人类胎盘分子分辨率下的空间多组学景观

描述人类胎盘的分子解析新篇章:空间多组学研究的突破性进展 研究背景与问题 胎盘是人类妊娠过程中第一个发育的胎儿器官,对于维持妊娠成功和胎儿健康发育至关重要。然而与其重要性不相称的是,我们对胎盘的发育过程和分子调控机制知之甚少。胎盘不仅是母体与胎儿物理及营养交换的关键界面,还通过免疫调节和代谢适应确保胎儿的快速生长和健康发育。 尽管近年来多种单细胞技术(如单细胞RNA测序,scRNA-seq)和空间组学分析技术用于研究胎盘异质性和细胞间的相互作用,但目前关于胎盘的研究仍存在几个主要问题:分子分辨率不足、研究局限于单一数据维度(仅限转录组学或表观组学)、以及对母胎界面(maternal-fetal interface, MFI)的调控机制缺乏系统性的空间解析。而这些问题的解决对于理解胎盘的发育、...

单细胞轨迹的基因级对齐

基因级别单细胞轨迹比对:基于动态编程的新方法 单细胞RNA测序(Single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)技术的出现,极大推动了生物学的研究进程,使科学家能够观察到时间或空间中单细胞水平上的动态变化。然而,如何跨样本或条件(如对照与药物处理、体外与体内实验、健康与疾病等)比较这些动态变化,依然是一个巨大的挑战。本次研究通过开发一种称为“genes2genes”的新工具,试图解决单细胞轨迹比对中的关键问题,特别是在基因级别上实现精确的动态变化匹配。 本文由来自 Wellcome Sanger Institute、University of Cambridge、Columbia University 等机构的研究人员合作完成,通讯作者为 Sarah A. Tei...

人类血管细胞的器官型图谱

解码人体血管系统:一项多器官单细胞转录组研究全面揭示血管细胞的多样性 背景概述 人体血管系统是生命维持的核心组成部分,由内皮细胞(Endothelial Cells, ECs)和周壁细胞(Mural Cells)构成,贯穿全身各器官系统。其功能不仅局限于传递血液和完成气体与营养的交换,还在维持组织内稳态、免疫调节、血管生成及病理过程(如高血压、癌症、炎症性疾病和糖尿病)中扮演关键角色。血管内皮细胞根据器官和血管类型表现出多样的功能及分子特异性,例如血脑屏障的屏障功能、脾脏过滤红细胞的功能等。然而,关于不同器官和血管类型的分子特征在全器官范围内的系统性划分,目前的研究尚不完善。 正是在这一背景下,本研究展开了一次全面性探索,以揭示血管细胞的组织特异性和分子多样性,试图回答以下科学问题:血管内皮...

人类大脑成熟过程中基因表达动态的颞叶皮层细胞图谱

人类大脑成熟中的基因表达动态研究:全新的时间性大脑细胞图谱 学术背景 人类大脑的发育和成熟是神经科学中的一个重要研究领域,但至今仍存在许多未解之谜。发育中的人类大脑在出生后经历了漫长而复杂的成熟过程,这一过程受到基因表达动态变化的引导。尽管先前基于体块组织(bulk tissue)进行的大规模转录组学研究揭示了基因表达的显著变化,尤其是在胎儿后期到婴儿早期的过渡阶段,以及童年和青春期大脑结构和功能的剧烈变化,但这些研究的局限性在于未能指明细胞类型特异性的基因表达动态。因此,每种不同细胞类型在童年至成年大脑成熟过程中究竟发生了怎样的基因表达变化仍是一个未解的科学问题。 此外,全球范围内目前建立的人类大脑细胞图谱以成人为主,缺乏对儿童阶段的涵盖。而非洲作为全球基因多样性最高的地区,其加速增长的儿...

高效且高度放大的核酸靶标成像技术在细胞和组织病理学样本中的应用

在组织与临床研究中高效扩增核酸靶标信号的新平台:PSABER 研究背景及相关知识 自1960年代Pardue和Gall首次提出原位杂交(In Situ Hybridization,ISH)以来,这项技术因其能够在固定样本中直观地展示核酸靶标的空间分布而受到了广泛的研究和临床应用关注。ISH依赖目标RNA或DNA与补体探针的杂交反应,其结果可通过荧光显微镜或透射光显微镜进行分析。ISH技术广泛用于基因组DNA的定位、人类核型分析、单细胞RNA定量分析,以及核内染色体空间组织的研究。其中,荧光原位杂交技术(Fluorescent In Situ Hybridization,FISH)尤其得益于荧光显微镜的多重标记能力,从而实现了单样本中多种RNA转录物的可视化。 尽管ISH技术不断发展,但信号灵...

母体X染色体对雌性小鼠认知和大脑老化的影响

母源X染色体对雌性小鼠认知和脑老化的影响 背景介绍 在哺乳动物中,雌性细胞拥有两条X染色体,一条来自母亲(母源X染色体,Xm),另一条来自父亲(父源X染色体,Xp)。在胚胎发育过程中,其中一条X染色体会随机失活,这一过程被称为X染色体失活(X inactivation)。这种失活机制导致雌性个体在细胞水平上形成X染色体的嵌合现象(mosaicism),即某些细胞表达母源X染色体,而另一些细胞表达父源X染色体。这种嵌合现象在个体之间存在差异,有些个体甚至表现出X染色体失活的显著偏斜(skew)。X染色体的亲本来源可能通过DNA甲基化等表观遗传机制影响基因表达,从而在衰老和疾病过程中起到缓冲作用。然而,X染色体失活的偏斜或嵌合现象是否会影响雌性个体的功能,尤其是认知和脑老化,仍然是一个未解之谜。...