人工动态RNA结构集合引导的通用RNA适配体传感标签的理性设计 学术背景 RNA分子在自然和合成生物系统中扮演着多种角色，其功能强烈依赖于其动态和特定的三维结构。RNA的二级和三级结构，如发夹、伪结、多路连接等，是理解RNA功能的关键“构建模块”。然而，现有的RNA结构研究大多基于静态结构，而大多数RNA介导的过程涉及构象变化。因此，动态结构集合的描述能够捕捉RNA的进化保守模式，并有助于其扩展设计。近年来，荧光RNA适配体（fluorogenic RNA aptamer, FRAPT）在生物应用中取得了显著进展，但其设计缺乏对动态结构集合的深入理解，且缺乏通用的设计原则。为了克服这些限制，研究者们开发了一种人工动态RNA结构集合“SSPepper”，并基于此设计了一种通用的荧光RNA生物传...

BRCA1/2 基因携带者肿瘤分析：在不同时间点显现基因组相似性 乳腺癌（Breast Cancer, BC）是全球女性中最常见的恶性肿瘤，其发病机制多为散发性，而家族性遗传病例仅占5%到10%。在众多致病分子中，BRCA1/2 基因突变（Pathogenic Gene, PG）因其高渗透性成为遗传性乳腺/卵巢癌综合征研究的重点。这些基因突变显著提高了女性罹患乳腺癌和卵巢癌的终生风险，分别高达38%至87%和16.5%至73%。此外，BRCA1/2 突变还与其他癌症类型相关，包括胰腺癌、胃癌和前列腺癌。 本文作者团队包括 Tal Falick Michaeli、Avital Granit Mizrahi 等，他们隶属于以色列 Hebrew University 和 Hadassah Medi...

肺腺癌中与放射抗性相关的端粒基因在预后和免疫浸润中的影响 肺腺癌（Lung Adenocarcinoma, LUAD）是非小细胞肺癌（NSCLC）的一种常见亚型，具有较高的发病率和死亡率。尽管近年来在早期检测和治疗方面取得了显著进展，LUAD患者的总体生存率仍不尽如人意。这种局面促使研究者不断探索新的生物标志物和治疗靶点。本文发表于《Cancer Cell International》杂志，由上海肺科医院和同济大学医学院的研究团队完成，旨在揭示与放射抗性相关的端粒基因（Radioresistant-related Telomere Genes, RRTGs）在LUAD预后和免疫浸润中的作用。 研究背景 端粒（Telomeres）是位于染色体末端的重复DNA序列，对染色体的稳定性具有重要作用。...

多组学分析揭示急性髓系白血病非洲裔患者的生存预测因子 背景与研究目的 急性髓系白血病（Acute Myeloid Leukemia, AML）是一种以髓系祖细胞克隆性扩增为特征的血液肿瘤，其发病机制深受基因组改变的影响。然而，针对不同种族群体的AML基因组研究仍显不足。尤其是，非洲裔患者仅占AML基因组研究样本的2%，这与非洲裔群体占患者总数的9%的比例显著不符。这种研究的不足不仅限制了精准医学的普及，也可能加剧治疗效果的差距。 此前研究表明，非洲裔AML患者的生存率较低，这一差异可能与结构性种族主义、社会经济因素以及基因组差异等多种因素相关。然而，现有AML分子风险分层系统主要基于欧洲裔患者的基因组数据，可能未能有效捕捉非洲裔患者的特异性基因特征。本研究的主要目标是通过多组学分析探索非洲裔...

基于AAV9载体的C1ORF194基因治疗改善CMT样神经病变的研究 背景与研究动机 Charcot-Marie-Tooth病（CMT）是一组遗传异质性极高的罕见遗传性神经肌肉疾病，其特征是逐渐进展的肌肉无力和萎缩，伴随感觉功能缺失。尽管已有大量临床前和临床研究投入，目前尚无针对任何类型CMT的FDA批准疗法。CMT发病机制复杂，涉及超过100种基因的突变，研究这些基因的功能与治疗潜力至关重要。 本研究团队此前鉴定了一个新型致病基因C1ORF194，该基因可能作为线粒体相关内质网膜（MAM）蛋白，在钙离子稳态调节和CMT病理机制中起重要作用。为了探讨该基因的治疗潜力，作者开发了C1ORF194敲除（C1ORF194-/-）小鼠模型，用于模拟CMT病理表型。本研究基于腺相关病毒9型（AAV9）...

棉花种群水平DNA甲基化多态性研究揭示表观基因组对复杂性状的贡献 背景与研究动机 在过去几十年中，基因组和基因多样性通过全基因组关联研究（GWAS）被广泛研究，为理解作物性状变异提供了理论基础。然而，DNA甲基化等表观遗传修饰在调控作物性状方面的作用依旧相对不明确。DNA甲基化，是一种重要的表观遗传标记，通过在胞嘧啶（Cytosine）上加上甲基基团，调控基因表达、维持基因组稳定性，并在多种作物的农艺性状中起关键作用。研究发现，基因组甲基化水平的多态性与生态适应性状有关，但在自然作物种群中，表观遗传变异对作物性状的贡献仍然需要更深入的探索。 基于此需求，来自浙江大学和阿里巴巴集团等研究机构的科学家们开展了一项系统的研究，首次在207个棉花品种中生成了高质量的甲基组、转录组和基因组数据，扩展了...