利用AlphaFold高通量发现抑制性蛋白质片段的研究

高精度预测蛋白片段抑制活性的新方法:FragFold的应用 学术背景 蛋白质相互作用在细胞生命活动中扮演着至关重要的角色,而小肽(peptides)或蛋白片段(protein fragments)可以通过与特定蛋白界面结合,调节蛋白功能,甚至作为抑制剂发挥作用。近年来,高通量实验技术的发展使得在活细胞中大规模测量蛋白片段的抑制活性成为可能。然而,迄今为止,尚未有相应的计算方法能够预测哪些蛋白片段能够与目标蛋白结合并发挥抑制作用,更不用说预测它们的结合模式。这一领域的研究空白促使研究人员开发新的计算工具来解决这一问题。 AlphaFold的推出为蛋白质结构预测带来了革命性的突破,但其在预测蛋白片段与全蛋白结合方面的应用仍然有限。为了填补这一空白,Andrew Savinov等研究人员开发了一种...

ω-3脂肪酸对2型糖尿病患者高甘油三酯血症、脂质组学及肠道微生物组的影响

Omega-3脂肪酸对2型糖尿病患者的血脂及肠道菌群影响研究 背景介绍 2型糖尿病(Type 2 Diabetes, T2D)是全球范围内一种常见的代谢性疾病,常伴随血脂异常,如高甘油三酯血症(Hypertriglyceridemia, HTG)。血脂异常是心血管疾病(Cardiovascular Disease, CVD)的重要风险因素,尤其是高甘油三酯(Triglycerides, TG)水平与心血管事件的发生密切相关。尽管他汀类药物在控制胆固醇方面取得了显著效果,但高甘油三酯血症仍是一个亟待解决的临床问题。 Omega-3脂肪酸,尤其是富含于鱼油中的二十碳五烯酸(Eicosapentaenoic Acid, EPA)和二十二碳六烯酸(Docosahexaenoic Acid, DHA)...

锌治疗GNAO1脑病的临床前研究及临床案例

GNAO1(G蛋白α亚基O1)基因突变被认为是导致严重儿童脑病的主要原因之一。这种脑病通常表现为癫痫、运动障碍、发育迟缓和智力障碍等,且现有的治疗方法效果有限。GNAO1基因编码的GαO蛋白是神经元信号传导的关键蛋白,其突变会导致信号传导异常,进而引发一系列神经系统疾病。尽管已有研究表明锌盐(zinc salts)可以部分纠正GNAO1突变蛋白的功能异常,但其具体作用机制及临床应用的安全性尚未得到充分验证。 本文旨在通过系统的临床前研究和首例人体试验,验证锌盐在治疗GNAO1相关脑病中的有效性和安全性,并探索不同突变类型对锌盐的响应差异,为未来的大规模临床试验提供科学依据。 论文来源 本文由Yonika A. Larasati、Moritz Thiel、Alexey Koval、Denis ...

G-四联体通过重塑能量景观催化蛋白质折叠

G-四链体催化蛋白质折叠的研究报告 学术背景 蛋白质折叠是生物体内一个复杂且尚未完全解决的难题。许多蛋白质在体外(in vitro)的折叠速度非常缓慢,远远超过了生理条件下的可接受时间范围。为了应对这一挑战,ATP(腺苷三磷酸)依赖的分子伴侣(chaperonins)被认为能够加速蛋白质折叠,使其在生理时间内完成。然而,这种能力是否仅限于ATP依赖的伴侣蛋白仍是未解之谜。本研究的核心问题是探索是否存在其他分子能够像ATP依赖的伴侣蛋白一样,催化蛋白质折叠,从而帮助细胞在更短的时间内完成蛋白质折叠。 G-四链体(G-quadruplexes, G4s)是由富含鸟嘌呤(guanine)的核酸序列形成的四链结构,在真核生物中,G-四链体在应激条件下形成,并在应激解除后解离。近年来的研究表明,G-四...

利用小波识别金融价格跳跃的新分类

基于小波分析识别金融价格跳跃的新类别研究报告 学术背景 金融市场中的价格跳跃(price jumps)是指在极短时间内价格发生显著波动的现象,通常由外生因素(如突发新闻)或内生因素(市场内部反馈机制)引起。区分这两种不同类型的价格跳跃对于理解市场动态、预测极端事件以及制定有效的监管策略至关重要。然而,现有的研究方法多依赖于监督学习,需要明确的标签(如新闻事件)来分类跳跃,这在实际应用中存在局限性,因为许多价格跳跃可能并没有明确的新闻背景。 为了更好地识别和分类价格跳跃,特别是那些没有明显外生触发的内生跳跃,研究人员提出了一种无监督的分类框架,利用多尺度小波表示(multiscale wavelet representation)来分析时间序列。这一框架不仅能够捕捉价格跳跃的时间不对称性(ti...