Le voyage nucléaire de VCP : Initié par l'interaction avec KPNB1 pour réparer les dommages à l'ADN

Chimie, Chimie pharmaceutique, Médecine, Oncologie, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie, Immunologie, Génétique,
Réparation des dommages à l'ADN   VCP   KPNB1   translocation nucléaire   Withaferin A  

Contexte académique La réparation des dommages à l’ADN (DDR, DNA Damage Repair) est un mécanisme central pour maintenir la stabilité du génome, et son dysfonctionnement est étroitement lié au développement du cancer. La protéine Valosin-containing protein (VCP/p97), membre de la famille des AAA+ ATPases, joue un rôle clé dans le processus de DDR en...

Amélioration de la dynamique de la synapse accompagnant la stabilité méiotique chez les autotétraploïdes d'Arabidopsis arenosa

Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Génétique, Botanique,
polyploïdie   méiose   dynamique de la synapse   appariement des chromosomes   croisement   duplication du génome   évolution  

Contexte de la recherche La méiose (meiosis) est un processus central de la reproduction sexuée chez les eucaryotes, produisant des gamètes haploïdes via l’appariement des chromosomes homologues (pairing), la synapsis (synapsis) et les échanges croisés (crossover). La polyploïdisation (polyploidy) est un moteur important de l’évolution des plantes,...

Analyse spatiale quantitative des condensats biomoléculaires de chromatine par cryo-tomographie électronique

Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie, Génétique, Biophysique,
Cryo-tomographie électronique   Condensat biomoléculaire   Chromatine   Séparation de phase   Nucléosome  

Contexte académique Les condensats biomoléculaires (biomolecular condensates) sont des organites sans membrane formés par séparation de phases liquide-liquide (LLPS) dans les cellules, jouant un rôle crucial dans des processus biologiques clés tels que l’expression génique et la transduction du signal. Cependant, en raison des limitations des techn...

Protocole de résolution de problèmes : Prédiction précise de la séparation de phase au niveau des résidus à l'aide d'incorporations de modèles de langage et de conformation de protéines

Sciences de la vie, Biochimie, Génétique, Biophysique,
séparation de phase   modèle de langage   prédiction au niveau des résidus   incorporations conformationnelles   régions intrinsèquement désordonnées  

I. Contexte académique et importance de la recherche Ces dernières années, la séparation de phase liquide-liquide des protéines (phase separation, PS), en tant que mécanisme clé de régulation des biomolécules intracellulaires, a suscité une vaste attention dans le domaine des sciences de la vie. La séparation de phase ne favorise pas seulement la f...

Chrombus-XMBD : un modèle de convolution graphique prédictif du génome 3D à partir des caractéristiques de la chromatine

Sciences de l'information, Informatique, Intelligence artificielle, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Génétique, Biophysique,
génome 3D   modèle de convolution graphique   caractéristiques de la chromatine   interaction à longue distance   généralisabilité du modèle  

Contexte de la recherche et importance disciplinaire Dans les cellules eucaryotes, la structure spatiale tridimensionnelle de la chromatine joue un rôle essentiel dans la régulation de l’expression génique. Grâce à des repliements complexes, la formation de boucles et des réorganisations locales, l’ADN permet à différents éléments géniques (tels qu...

Évaluation comparative des outils d'inférence des aberrations du nombre de copies à l'aide de jeux de données multi-omiques à cellule unique

Sciences de l'information, Intelligence artificielle, Médecine, Oncologie, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Génie biologique, Génétique,
Séquençage ARN unicellulaire   Aberrations du nombre de copies   Hétérogénéité tumorale   Évaluation comparative   Multi-omiques  

I. Contexte et importance de la recherche Dans les domaines de l’oncologie et de la génomique, les altérations du nombre de copies chromosomiques (Copy Number Alterations, CNAs) représentent un type de variation génétique clé qui conduit à la survenue et à la progression du cancer. Les CNAs déterminent non seulement l’hétérogénéité tumorale, mais s...