合成生物学在癌症免疫治疗中的应用：通过抑制IDO活性和重编程CD8+ T细胞反应进行癌症免疫治疗的工程细菌 学术背景 近年来，癌症免疫治疗取得了显著进展，尤其是通过激活T细胞来对抗肿瘤。然而，肿瘤微环境（Tumor Microenvironment, TME）中的代谢适应往往导致T细胞功能受损，限制了免疫治疗的效果。其中，色氨酸（Tryptophan, Trp）代谢在T细胞功能中扮演着重要角色。肿瘤细胞通过表达吲哚胺2,3-双加氧酶（Indoleamine 2,3-Dioxygenase, IDO）消耗色氨酸，导致其代谢产物犬尿氨酸（Kynurenine, Kyn）的积累，进而抑制效应T细胞的功能，形成免疫抑制的微环境。尽管IDO抑制剂在临床前模型中显示出潜力，但其在临床试验中面临诸多挑战，...

蓝藻-益生菌共生体在结肠炎中的抗炎与肠道菌群调节作用研究 学术背景 炎症性肠病（Inflammatory Bowel Disease, IBD）是一类慢性肠道炎症性疾病，主要包括克罗恩病（Crohn’s Disease, CD）和溃疡性结肠炎（Ulcerative Colitis, UC）。IBD的发病机制复杂，涉及肠道黏膜屏障功能障碍、肠道菌群失调以及过度的免疫反应和炎症因子释放。目前，IBD的治疗主要依赖于抗炎药物和免疫抑制剂，如5-氨基水杨酸（5-ASA）、皮质类固醇和肿瘤坏死因子（TNF）拮抗剂。然而，这些治疗方法往往无法从根本上解决IBD的病因，且长期使用可能导致严重的副作用，如机会性感染、恶性肿瘤和肝毒性。 近年来，肠道菌群在IBD发病机制中的作用逐渐被揭示，益生菌疗法作为一种辅...

微生物种群营养共限制的定量与动态特性研究 学术背景 微生物的生长、生理和代谢活动受到资源可用性的根本性控制。理解哪些资源限制了微生物的生长以及限制的程度，不仅是微生物学的核心概念，也对预测微生物在生物地球化学循环中的贡献、抑制人体内的病原体以及在生物技术中培养微生物具有重要意义。尽管单个限制性资源可以被单独研究，但有证据表明，微生物常常同时受到多种资源的限制，即“营养共限制”（colimitation）。然而，由于缺乏定量测量营养共限制的方法，以及缺乏对资源条件的系统性测试，现有的数据难以解释和比较。因此，作者提出了一个假设：微生物在实验室和自然界中经常经历营养共限制，并且营养共限制是一个连续的状态，可以随着资源条件的变化而动态变化。 论文来源 这篇论文由Noelle A. Held、Asw...

细菌整流中的运输与能量学研究 学术背景 在自然界中，许多生物系统依赖于微观粒子的定向运动来实现其功能。例如，分子马达（如驱动蛋白）在微管上的单向运动是细胞内部物质运输的关键机制。然而，这种定向运动的产生机制及其能量学特性仍然是一个未完全解决的问题。特别是在非平衡态系统中，如何通过不对称的几何结构将随机运动的活性粒子（如细菌）转化为定向运动，是一个具有基础科学意义和潜在技术应用的研究课题。 细菌整流（bacterial rectification）是指通过不对称的几何结构（如漏斗形障碍物）将随机游动的细菌转化为定向运动的过程。这一现象不仅有助于理解活性物质（active matter）的对称性破缺机制，还在生物技术应用中具有广泛的前景，如细胞分选、微流控泵送和货物运输等。尽管已有大量研究探讨了...

新辅助溶瘤病毒OrienX010联合抗PD-1抑制剂特瑞普利单抗治疗可切除肢端黑色素瘤：I期b临床试验 背景 肢端黑色素瘤（Acral Melanoma, AM）是一种侵袭性较强的黑色素瘤亚型，在中国人群中发病率较高，占黑色素瘤病例的约40%。尽管近年来黑色素瘤的治疗取得了一定进展，但现有的免疫疗法对AM的疗效有限，且缺乏有效的新辅助治疗方案。AM独特的低肿瘤突变负荷（TMB）和免疫抑制状态使其对单一抗PD-1治疗反应率低，生存期较短。 近年来，新辅助免疫治疗被认为比单纯术后辅助治疗更能诱导强大的免疫应答，改善患者的无病生存期（DFS）和总生存期（OS）。溶瘤病毒治疗则通过改造“免疫冷”肿瘤微环境为“免疫热”状态，为免疫检查点抑制剂（ICI）的协同治疗提供可能性。然而，AM对目前溶瘤病毒单药...

持续性NRG1 III型在SOD1G93A小鼠中过表达对ALS相关病理的影响 背景与研究动机 肌萎缩性侧索硬化症（Amyotrophic Lateral Sclerosis, ALS）是一种影响上运动神经元和下运动神经元的毁灭性神经退行性疾病，导致逐步的肌肉麻痹和最终的死亡。当前没有能够显著延缓或阻止ALS病程的有效治疗方法。尽管多个ALS小鼠模型（如携带突变SOD1基因的小鼠）在药物研发中发挥了重要作用，但其在临床试验中的转化效果有限。ALS的复杂发病机制是导致这一问题的主要原因。 作为一种表皮生长因子样的生长因子，Neuregulin-1（NRG1）具有多效性调节功能，并在神经系统中发挥重要作用，如髓鞘形成和突触发生等。尽管病毒介导的NRG1 III型基因治疗在某些ALS小鼠模型中展现出...