分子リンカー設計のための等変3D条件付き拡散モデル

分子リンカー設計のための等変3D条件付き拡散モデル

早期の医薬品発見に従事する研究者は、およそ10の60乗の可能な分子構造の中から、薬理活性を持つ候補分子を見つけるという大きな課題に直面しています。この問題を解決する1つの有効な方法は、より小さな「フラグメント」分子から始めることで、この戦略はフラグメントベースの医薬品設計(FBDD)と呼ばれています。FBDDプロセスでは、まず計算機を使ってターゲットタンパク質の結合ポケットに結合するフラグメントを選別し、次にそれらのフラグメントを1つの化合物に接続します。フラグメントを接続する際には、フラグメントの幾何学的な構造とタンパク質ポケットの構造を考慮して、高い親和性を持つ潜在的な医薬品分子を設計する必要があります。 この論文では、DiffLinkerという新しいリンカー(linker)分子設計手法...

ミクログリアにおけるTGFβ活性化キナーゼ-1の活性化をターゲティングすることで、CAR T免疫効果細胞関連の神経毒性症候群を軽減する

この研究では、研究者は癌抗原受容体(CAR)T細胞療法関連の免疫効果細胞誘発性神経毒性症候群(ICANS)におけるTAK1活性化経路の役割を探求しました。彼らはマウスICANSモデルを確立し、CAR19 T細胞の移植後、小脳細胞が活性化され、形態の変化が起こり、活性化マーカー(CD80、CD11c、主要組織適合性複合体クラスII分子など)の発現が増加することを発見しました。 マイクロアレイとシングルセルRNA解析により、活性化した小脳細胞においてTNF、CCL2、GM-CSFなどの炎症促進因子とそれらの関連経路遺伝子の発現が上方制御されていることが示されました。行動学的試験では、CAR19 T細胞療法を受けたマウスでは、不安の増加、記憶力の低下などの認知機能障害が認められ、血液脳関門の透過性...

LGR4を標的とした大腸がんにおける鉄死の標的活性化が獲得薬剤耐性を克服

遺伝的癌性耐性に対するLGR4標的化による克服 研究背景: 獲得性の薬物耐性は、がん治療の主な障壁であり、がん死亡の主な原因でもあります。しかし、耐性メカニズムはさまざまであり、耐性がん細胞に特異的に対処することは、依然として大きな臨床的課題です。Wnt経路の活性化は、がん幹細胞の存在を維持し、化学療法耐性を誘導できるため、Wnt経路を標的とすることは、腫瘍の耐性を克服する有望な戦略と考えられています。 研究者と発表状況: この研究は、南開大学のChen Quan教授の研究グループによって行われ、論文は2024年4月号の「ネイチャー・キャンサー」誌に掲載されました。論文の連絡著者は、南開大学のChen Quan教授、中国科学院動物研究所のDu Lei研究員、そして南開大学のHu Gang教授...

動的多次元単一細胞プロファイリングによる拡散性大細胞型B細胞リンパ腫における臨床的に有効なCAR T細胞サブセットの同定

動的多次元単一細胞プロファイリングによる拡散性大細胞型B細胞リンパ腫における臨床的に有効なCAR T細胞サブセットの同定

動的な単一細胞解析を用いて臨床的に有効な移植抗原受容体T細胞サブセットを発見し、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫の治療に利用する 研究背景 移植抗原受容体(CAR)T細胞療法は、B細胞悪性腫瘍を治療する有効な方法であることが実証されている。しかし、現在のところ、個人のCART細胞療法に対する臨床反応を予測することは難しい。機能と分子タイピングを統合することで、CART細胞治療効果に関連する細胞特性を明らかにし、この治療法の発展と応用を促進できる可能性がある。 研究機関と発表雑誌 この研究はヒューストン大学、Kite生物医薬会社、テキサス小児病院ベイラー医学院、テキサス大学MDアンダーソン癌センターなどの研究機関の研究者が協力して行われた。論文は「ネイチャー-癌」誌に掲載されている。 研究方法と...

小児期神経膠腫生存者における治療法と晩期死亡率および罹患率の経時的変化:小児がん生存者研究からの報告

小児期神経膠腫生存者における治療法と晩期死亡率および罹患率の経時的変化:小児がん生存者研究からの報告

これは小児膠芽腫生存者の長期予後に関する研究です。この研究の主な目的は、過去数十年間の小児膠芽腫治療法の変化が、生存者の遠隔期死亡率、慢性健康状態、および続発性腫瘍発生リスクにどのような影響を与えたかを評価することです。 背景紹介: 過去、小児低悪性度膠芽腫(PLGG)の治療には通常、手術切除、全脳照射、および従来の細胞毒性化学療法が含まれていました。しかし、全脳照射は、続発性腫瘍、認知障害などの遠隔期有害事象のリスクを高めます。1980年代から、化学療法が全脳照射の遅延または回避のために使用されるようになり、特に年齢の低い患児に対してです。1990年代までに、カルボプラチンを基礎とするレジメンが術後一次治療の選択肢となりました。本研究は、この治療戦略の変更が生存者の遠隔期予後にどのような影...

ロジスティック関数の双曲線正接表現:CTくも膜下出血検出のための確率的マルチインスタンス学習への適用

人工知能分野には長年にわたって「弱教師あり学習」の問題がありました。つまり、訓練データにおいて、一部分のラベルのみが観測可能で、残りのラベルは未知です。多インスタンス学習(Multiple Instance Learning、略してMIL)は、この問題を解決する1つのパラダイムです。MILでは、訓練データがいくつかの「バッグ」(bag)に分けられており、各バッグには複数のインスタンス(instance)が含まれています。私たちはバッグのラベルのみを観測できますが、個々のインスタンスのラベルを知ることはできません。MILの目標は、バッグのラベルに基づいて、新しいバッグとそれに含まれるインスタンスのラベルを予測することです。 MILパラダイムは様々な科学分野で広く応用されており、特に医療画像分野...