Des jumeaux numériques en santé au jumeau humain virtuel : un projet ambitieux pour la recherche en santé numérique

Sciences de l'information, Informatique, Intelligence artificielle, Médecine, Médecine fondamentale, Imagerie médicale, Sciences de la vie, Génie biologique,
jumeau numérique   jumeau humain virtuel   santé numérique   aide à la décision clinique   prévision de santé personnalisée  

De la jumeau numérique au jumeau humain virtuel : le « projet Apollo » du domaine de la santé numérique I. Contexte académique et motivations de la recherche À l’heure actuelle, il existe encore de nombreux besoins cliniques et sociétaux non satisfaits dans les systèmes de santé mondiaux, se manifestant par exemple par un manque d’options de traite...

Modélisation inter-espèces des génomes végétaux à la résolution d'un nucléotide à l'aide d'un modèle linguistique ADN pré-entraîné

Sciences de l'information, Informatique, Intelligence artificielle, Sciences de la vie, Biochimie, Génie biologique, Génétique, Botanique,
génomique des plantes   apprentissage profond   modèle linguistique ADN   prédiction inter-espèces   mutation délétère   annotation génétique   angiosperme  

Jalons de la modélisation inter-espèces des génomes végétaux : Création et applications révolutionnaires du modèle de langage ADN PlantCaduceus I. Contexte académique et motivations de la recherche Au cours des vingt dernières années, la progression fulgurante des technologies de séquençage à haut débit a permis la publication de plus de 1000 génom...

Entraînement et évaluation sensibles aux biais des algorithmes de prédiction de liens en biologie des réseaux

Sciences de l'information, Informatique, Intelligence artificielle, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie, Génie biologique, Génétique,
prédiction de liens   biologie des réseaux   biais   interaction protéine-protéine   apprentissage sur graphes   évaluation d’algorithmes  

Révéler le biais des “nœuds riches” dans les algorithmes de prédiction de liens et ses nouvelles stratégies d’atténuation —— Décryptage de “Bias-aware Training and Evaluation of Link Prediction Algorithms in Network Biology” I. Contexte académique et origine de la recherche Au cours des dix dernières années, la biologie des réseaux (network biology...

DeepRNA-Twist : Prédiction des angles de torsion de l'ARN guidée par un modèle de langage avec un réseau d'attention-inception

Sciences de l'information, Informatique, Intelligence artificielle, Sciences de la vie, Biochimie, Génie biologique, Biophysique,
 

I. Contexte académique et motivation de la recherche Avec le développement rapide des sciences de la vie et de la bioinformatique, l’étude de la structure et de la fonction des molécules d’ARN est devenue un domaine d’actualité. L’ARN n’est pas seulement le vecteur de l’information génétique, il joue également un rôle clé dans de nombreux processus...

Chrombus-XMBD : un modèle de convolution graphique prédictif du génome 3D à partir des caractéristiques de la chromatine

Sciences de l'information, Informatique, Intelligence artificielle, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Génétique, Biophysique,
génome 3D   modèle de convolution graphique   caractéristiques de la chromatine   interaction à longue distance   généralisabilité du modèle  

Contexte de la recherche et importance disciplinaire Dans les cellules eucaryotes, la structure spatiale tridimensionnelle de la chromatine joue un rôle essentiel dans la régulation de l’expression génique. Grâce à des repliements complexes, la formation de boucles et des réorganisations locales, l’ADN permet à différents éléments géniques (tels qu...

L'apprentissage d'ensemble basé sur la complétion matricielle améliore la prédiction des associations microbe-maladie

Sciences de l'information, Informatique, Intelligence artificielle, Médecine, Sciences de la vie, Microbiologie,
association microbe-maladie   apprentissage d'ensemble   complétion matricielle   algorithme de prédiction   bioinformatique  

Contexte académique et problématique de recherche Les micro-organismes, en tant que l’une des formes de vie les plus répandues sur Terre, entretiennent des relations étroites avec les océans, les sols ainsi que le corps humain. On estime que le corps humain héberge environ 350 000 milliards de cellules microbiennes (microbial cells), dont la présen...