算效率高并且统计力鲁棒的方法。 研究背景: 基因组关联研究(GWAS)在遗传变异与复杂疾病之间的相关性研究中发挥了重要作用。然而,当一个遗传变异与多个性状相关时,采用单一性状分...

ADNP基因功能缺失突变导致Helsmoortel-van der Aa综合征

在对由ADNP基因变异引起的Helsmoortel-Van der Aa综合征(HVDAS)进行研究的基础上,D’Incal等人在《European Journal of Human Genetics》杂志上发表了一篇深入的研究论文。通过对一个五岁女孩的病例研究,该团队发现了ADNP第一个编码外显子的剪接受体位点的三碱基对缺失。该研究极大地推进了我们对HVDAS的病因学理解,并展示了以往针对基因编码区的外显子测序技术在某些情况下诊断失败的原因。 研究课题的设置基于一个核心观念,即ADNP蛋白是大脑发育过程中的关键因子,但各种由于ADNP基因变异导致的蛋白功能损失在病理层面上如何作用尚不明确。ADNP基因变异通常与自闭症、智力障碍、发育迟缓等症状相关,因此其功能丧失或变异蛋白的潜在作用对疾病的...

遗传性听力损失中的遗传异质性:Kinociliary蛋白TOGARAM2的潜在作用

遗传性听力损失中的基因多样性:KINOCILIARY蛋白TOGARAM2的潜在作用 背景介绍 听力损失(Hearing Loss, HL)是一种病因众多的特征,目前研究已经发现超过200个基因中的致病变异与HL相关。尽管已有广泛研究,但超过三分之一的家族中仍无法找到致病原因,这给基因分析带来了极大的挑战,在多基因家族中尤其明显。多个不同基因变异可能导致不同个体,即使是同一个家系中的各成员,各自的致病原因也不尽相同。因此,寻找更多潜在的耳聋致病变异至关重要。 论文来源 本文研究由Memoona Ramzan、Mohammad Faraz Zafeer、Clemer Abad、Shengru Guo等学者完成,研究所属机构分别包括美国迈阿密大学、德国Göttingen大学等。论文发表在2024年...

Mowat-Wilson综合症的DNA甲基化特征识别

识别Mowat-Wilson综合征的DNA甲基化特征 背景介绍 Mowat-Wilson综合征(MOWS)是一种罕见的神经发育障碍,由ZEB2基因的杂合性缺失或功能丧失突变引起。该基因编码一种转录因子,参与神经发育。患有MOWS的个体常表现出中度到重度的全球发育延迟、智力障碍、癫痫和典型的面部表型。此外,还可能存在短身材、Hirschsprung病、大脑和心脏异常等。然而,该综合征的罕见性和表型多样性使得其在新生儿期的诊断更具挑战性。为了解决这一问题,科研人员开展了研究,旨在通过识别一种新的诊断生物标志物来简化MOWS的诊断过程。 论文来源 这项研究由Stefano Giuseppe Caraffi、Liselot van der Laan、Kathleen Rooney等科研人员共同完成,...

TBC1D2B基因缺失引起的渐进性神经障碍与牙龈增生

TBC1D2B基因缺失导致的逐步加重的神经系统疾病伴牙龈增生 背景介绍 近年来,随着基因组学技术的迅猛发展,科学家们对遗传变异与人类疾病之间关系的认识越来越深入。目前,越来越多的研究揭示了这些遗传变异在神经发育和神经退行性病变中的重要作用。TBC1D2B基因属于Tre2-Bub2-Cdc16 (TBC) 结构域包含Rab特异性GTPase激活蛋白(TBC/RabGAPs)家族。以前的研究已经将TBC1D2B基因的双等位基因(biallelic)功能缺失变异与认知障碍和癫痫,伴或不伴牙龈增生的五例患者联系起来。然而,对于TBC1D2B基因变异的表型壮观性和分子机制的认识尚不全面。因此,哈姆斯(Frederike L. Harms)等人的最新研究旨在通过报道五例新的携带双等位TBC1D2B变异的...