细胞信号反应与运输的空间建模算法研究 背景介绍 生物细胞通过复杂的生化反应网络来实现其功能。这些反应网络具有显著的时空动态性，且在细胞的不同区域和亚细胞结构中存在显著的空间分异（spatial compartmentalization）。然而，传统的细胞信号传导模型通常将细胞视为一个均匀混合的体系，忽略了空间效应对反应和运输过程的影响。这种简化虽然在特定情况下有效，但在许多实际场景中会降低模型的预测能力。例如，信号分子的扩散速度较慢、细胞内环境拥挤、细胞结构的复杂性等都会导致空间效应的显著影响。因此，开发能够精确模拟细胞信号传导和运输过程的计算模型成为生物计算科学领域的重要挑战。 2025年1月发表在 Nature Computational Science 期刊上的一篇研究论文，提出了名为...

深度学习应用于目标蛋白配体生成的最新研究：DeepBlock框架的提出与验证 背景与研究问题 药物发现过程中，寻找能够结合特定蛋白的配体分子（ligand）一直是核心目标。然而，目前的虚拟筛选方法（virtual screening）通常受限于化合物库的规模和化学空间的广度，难以在大规模化学空间中发现符合目标特性的创新化合物。相比之下，去新药设计（de novo drug design）通过从头生成分子结构，为探索现有化合物库之外的化学空间提供了崭新的可能性。 近年来，深度生成模型（deep generative models）在化学分子生成领域取得了显著进展，包括自回归模型（autoregressive models）、变分自编码器（variational autoencoders, VA...

新型直肠泡沫制剂在炎症性肠病治疗中的应用研究 近年来，炎症性肠病（inflammatory bowel disease, IBD）的发病率逐渐上升，该病以肠道粘膜损伤、慢性炎症及复发性发作为主要特征，目前仍缺乏一种理想的治疗手段。研究人员发现了一种名为胰高血糖素样肽-2（glucagon-like peptide 2, GLP-2）的33氨基酸多肽，其具有刺激肠道生长、修复肠粘膜和增强上皮细胞完整性的功效。然而，GLP-2在体内仅有极短的半衰期（7分钟），使其在临床治疗中受到了极大的限制。为解决这一难题，研究者们开发了一种GLP-2的长效类似物——Glepaglutide（GL），其通过氨基酸替换显著延长了体内半衰期（达50小时）。但由于Glepaglutide需通过皮下注射给药，这给患者的...

肾纤维化的机制与研究模型：迈向更接近人体生理的模型 研究背景与问题陈述 慢性肾脏病（Chronic Kidney Disease, CKD）是全球范围内的重大公共健康问题，据估计其影响了超过10%的人口，是导致死亡的主要原因之一。肾纤维化（kidney fibrosis）作为CKD的关键病理终点，对肾单位（nephrons）结构和功能造成破坏，但目前对其病理机制的理解尚不完全。多数针对肾纤维化的研究使用动物模型进行，这些模型尽管揭示了一些潜在机制，但由于其在生理、代谢和分子途径上无法完全模拟人体肾脏，导致在药物和疗法开发的跨物种转化研究中存在显著局限性。此外，传统的二维细胞培养模型尽管作为疾病研究和药物筛选的起点，但由于缺乏三维的高级肾脏生物架构和功能，也难以满足研究需求。这些因素催生了开发...

静注巨噬细胞膜伪装纳米酶靶向治疗急性肾损伤的创新研究报告 背景介绍 急性肾损伤（Acute Kidney Injury, AKI）是一种严重的临床综合症，其特征是肾功能的快速下降，并与高发病率和死亡率密切相关。统计数据显示，AKI在住院患者中的发生率为10%-15%，而在重症监护病房（ICU）中则超过50%，每年全球导致超过200万例死亡。除了直接威胁生命，AKI还会使患者易感于慢性肾病（Chronic Kidney Disease, CKD）以及终末期肾病（End-Stage Renal Disease, ESRD）。然而，目前的AKI治疗方式依然缺乏有效性，无法修复受损肾组织。因此，开发创新性的治疗方法以更好地解决AKI背后的病理机制，是当前医学研究的一个重要方向。 缺血再灌注损伤（Is...

多功能水凝胶促进感染性伤口愈合的全新研究 在当前临床环境中，感染性伤口尤其是抗生素耐药性病原体感染的伤口，已经成为一种重大挑战。这些慢性性或难以愈合的伤口常常由于炎症过度、细菌生物膜的形成以及抗生素疗效下降而延误愈合进程。然而，现有的治疗手段，如抗生素治疗和传统伤口敷料，难以同时解决感染、抗生素耐药及其他组织再生相关问题。基于此背景，多功能性水凝胶因为其类细胞外基质的三维结构，成为一种具有潜力的先进伤口敷料。然而，如何实现在简单、低成本制备的条件下，赋予水凝胶抗菌、抗炎、抗氧化、自愈合性以及体内生物相容性，仍然是一个未解决的科学问题。 最近，来自Fuzhou University和Fujian Medical University等研究机构的多位科学家，包括Minglang Zou和Da H...