将来の高度シーケンス診断における品質保証の適用 背景紹介 過去10年間、次世代シーケンシング（Next-Generation Sequencing、NGS）は希少神経疾患（Rare Neurological Diseases、RND）の診断分野で革命的な進歩を遂げました。しかし、技術、解釈、報告の基準が不足しているため、グローバルで一貫性のある高品質な診断を確保することが課題となっています。この問題に対処するため、欧州希少神経疾患リファレンスネットワーク（European Reference Network for Rare Neurological Diseases、ERN-RND）は欧州分子遺伝学品質ネットワーク（European Molecular Genetics Quality N...

次世代シーケンシングに基づく乳がん多遺伝子リスクスコア位置の遺伝子型決定の限界 背景紹介 遺伝性乳がん（Breast Cancer, BC）の予測において、多遺伝子リスクスコア（Polygenic Risk Scores, PRSs）が個人のリスク予測の重要なツールとして、ますます広く適用されています。PRSの計算は、変異対立遺伝子頻度（Allele Frequencies, AFs）を正確に再現し、それによってPRSSの値を正確に予測することに依存しています。しかし、現在、次世代シーケンシング技術（Next-Generation Sequencing, NGS）を使用して多遺伝子リスクスコアの遺伝子型分析を行う際、多くの技術的制限が存在します。本研究の背景は、これらの技術的課題にあり、乳が...

薬物ゲノミクス検査の抗血小板療法への臨床的影響 背景紹介 薬物ゲノミクス（PGx）は、急性冠症候群（ACS）、神経血管問題、および血管疾患の治療に広く使用されているP2Y12阻害剤（抗血小板薬）の使用を変革しています。その中で、クロピドグレル（clopidogrel）は一般的に使用されるP2Y12阻害剤であり、この前駆体薬物は多くの経路を通じて活性代謝物に変換されますが、主にシトクロムP450 2C19（CYP2C19）酵素を介して行われます。しかし、CYP2C19遺伝子に機能喪失（LOF）対立遺伝子を持つ集団では、クロピドグレルの効果が低く、これにより一部の患者は主要な有害心血管イベント（MACE）のリスクが高くなります。 CYP2C19遺伝子型検査によりLOF対立遺伝子を持つ患者を識別し...

ヒトポリメラーゼδの校正欠陥の潜在的効果の発見：POLD1変異を持つ正常細胞および癌細胞の変異解析を通じて 背景紹介 DNAの修復の破壊は、遺伝性がんを引き起こす主要なメカニズムの1つです。POLD1とPOLEのエクソン領域における heterozygous な病原性変異は、エキソヌクレアーゼの校正活性に影響を与え、がん易罹患性症候群を引き起こし、胃腸の多発性ポリープ、大腸がん、子宮内膜がんなどのリスク増加として現れます。現在の一般的な説明では、これらのエキソヌクレアーゼ活性の喪失とがんの発展は、体細胞変異率の増加を通じて関連しているとされています。しかし、この仮説の具体的な検証については依然として議論があり、研究者らはPOLD1変異を持つ家族のメンバーから派生した線維芽細胞クローンと親子間...

臨床遺伝子検査における偶発的所見の評価と報告のフレームワーク 研究背景 現在の臨床実践において、全ゲノムシーケンシング（clinical genome sequencing, CGS）は稀少な遺伝性疾患の診断における重要な手段となりつつあります。しかし、ゲノムシーケンシングでは、検査目的とは無関係な予期せぬ結果である偶発的所見（incidental findings, IFs）がしばしば発生します。IFsの返却を指導する一般的に受け入れられたガイドラインが不足しているため、IFsの報告方針はまちまちで透明性に欠けています。そのため、研究者たちはCGSプロセスで遭遇するIFsの評価と返却を指導するための新しいフレームワークを開発しました。このフレームワークはIFsの臨床的意義と実行可能性に焦点...