METTL3 médie la glycolyse induite par le flux athérogène dans les cellules endothéliales

Médecine, Système cardiovasculaire, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie, Immunologie,
glycolyse   cellules endothéliales   athérosclérose   METTL3   flux   modification de l'ARN   reprogrammation métabolique  

I. Contexte de la recherche L’athérosclérose est la base pathologique principale des maladies cardiovasculaires, étroitement liée au dysfonctionnement des cellules endothéliales vasculaires (ECs). Les facteurs hémodynamiques jouent un rôle clé dans la sélectivité régionale de l’athérosclérose : la contrainte de cisaillement oscillante (OS) (comme a...

Deep scSTAR : Exploiter l'apprentissage profond pour l'extraction et l'amélioration des caractéristiques associées au phénotype à partir du séquençage d'ARN unicellulaire et des données de transcriptomique spatiale

Sciences de l'information, Intelligence artificielle, Médecine, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Immunologie,
Séquençage d'ARN unicellulaire   Transcriptomique spatiale   Apprentissage profond   Caractéristiques associées au phénotype   Microenvironnement tumoral  

Ces dernières années, des technologies de pointe telles que le séquençage unicellulaire (single-cell RNA sequencing, scRNA-seq) et la transcriptomique spatiale (spatial transcriptomics, ST) ont profondément stimulé le développement des sciences de la vie et de la médecine clinique. Elles ont révélé l’hétérogénéité cellulaire et ont offert de nouvel...

L'apprentissage d'ensemble basé sur la complétion matricielle améliore la prédiction des associations microbe-maladie

Sciences de l'information, Informatique, Intelligence artificielle, Médecine, Sciences de la vie, Microbiologie,
association microbe-maladie   apprentissage d'ensemble   complétion matricielle   algorithme de prédiction   bioinformatique  

Contexte académique et problématique de recherche Les micro-organismes, en tant que l’une des formes de vie les plus répandues sur Terre, entretiennent des relations étroites avec les océans, les sols ainsi que le corps humain. On estime que le corps humain héberge environ 350 000 milliards de cellules microbiennes (microbial cells), dont la présen...

Évaluation comparative des outils d'inférence des aberrations du nombre de copies à l'aide de jeux de données multi-omiques à cellule unique

Sciences de l'information, Intelligence artificielle, Médecine, Oncologie, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Génie biologique, Génétique,
Séquençage ARN unicellulaire   Aberrations du nombre de copies   Hétérogénéité tumorale   Évaluation comparative   Multi-omiques  

I. Contexte et importance de la recherche Dans les domaines de l’oncologie et de la génomique, les altérations du nombre de copies chromosomiques (Copy Number Alterations, CNAs) représentent un type de variation génétique clé qui conduit à la survenue et à la progression du cancer. Les CNAs déterminent non seulement l’hétérogénéité tumorale, mais s...

Révéler une nouvelle caractéristique du cancer par l'évaluation de l'infiltration neuronale dans le cancer

Médecine, Oncologie, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Immunologie, Génétique,
infiltration neuronale   caractéristique du cancer   microenvironnement tumoral   séquençage d'ARN monocellulaire   immunothérapie  

Le cancer, en tant que défi majeur de santé publique mondiale, possède des mécanismes de survenue et de développement complexes. Depuis longtemps, des processus comme l’immunité, l’inflammation et l’angiogenèse du microenvironnement tumoral (tumor microenvironment, TME) ont attiré une large attention, étant considérés comme des déterminants importa...

Phénotypage optimisé des traits morphologiques complexes : Amélioration de la découverte des variants génétiques communs et rares

Médecine, Imagerie médicale, Sciences de la vie, Génie biologique, Génétique,
Association génotype–phénotype   Trait complexe   Héritabilité   Phénotypage facial   Forme 3D  

I. Contexte académique et motivation de la recherche Au cours des dernières années, l’analyse des associations génotype-phénotype (G-P) est devenue une approche centrale pour élucider les bases génétiques des caractères complexes, notamment dans les études sur les traits structuraux multidimensionnels tels que le visage humain, les membres et le sq...