原位AAV-SB-CRISPR筛查肿瘤内浸润的原代NK细胞来识别CAR-NK疗法的基因检查点

AAV-SB-CRISPR筛查肿瘤内浸润的原代自然杀伤细胞揭示CAR-NK疗法的遗传性检查点 随着生物技术和基因编辑技术的飞速发展,对于提高自然杀伤(NK)细胞治疗癌症的临床潜力的研究愈发受到关注。尽管在临床治疗中充满潜力,但NK细胞疗法的成功受到多重限制的制约。在《Nature Biotechnology》上发表的一项最新研究中,研究人员基于原代NK细胞执行了一项体内腺相关病毒(AAV)-睡美人(Sleeping Beauty, SB)-CRISPR筛查,针对四种固态肿瘤小鼠模型的肿瘤浸润NK(TINK)细胞展开研究。与此同时,研究人员对TINK细胞进行了单细胞转录组景观的分析,并鉴定出了之前未曾探究的NK细胞亚群和差异表达的TINK基因。 雷鹏、保罗·A·雷瑙尔、贾科莫·斯费鲁扎、罗家杨...

使用碱基编辑筛选绘制人原代T细胞中的抗肿瘤变异效应图谱

使用碱基编辑筛选绘制人原代T细胞中的抗肿瘤变异效应图谱

碱基编辑筛选技术在肿瘤免疫治疗T细胞研究中的应用 免疫细胞疗法,如T细胞转移治疗和CAR T细胞疗法,在某些疾病领域成为临床癌症治疗的重要工具。然而,大部分癌症患者无法从细胞疗法中获益,抗性可能是由于癌细胞内在变化(例如B2M丢失、抗原丢失或CD58丢失或下调)或在免疫抑制性肿瘤微环境中细胞产品的调控。本研究通过基础编辑筛选技术,生成了数千种在已知或潜在临床相关基因位点上的变体,探索了这些变体在T细胞生物标志上的影响,提出利用这些变体改善现有和未来的细胞癌症免疫疗法的可能性。 研究背景 该研究由Zachary H. Walsh、Parin Shah、Neeharika Kothapalli、Shivem B. Shah等人共同完成,他们来自不同的科研机构,具有深厚的科研背景和专业能力。本项研...

通过选择基因驱动编程肿瘤进化以主动对抗耐药性

选择性基因驱动器编程肿瘤进化以主动对抗药物耐药性 随着肿瘤的发展,针对癌症的靶向疗法通常会因药物抵抗性的进化而失败。本研究展现了一种可重复操纵肿瘤进化以设计治疗机会的方式,即使在遗传异质性预先存在的情况下。我们开发了一种选择性基因驱动器系统,可以稳定地引入到癌细胞中,由两个基因(或开关)组成,将可诱导的适应性优势与共享的适应性成本相耦合。利用随机模型的进化动力学,我们确定了选择性基因驱动器的设计准则,并建造了可以利用多个已批准的酪氨酸激酶抑制剂选择性压力的原型,并采用了多种治疗机制,如前药催化和免疫活性诱导。我们证明选择性基因驱动器能在体外消除多种形式的遗传抗性。最终,我们展示了在小鼠实体瘤模型中,模型引导的开关激活可以有效针对预先存在的抗性。这些结果为进化引导的抗癌治疗确立了选择性基因驱动...

Tracking-Seq揭示CRISPR-Cas9介导基因组编辑中的脱靶效应异质性

转录组学技术跟踪序列(Tracking-Seq)揭示CRISPR-Cas9介导的基因组编辑的脱靶效应异质性 研究背景 随着基因组编辑技术的飞速发展,CRISPR-Cas9系统因其高效率、易操作而被广泛应用于生物医学研究领域。然而,由于CRISPR-Cas9系统进行DNA编辑时可能产生非靶效应,即在意图编辑以外的基因位点发生切割,因此如何对非靶效应进行全面识别和评估已成为科研中的一项重要课题。之前的研究主要采用细胞游离法等方法检测非靶效应,但这些方法往往存在对特定编辑工具或细胞类型的依赖性、需要大量细胞、假阳性率高以及仅限于体外基因组编辑等局限。鉴于此,开发一种通用的、能够在细胞原位直接检测非靶效应的方法显得十分迫切。另一方面,目前的研究也有所忽视编辑工具的靶向异质性,即不同编辑工具在不同细胞...

患者来源的迷你结肠使肿瘤微环境复杂性长期建模成为可能

患者来源的迷你结肠使肿瘤微环境复杂性长期建模成为可能

用于研究肿瘤微环境复杂性的长期化模型:患者来源的迷你结肠 背景介绍: 肿瘤与其周围微环境的相互作用对癌症的发展和治疗具有深远的影响。然而,现有的体外肿瘤模型缺乏捕捉这些复杂交互作用的能力。为解决这一问题,该研究创新性地开发了一种基于患者特定癌细胞和其微环境的迷你结肠模型,为癌症治疗提供了一个新的实验平台。 研究团队与出版信息: 这项研究由L. Francisco Lorenzo-Martin等人领导,来自瑞士洛桑联邦理工学院(EPFL)干细胞生物工程实验室等多个科研机构共同完成。研究成果发表在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)上。 研究流程: 研究目的与设计:为了克服现有模型的局限性,本研究旨在开发一种能够长期稳定模型化肿瘤与微环境复杂性的系统。研究聚焦于结直肠癌...