Utilisation de données fonctionnelles multiplexées pour réduire les inégalités de classification des variants dans les populations sous-représentées

Réduction des inégalités dans la classification des variantes chez les populations sous-représentées grâce à des données fonctionnelles multiplexées. Références de l’article Dawood et al., Genome Medicine (2024) 16:143. DOI : https://doi.org/10.1186/s13073-024-01392-7 Résumé du rapport Introduction Dans le domaine de la médecine génomique, une des ...

Identification complète des agents pathogènes et prédiction de la résistance aux antimicrobiens à partir de cultures sanguines positives en utilisant la technologie de séquençage par nanopores

Rapport académique sur l’article scientifique basé sur la technologie de séquençage nanopore pour l’identification des pathogènes des infections sanguines et la prédiction de la résistance aux antibiotiques Contexte académique Les infections sanguines (Bloodstream Infections, BSI) constituent une pathologie clinique grave et sont souvent diagnostiq...

Analyses intégrées de données multi-omiques révèlent la vulnérabilité métabolique comme nouvelle cible thérapeutique dans les métastases cérébrales du cancer du poumon

Analyse intégrative multi-omique des métastases cérébrales du cancer du poumon révélant la vulnérabilité métabolique comme une cible thérapeutique innovante Contexte académique Le cancer du poumon est l’un des cancers les plus courants et l’une des principales causes de mortalité liée au cancer dans le monde. Les métastases cérébrales du cancer du ...

Annotation génomique des guides CRISPR valide les cibles dans les lignées cellulaires variantes et améliore la découverte dans les criblages

annotation des guides CRISPR ciblant le génome à l’aide de l’algorithme EXORCISE Contexte académique La technologie CRISPR-Cas9 a révolutionné les criblages génétiques, notamment en analysant l’essentialité des gènes et les interactions chimio-génétiques. En programmant des ARN guides (gRNAs) pour cibler des séquences spécifiques du génome, ce syst...

Surveillance génomique des organismes multirésistants basée sur le séquençage à lecture longue

Contexte académique Les organismes multirésistants (Multidrug-Resistant Organisms, MDROs) représentent une menace majeure pour la santé publique mondiale. Ces micro-organismes, résistants à plusieurs classes d’antibiotiques, compliquent le traitement des infections et augmentent les charges médicales. Pour surveiller et contrôler efficacement leur ...

L'influence du CD30 sur la dynamique des cellules B du centre germinatif et l'expansion des cellules B commutées en IgG1

Impact de CD30 sur la dynamique des cellules B des centres germinatifs et l’expansion des cellules B commutées IgG1 Introduction CD30 (également connu sous le nom de TNFRSF8) est un membre de la superfamille des récepteurs du facteur de nécrose tumorale (TNF-R). Il a initialement été identifié comme un marqueur des lymphomes de Hodgkin. Cependant, ...

La kynurénine-AHR réduit l'infiltration des cellules T et induit une réponse immunitaire retardée des cellules T en supprimant l'axe STAT1-CXCL9/CXCL10 dans la tuberculose

Rapport académique La tuberculose (Tuberculosis, TB) est une maladie mondiale causée par Mycobacterium tuberculosis (Mtb), affectant chaque année des millions de personnes. Bien que des avancées significatives aient été réalisées dans le diagnostic et le traitement de la tuberculose, les mécanismes d’évasion immunitaire de Mtb restent une des raiso...

Rôles critiques et différentiels d'eIF4A1 et d'eIF4A2 dans le développement et la fonction des cellules B

Rôles Critiques et Différentiels de eIF4A1 et eIF4A2 dans le Développement et la Fonction des Cellules B Contexte Scientifique Dans les cellules des mammifères, l’initiation de la traduction est une étape clé de la synthèse protéique, et le facteur d’initiation eucaryote 4A (eukaryotic initiation factor 4A, eIF4A) joue un rôle crucial dans ce proce...

Mécanismes de la variation liée à l'âge dans la régénération des cellules immunitaires chez les individus

Avec le vieillissement des organismes, la fonctionnalité du système immunitaire diminue progressivement, se traduisant par une augmentation des cellules immunitaires innées (telles que les granulocytes) et une diminution des cellules immunitaires adaptatives (comme les cellules B). Ce déséquilibre du système immunitaire est étroitement lié à l’appa...

Cartographie des réseaux génétiques in silico du gène suppresseur de tumeur KMT2D pour découvrir de nouvelles associations fonctionnelles et vulnérabilités des cellules cancéreuses

Contexte académique et problématique Les mutations de perte de fonction (Loss-of-Function, LOF) des gènes suppresseurs de tumeurs (Tumour Suppressor Genes, TSGs) sont extrêmement fréquentes dans les cancers. Cependant, ces mutations entraînent une perte ou une déficience de la fonction des protéines codées, ce qui rend difficile leur ciblage thérap...