高精度预测蛋白片段抑制活性的新方法：FragFold的应用 学术背景 蛋白质相互作用在细胞生命活动中扮演着至关重要的角色，而小肽（peptides）或蛋白片段（protein fragments）可以通过与特定蛋白界面结合，调节蛋白功能，甚至作为抑制剂发挥作用。近年来，高通量实验技术的发展使得在活细胞中大规模测量蛋白片段的抑制活性成为可能。然而，迄今为止，尚未有相应的计算方法能够预测哪些蛋白片段能够与目标蛋白结合并发挥抑制作用，更不用说预测它们的结合模式。这一领域的研究空白促使研究人员开发新的计算工具来解决这一问题。 AlphaFold的推出为蛋白质结构预测带来了革命性的突破，但其在预测蛋白片段与全蛋白结合方面的应用仍然有限。为了填补这一空白，Andrew Savinov等研究人员开发了一种...
Omega-3脂肪酸对2型糖尿病患者的血脂及肠道菌群影响研究 背景介绍 2型糖尿病（Type 2 Diabetes, T2D）是全球范围内一种常见的代谢性疾病，常伴随血脂异常，如高甘油三酯血症（Hypertriglyceridemia, HTG）。血脂异常是心血管疾病（Cardiovascular Disease, CVD）的重要风险因素，尤其是高甘油三酯（Triglycerides, TG）水平与心血管事件的发生密切相关。尽管他汀类药物在控制胆固醇方面取得了显著效果，但高甘油三酯血症仍是一个亟待解决的临床问题。 Omega-3脂肪酸，尤其是富含于鱼油中的二十碳五烯酸（Eicosapentaenoic Acid, EPA）和二十二碳六烯酸（Docosahexaenoic Acid, DHA）...
GNAO1（G蛋白α亚基O1）基因突变被认为是导致严重儿童脑病的主要原因之一。这种脑病通常表现为癫痫、运动障碍、发育迟缓和智力障碍等，且现有的治疗方法效果有限。GNAO1基因编码的GαO蛋白是神经元信号传导的关键蛋白，其突变会导致信号传导异常，进而引发一系列神经系统疾病。尽管已有研究表明锌盐（zinc salts）可以部分纠正GNAO1突变蛋白的功能异常，但其具体作用机制及临床应用的安全性尚未得到充分验证。 本文旨在通过系统的临床前研究和首例人体试验，验证锌盐在治疗GNAO1相关脑病中的有效性和安全性，并探索不同突变类型对锌盐的响应差异，为未来的大规模临床试验提供科学依据。 论文来源 本文由Yonika A. Larasati、Moritz Thiel、Alexey Koval、Denis ...
G-四链体催化蛋白质折叠的研究报告 学术背景 蛋白质折叠是生物体内一个复杂且尚未完全解决的难题。许多蛋白质在体外（in vitro）的折叠速度非常缓慢，远远超过了生理条件下的可接受时间范围。为了应对这一挑战，ATP（腺苷三磷酸）依赖的分子伴侣（chaperonins）被认为能够加速蛋白质折叠，使其在生理时间内完成。然而，这种能力是否仅限于ATP依赖的伴侣蛋白仍是未解之谜。本研究的核心问题是探索是否存在其他分子能够像ATP依赖的伴侣蛋白一样，催化蛋白质折叠，从而帮助细胞在更短的时间内完成蛋白质折叠。 G-四链体（G-quadruplexes, G4s）是由富含鸟嘌呤（guanine）的核酸序列形成的四链结构，在真核生物中，G-四链体在应激条件下形成，并在应激解除后解离。近年来的研究表明，G-四...
学术背景 在细胞生物学中，黏着斑（focal adhesions, FAs）是细胞与细胞外基质（ECM）之间的关键连接点，它们通过整合素受体与细胞内的肌动蛋白骨架相连，在细胞迁移和极化过程中发挥重要作用。Talin是黏着斑中的核心蛋白，直接连接整合素受体和肌动蛋白骨架。Talin蛋白含有三个肌动蛋白结合位点（actin-binding sites, ABSs），这些位点在黏着斑的形成和成熟过程中发挥着不同的作用。然而，关于Talin与肌动蛋白（F-actin）相互作用的分子机制，尤其是Talin的ABSs如何与肌动蛋白结合，尚未完全清楚。为了更好地理解Talin在细胞黏附和迁移中的作用机制，研究人员通过冷冻电镜（cryo-EM）技术，解析了Talin的ABSs与肌动蛋白复合物的高分辨率结构，...
人γD-晶状体蛋白变异体在天然条件下的部分未折叠中间体的研究 学术背景 人γD-晶状体蛋白（γD-crystallin）是眼睛晶状体中的一种结构蛋白，对于维持晶状体的透明性和稳定性至关重要。它需要在整个生命周期内保持折叠状态，以避免聚集和蛋白质沉积，进而防止白内障的形成。然而，一些与先天性白内障相关的γD-晶状体蛋白变异体在天然条件下会形成部分未折叠的中间体，这可能导致蛋白质聚集和白内障的形成。为了更好地理解这些变异体的能量景观（energy landscape）及其在白内障形成中的作用，研究人员使用了氢-氘交换质谱（Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry, HDX-MS）技术，研究了这些变异体在天然和部分变性条件下的结构和能量特征。 论文...