学术背景 化疗耐药性是癌症治疗面临的主要挑战之一。传统研究多聚焦于生化机制（如药物外排泵、DNA修复等），但近年来生物力学因素在肿瘤进展和耐药性中的作用逐渐受到关注。已有研究表明，肿瘤干细胞（CSCs）和转移性癌细胞往往表现出更强的收缩力，但收缩力与化疗敏感性之间的确切关系存在争议。本研究首次系统揭示了细胞间机械力传导通过Notch-MVP信号通路介导核药物外排的分子机制，为癌症”力学治疗”（mechanotherapeutics）提供了新靶点。 论文来源 本论文由The Hong Kong Polytechnic University Shenzhen Research Institute、Research Institute of Smart Aging等机构的Pengyu Du、Kai...

一、研究背景 帕金森病相关蛋白PARK7/DJ-1（以下简称PARK7）是一种多功能蛋白，在神经退行性疾病、癌症和炎症等多种病理条件下发挥重要作用。尽管缺乏传统的N端信号肽序列，PARK7能在应激条件下被分泌到细胞外，其分泌水平在多种疾病患者的脑脊液和血液中显著升高。然而，PARK7非常规分泌的具体机制长期未明。 先前研究表明，6-羟基多巴胺（6-OHDA）诱导的氧化应激可通过自噬途径促进PARK7分泌，但这一过程中PARK7如何被选择性转运至溶酶体腔，以及分泌性自噬溶酶体如何与质膜融合等关键问题尚未解决。本研究旨在揭示： 1. PARK7在氧化应激条件下通过分子伴侣介导的自噬（CMA, chaperone-mediated autophagy）途径转运至溶酶体的分子机制 2. 介导PARK...

学术背景 生物分子凝聚体（biomolecular condensates）是细胞内通过液-液相分离（LLPS）形成的无膜细胞器，在基因表达、信号传导等关键生物学过程中发挥重要作用。然而，由于传统成像技术的限制，凝聚体内部的高分辨率结构信息长期缺失，这阻碍了对其功能机制的深入理解。染色质（chromatin）作为真核生物细胞核内遗传物质的主要组织形式，其动态凝聚与解聚过程直接影响基因调控，但染色质凝聚体的精细结构和分子排布规律仍不明确。 本研究由Michael K. Rosen团队主导，旨在解决以下关键问题： 1. 如何克服传统冷冻电镜制样技术对液态凝聚体结构的破坏 2. 如何在高密度的凝聚体内部实现单个核小体（nucleosome）的精确定位与取向分析 3. 比较体外重构染色质凝聚体与天然...

一、学术背景及研究动机 随着生命科学与生物信息学的飞速发展，RNA分子结构及其功能研究成为热点领域。RNA不仅仅是基因信息的传递者，更在调控、催化等多种生理过程中扮演关键角色。RNA分子的三维结构直接影响其生物学功能，而RNA结构的精确解析对于基础科学、药物设计、疾病机制研究等均具有重要意义。然而，RNA的序列到结构转换远比蛋白质复杂，不仅因为RNA的骨架有七个主链扭转角（α, β, γ, δ, ε, ζ, χ），而且还涉及复杂的伪扭转角（η, θ），加之非经典碱基对、多重环、三元作用等多样结构因素，使得高精度RNA三维结构预测极具挑战性。 传统的实验测定RNA结构方法如核磁共振（NMR）、X射线晶体学（X-ray crystallography）、冷冻电镜（cryo-EM）手段，不但昂贵且...

一、学术背景与研究意义 近年来，蛋白质液-液相分离（phase separation，PS）作为调控细胞内生物分子的关键机制，受到生命科学领域的广泛关注。相分离不仅推动了无膜细胞器（biomolecular condensates）的形成，还广泛影响着生化反应速率、蛋白质组织与定位，并与癌症和神经变性疾病等重大疾病的发生密切相关。尽管相分离现象的生物学意义逐渐被认识，但其驱动机制和调控密码仍显复杂且难以捉摸，尤其是在驱动相分离的蛋白质区域识别方面，科学界仍然面临诸多挑战。 传统的相分离预测方法，大多依赖已有的蛋白质注释信息或人工设定的特征参数。这些方法虽然在已知蛋白质上表现良好，但面临着对未知蛋白质、变体和不同物种间广泛泛化能力的严重不足。同时，针对蛋白质序列的局部驱动区域（residue-...