EvoAI实现蛋白质序列空间的极端压缩与重建

蛋白序列空间的极端压缩与重建:EvoAI的突破性研究 背景介绍 蛋白质的设计和优化已经成为生物技术、医学和合成生物学领域中的核心挑战之一。蛋白质的功能由其序列和结构决定,但这一功能性的序列空间(sequence space)非常复杂且高维,包含极大量的可能性。探索这一领域的关键性问题在于如何有效地解析和压缩这片几乎无穷大的序列空间,进而识别与功能密切相关的特征。以往的方法包括直接进化(directed evolution)、深度突变扫描(deep mutational scanning, DMS)、位点饱和突变(site-saturation mutagenesis)等实验策略,虽为揭示基因型与表型的关系提供了重要的见解,但在序列空间覆盖范围、准确性和高维分析能力方面受到显著限制。而计算方法...

ONIX:用于自然行为期间多模态神经记录和扰动的统一开源平台

用于自然行为的多模态神经记录与干扰的开放式平台ONIX 研究背景与意义 近年来,神经科学领域在大规模神经群体记录技术和动物行为研究方面取得了显著进展。然而,这两个需求之间始终存在冲突。为了获得高质量的神经数据,许多研究采用固定头部的实验方法,这限制了动物的自然行为表现。然而,越来越多的研究表明,自然行为中的神经活动与固定实验中的表现显著不同。比如,运动行为会影响某些被认为主要用于感官处理的脑区活动,而学习策略在固定和自由活动状态下也存在明显差异。这些发现表明,要研究复杂的神经功能如社会互动、学习和认知,必须在动物自然行为背景下进行神经记录。 传统记录方法多采用笨重的设备及电缆,不仅对动物的运动造成限制,也难以实现长时间记录或大空间实验。这尤其对小型实验动物(如小鼠)是一个巨大挑战。因此,设计...

全自动微流控芯片在卵内性别鉴定中的应用

基于微流控芯片的自动化胚胎性别鉴定技术 学术背景 在蛋鸡养殖业中,孵化后立即处死雄性雏鸡是一种普遍做法,因为雄性雏鸡既不能产蛋,也无法提供优质的肉类。每年,欧盟约有3.72亿只雄性雏鸡在孵化后被处死。这种做法引发了动物福利和伦理问题,促使多个欧洲国家(如德国、法国和意大利)立法禁止这一行为。为了解决这一问题,胚胎性别鉴定(in ovo sexing)成为了最具前景的替代方案。然而,现有的胚胎性别鉴定技术无法同时满足高精度(>98%)、低成本、对胚胎干扰小、适用于所有蛋壳颜色以及每小时处理超过2万枚蛋的要求。 为了解决这些挑战,研究人员开发了一种基于重组酶聚合酶扩增(Recombinase Polymerase Amplification, RPA)的微流控芯片技术,旨在实现自动化、高灵敏度的...

用于连续左旋多巴监测的工程化直接电子转移酶的开发与应用

开发用于持续监测左旋多巴的工程化直接电子转移酶 背景介绍 帕金森病(Parkinson’s Disease, PD)是一种影响全球数百万人的慢性神经退行性疾病,其主要特征是黑质多巴胺能神经元的丢失以及α-突触核蛋白聚集成路易体颗粒(Lewy bodies)分布于神经元中。尽管左旋多巴(levodopa)是PD治疗的主要药物,能够有效缓解运动症状,但由于其治疗窗口非常狭窄,给药不当可能导致严重的副作用,如恶心、运动障碍或症状的反弹。这一问题加剧了对实时左旋多巴监测手段的需求。然而,当前缺乏能够实现连续左旋多巴监测的设备,主要原因在于现存技术无法做到对左旋多巴的高灵敏度和高特异性检测。 与糖尿病管理中普遍使用的连续血糖监测设备(CGM)不同,PD管理中的持续左旋多巴监测系统仍未实现。本文的作者指...

基于电阻抗谱的牛眼葡萄膜黑色素瘤早期检测研究

基于电阻抗谱的牛眼葡萄膜黑色素瘤早期检测研究

利用电阻抗谱技术早期检测葡萄膜黑色素瘤 学术背景 葡萄膜黑色素瘤(Uveal Melanoma, UM)是成人中最常见的原发性眼内恶性肿瘤,具有高度侵袭性,可能导致视力丧失甚至危及生命。早期发现和及时治疗对于保护视力和降低死亡率至关重要。然而,许多UM患者在肿瘤较大之前并无明显症状,这使得早期诊断变得极具挑战性。现有的诊断方法,如眼底检查和超声成像,虽然有效,但需要专业设备和技能,且不适用于大规模筛查。因此,开发一种简便、非侵入性的早期检测方法具有重要意义。 电阻抗谱技术(Electrical Impedance Spectroscopy, EIS)是一种通过测量生物组织的电学特性来区分健康组织和病变组织的技术。已有研究表明,癌变组织的电学特性(如细胞表面电荷、跨膜电位、离子浓度和细胞膜通透...