原发性家族性脑钙化症患者中引入上游开放阅读框的变异

研究背景及问题陈述 原发性家族性脑钙化症(Primary Familial Brain Calcification, PFBC)是一种罕见的神经系统疾病,表现为基底神经节和其他脑区的微血管钙化。尽管目前已经确定了至少六个与PFBC相关的基因(包括SLC20A2、XPR1、PDGFB、PDGFRB、MYORG和JAM2),但仍有超过50%的患者的致病原因尚不明确。这些未解释的病例可能包含在已知基因的非编码区中的隐匿变异。 研究人员假设,5’非翻译区(untranslated region, UTR)中的变异可能会引入AUG密码子,从而启动mRNA的翻译,导致某些PFBC基因的功能丧失。为验证这一假设,研究团队对113名与PFBC相关的探针的外显子测序数据进行了重新注释,并发现了PDGFB基因5...

人类基因组中的广泛特殊阴阳单倍型

人类基因组中普遍存在的独特阴阳单倍型 研究背景 在基因组学的研究中,阴阳单倍型(yin yang haplotypes)指的是在每个位点上均不同的两种单倍型对。此前已有一些独立的报告指出存在独特的阴阳单倍型,但并未进行系统性的搜索。因此,为了更好地理解阴阳单倍型在整个基因组中的分布和形成机制,本研究对整个基因组进行了详细而系统的搜索。 研究来源 本文由David Curtis和William Amos撰写,分别来自UCL Genetics Institute和Department of Zoology, University of Cambridge。本文于2023年6月12日在线发表在European Journal of Human Genetics上。 研究流程 样本获取与准备: - ...

宫颈人乳头瘤病毒(HPV)感染的基因组、HLA及多基因风险评分分析

关于宫颈高风险人乳头状瘤病毒(hrHPV)感染的全基因组和多基因风险评分分析 背景介绍 宫颈高风险人乳头状瘤病毒(hrHPV)感染是全球第二大致癌性感染,约占所有感染相关癌症的31.4%(全球220万例癌症中约69万例)。大多数的HPV感染在初次性接触后不久发生,并且超过90%的感染在两年内自行清除。然而,持续存在的HPV感染是引发肛门生殖器和口咽癌的必要但非充分条件。 尽管环境因素(如吸烟、长期使用激素避孕药、HIV共感染等)对HPV感染的持续性和清除有显著影响,但有多项观察表明遗传因素也可能在HPV感染的盛行和持续性中发挥重要作用。然而,目前关于宫颈HPV感染相关的基因变异研究仍较少。 研究来源 该论文署名为:Sally N. Adebamowo, Adebowale Adeyemo, ...

ADNP基因功能缺失突变导致Helsmoortel-van der Aa综合征

在对由ADNP基因变异引起的Helsmoortel-Van der Aa综合征(HVDAS)进行研究的基础上,D’Incal等人在《European Journal of Human Genetics》杂志上发表了一篇深入的研究论文。通过对一个五岁女孩的病例研究,该团队发现了ADNP第一个编码外显子的剪接受体位点的三碱基对缺失。该研究极大地推进了我们对HVDAS的病因学理解,并展示了以往针对基因编码区的外显子测序技术在某些情况下诊断失败的原因。 研究课题的设置基于一个核心观念,即ADNP蛋白是大脑发育过程中的关键因子,但各种由于ADNP基因变异导致的蛋白功能损失在病理层面上如何作用尚不明确。ADNP基因变异通常与自闭症、智力障碍、发育迟缓等症状相关,因此其功能丧失或变异蛋白的潜在作用对疾病的...

遗传性听力损失中的遗传异质性:Kinociliary蛋白TOGARAM2的潜在作用

遗传性听力损失中的基因多样性:KINOCILIARY蛋白TOGARAM2的潜在作用 背景介绍 听力损失(Hearing Loss, HL)是一种病因众多的特征,目前研究已经发现超过200个基因中的致病变异与HL相关。尽管已有广泛研究,但超过三分之一的家族中仍无法找到致病原因,这给基因分析带来了极大的挑战,在多基因家族中尤其明显。多个不同基因变异可能导致不同个体,即使是同一个家系中的各成员,各自的致病原因也不尽相同。因此,寻找更多潜在的耳聋致病变异至关重要。 论文来源 本文研究由Memoona Ramzan、Mohammad Faraz Zafeer、Clemer Abad、Shengru Guo等学者完成,研究所属机构分别包括美国迈阿密大学、德国Göttingen大学等。论文发表在2024年...

Mowat-Wilson综合症的DNA甲基化特征识别

识别Mowat-Wilson综合征的DNA甲基化特征 背景介绍 Mowat-Wilson综合征(MOWS)是一种罕见的神经发育障碍,由ZEB2基因的杂合性缺失或功能丧失突变引起。该基因编码一种转录因子,参与神经发育。患有MOWS的个体常表现出中度到重度的全球发育延迟、智力障碍、癫痫和典型的面部表型。此外,还可能存在短身材、Hirschsprung病、大脑和心脏异常等。然而,该综合征的罕见性和表型多样性使得其在新生儿期的诊断更具挑战性。为了解决这一问题,科研人员开展了研究,旨在通过识别一种新的诊断生物标志物来简化MOWS的诊断过程。 论文来源 这项研究由Stefano Giuseppe Caraffi、Liselot van der Laan、Kathleen Rooney等科研人员共同完成,...