长链非编码RNA在阴茎鳞状细胞癌中的竞争性内源RNA网络研究 学术背景 阴茎鳞状细胞癌（Penile Squamous Cell Carcinoma, PSCC）是一种相对罕见但威胁男性健康的恶性肿瘤，尤其在发展中国家发病率较高。尽管近年来医学诊断和治疗技术有所进步，但PSCC患者的总体生存率并未显著改善。PSCC的发病机制尚未完全阐明，尤其是长链非编码RNA（Long Non-Coding RNAs, lncRNAs）在PSCC进展中的作用仍不明确。lncRNAs是一类长度超过200个核苷酸的非编码RNA，近年来在多种癌症中被证明在肿瘤增殖、转移、药物耐药性和免疫治疗反应中发挥重要作用。然而，lncRNAs在PSCC中的具体功能和分子机制尚未得到充分研究。 为了填补这一研究空白，本研究旨在...
单细胞与空间转录组联合分析揭示胃癌中Hedgehog通路的细胞异质性 学术背景 胃癌（Gastric Cancer, GC）是全球范围内最常见的恶性肿瘤之一，发病率和死亡率均居高不下。尽管在化疗、放疗和靶向治疗等方面取得了一定进展，但胃癌的治疗仍然面临巨大挑战。胃癌的侵袭性和异质性使其成为难治性癌症之一，尤其是晚期患者的生存率极低。肿瘤细胞的侵袭和转移是导致复发和死亡的主要原因，而现有的治疗手段无法完全解决这些问题。免疫治疗作为一种有前景的治疗模式，也面临着肿瘤微环境和免疫复杂性的挑战。因此，深入理解胃癌的发病机制，尤其是从基因、分子到表型水平的全面探索，对于更好地管理疾病和减轻患者负担至关重要。 Hedgehog（Hh）通路在胚胎发育和成人组织中均发挥重要作用，参与细胞增殖、分化和组织形态...
急性心肌梗死凝血相关诊断模型与免疫浸润的潜在关联研究 学术背景 急性心肌梗死（Acute Myocardial Infarction, AMI）是全球范围内导致死亡的主要原因之一。尽管近年来在诊断、治疗和预后方面取得了显著进展，但AMI的发病率和死亡率仍然居高不下。经皮冠状动脉介入治疗（Percutaneous Coronary Intervention, PCI）结合抗凝治疗是目前AMI诊断和治疗的金标准。然而，尽管PCI和抗凝治疗显著改善了心肌灌注，仍有高达50%的患者出现显著的透壁性梗死，并常伴随微血管损伤（Microvascular Injury, MVI）。此外，部分AMI患者在初始抗凝治疗不足的情况下，心肌再梗死的风险显著增加。因此，AMI的发生和预后与促血栓介质和凝血因子（如前...
学术背景 原发性硬化性胆管炎（Primary Sclerosing Cholangitis, PSC）是一种慢性、进行性的肝脏疾病，主要由免疫、炎症和遗传因素共同作用导致，最终可能引发肝功能衰竭。PSC的发病率和患病率在全球范围内存在显著差异，发病率从西班牙的0.07例/10万人年到挪威的1.3例/10万人年不等，患病率则从西班牙的0.2例/10万人年到美国的13.6例/10万人年不等。大约70-80%的PSC患者同时患有炎症性肠病，这增加了胆管癌和结直肠癌的风险。PSC的临床表现和病程多样，诊断主要依赖于胆管影像学和肝脏组织病理学。尽管部分患者病程较为缓慢，但PSC的诊断对患者的长期健康有重大影响，中位无移植生存期为13.2年。随着影像技术的进步，磁共振成像（MR）等非侵入性诊断方法逐渐取...
核小体纤维拓扑结构指导转录因子结合增强子 学术背景 细胞身份的确立依赖于多个转录因子（Transcription Factors, TFs）在细胞类型特异性基因的增强子上的协同结合。尽管TFs能够识别可及染色质中的特定DNA基序（motif），但这一信息并不足以解释TFs如何选择增强子。本文通过比较四种不同的TF组合，分析了它们在基因组中的结合位点、染色质可及性、核小体定位以及三维基因组组织，揭示了核小体纤维的拓扑结构如何指导TFs结合到增强子。 论文来源 本文由Michael R. O’Dwyer、Meir Azagury、Katharine Furlong等作者共同撰写，作者来自University of Edinburgh、The Hebrew University-Hadassah ...
学术背景与问题提出 在癌症研究中，基因扩增（gene amplification）是一种常见的突变形式，尤其是在癌基因（oncogene）的激活中起着关键作用。然而，尽管基因扩增在癌症中的重要性已被广泛认可，但如何在原代细胞和模式生物中精确模拟这些扩增仍然是一个挑战。特别是，染色体外DNA（extrachromosomal DNA, ecDNA）介导的基因扩增在癌症中尤为常见，但其在肿瘤发生和进展中的具体作用尚未完全阐明。ecDNA是一类不依赖于染色体的环状DNA分子，通常携带多个癌基因拷贝，能够通过随机分离在细胞分裂中快速积累，从而促进肿瘤的异质性和进化。 为了深入理解ecDNA在肿瘤发生中的作用，研究人员需要一种能够在细胞和动物模型中精确诱导和追踪ecDNA形成的方法。然而，现有的技术手...