Identification des gènes du cancer par l'intégration d'un modèle de langage causal avec l'inférence causale basée sur les données omiques

Sciences de l'information, Intelligence artificielle, Médecine, Oncologie, Sciences de la vie, Biochimie, Génétique,
gènes du cancer   causalité   modèle de langage   multi-omique   apprentissage causal  

L’identification précise des gènes du cancer constitue une difficulté centrale dans la recherche fondamentale du cancer et dans le domaine de la médecine de précision. Récemment, une équipe de recherche de l’Université du Jilin et de l’Université des Sciences et Technologies du Zhejiang a publié dans la revue Briefings in Bioinformatics un article ...

Test et dépassement des limites de l'analyse de réponse modulaire

Sciences de l'information, Informatique, Intelligence artificielle, Sciences de la vie, Génie biologique, Génétique,
Analyse de réponse modulaire   Régression   Inférence de réseau   Manque d'ajustement   Optimisation convexe   mraregress  

Contexte de la recherche : nouveaux défis dans l’inférence des réseaux Dans le domaine moderne de la biologie moléculaire et de la biologie des systèmes, l’analyse précise des réseaux biomoléculaires (tels que les réseaux de régulation génique, d’interactions protéine-protéine ou de transduction de signaux) est considérée comme essentielle pour com...

Ensembles de référence régulièrement mis à jour pour des évaluations statistiquement correctes des applications d'AlphaFold

Sciences de l'information, Intelligence artificielle, Sciences de la vie, Biochimie, Génétique, Biophysique,
AlphaFold   fuite de données   structure protéique   ensemble de référence   prédiction de structure  

Un nouveau chapitre académique dans la prédiction des structures protéiques La résolution de la structure des protéines reste l’un des défis fondamentaux de la biologie moléculaire et des sciences de la vie. Les méthodes expérimentales traditionnelles telles que la cristallographie aux rayons X, la résonance magnétique nucléaire (RMN) et la cryo-mi...

Décrypter les amplificateurs des gènes de la perte auditive pour une thérapie génique ciblée et efficace de la surdité héréditaire

Médecine, Neurologie, Sciences de la vie, Génie biologique, Génétique,
perte auditive   thérapie génique   surdité héréditaire   amplificateurs   thérapie ciblée  

Contexte académique La surdité héréditaire est l’un des troubles sensoriels les plus répandus dans le monde, affectant plus de 400 millions de personnes, dont environ 60 % des cas de surdité congénitale sont liés à des facteurs génétiques. Bien que la thérapie génique médiée par le virus adéno-associé (AAV) montre un énorme potentiel dans le traite...

Décoder les réponses hétérogènes des cellules uniques aux perturbations

Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie, Génie biologique, Génétique,
perturbation unicellulaire   expression génique   réponse cellulaire   transcriptomique   CRISPR  

Contexte En biologie cellulaire, comprendre les réponses différentes des cellules aux perturbations est crucial. Les perturbations (perturbation) désignent des modifications de l’état cellulaire par des méthodes telles que l’édition génétique, les substances chimiques, les changements environnementaux ou les forces mécaniques, afin d’étudier leurs ...

Reconstruction systématique des signatures de voies moléculaires à l'aide de criblages de perturbation unicellulaires évolutifs

Médecine, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Génie biologique, Immunologie, Génétique,
séquençage unicellulaire   réseaux de régulation génique   interférence CRISPR   génomique fonctionnelle   voies de signalisation  

Dans le domaine de la génomique fonctionnelle, les chercheurs s’efforcent de prédire les relations de régulation causales à partir de données d’observation. Cependant, bien que les technologies modernes permettent de mesurer diverses modalités moléculaires, l’inférence des relations de régulation causales à partir de données d’observation reste un ...