解读《MassiveFold：通过优化和平行化大规模采样揭示AlphaFold潜在能力》 背景和研究问题 蛋白质结构预测是生命科学中重要的研究领域，对于揭示分子生物学的基本机制具有重要意义。近年来，DeepMind开发的AlphaFold在这一领域取得了革命性进展，其模型在预测单一蛋白质链的结构方面表现卓越，广泛应用于蛋白质组学研究。然而，随着研究需求的增加，AlphaFold在处理复杂蛋白质组装和抗原-抗体等特定相互作用时存在诸多局限，例如计算时间长、对GPU资源需求高等问题。此外，虽然通过增加预测中的循环次数和采样密度可以提升预测质量，但这些方法进一步加重了计算负担。 为应对上述挑战，本文的研究者提出了一个名为MassiveFold的新框架。MassiveFold通过优化算法和大规模采样...

脑卒中后长期癌症风险与表观遗传年龄的关联研究 研究背景与意义 癌症与卒中是全球范围内主要的致病与致死原因，二者之间的关联性已受到广泛关注。据统计，约6%的癌症患者在其生命周期内会经历卒中，而卒中患者罹患癌症的风险则是普通人群的两倍。此外，有研究表明，卒中（无论是缺血性还是出血性）可能会先于癌症的诊断。这种复杂的病理关系凸显了理解其潜在机制的必要性。 DNA甲基化（DNA methylation, DNAm）作为表观遗传研究的核心领域，通过对特定CpG位点的甲基化状态评估，可以构建表观遗传时钟（epigenetic clocks），从而准确预测个体的生物年龄（biological age, B-age）。研究显示，加速的生物年龄与癌症和卒中等疾病的发生风险显著相关。然而，关于卒中后癌症风险与生...

肺腺癌中凋亡小体清除特性及其预后与免疫治疗的关联研究 背景与研究动机 肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因，其中肺腺癌（Lung Adenocarcinoma，LUAD）是最常见的组织学亚型。由于疾病的隐匿性和缺乏特异性，大多数肺癌患者确诊时已处于晚期，传统治疗方式（如手术、放疗和化疗）的疗效有限，患者总体生存率较低。近年来，免疫治疗尤其是免疫检查点抑制剂（Immune Checkpoint Inhibitors，ICIs）为非小细胞肺癌（NSCLC）患者带来了希望，但其疗效仍受限于肿瘤微环境（Tumor Microenvironment，TME）的免疫抑制作用。 凋亡小体清除（Efferocytosis，ER）是由吞噬细胞清除凋亡细胞的生物过程，在肿瘤进展中起关键作用。研究表明，ER促进肿瘤免...

BRCA1/2 基因携带者肿瘤分析：在不同时间点显现基因组相似性 乳腺癌（Breast Cancer, BC）是全球女性中最常见的恶性肿瘤，其发病机制多为散发性，而家族性遗传病例仅占5%到10%。在众多致病分子中，BRCA1/2 基因突变（Pathogenic Gene, PG）因其高渗透性成为遗传性乳腺/卵巢癌综合征研究的重点。这些基因突变显著提高了女性罹患乳腺癌和卵巢癌的终生风险，分别高达38%至87%和16.5%至73%。此外，BRCA1/2 突变还与其他癌症类型相关，包括胰腺癌、胃癌和前列腺癌。 本文作者团队包括 Tal Falick Michaeli、Avital Granit Mizrahi 等，他们隶属于以色列 Hebrew University 和 Hadassah Medi...

肺腺癌中与放射抗性相关的端粒基因在预后和免疫浸润中的影响 肺腺癌（Lung Adenocarcinoma, LUAD）是非小细胞肺癌（NSCLC）的一种常见亚型，具有较高的发病率和死亡率。尽管近年来在早期检测和治疗方面取得了显著进展，LUAD患者的总体生存率仍不尽如人意。这种局面促使研究者不断探索新的生物标志物和治疗靶点。本文发表于《Cancer Cell International》杂志，由上海肺科医院和同济大学医学院的研究团队完成，旨在揭示与放射抗性相关的端粒基因（Radioresistant-related Telomere Genes, RRTGs）在LUAD预后和免疫浸润中的作用。 研究背景 端粒（Telomeres）是位于染色体末端的重复DNA序列，对染色体的稳定性具有重要作用。...

长期静脉注射抗CD20抗体治疗对法国多发性硬化患者的疗效评估 背景与研究动机 多发性硬化（Multiple Sclerosis, MS）是一种影响中枢神经系统的慢性炎症性脱髓鞘疾病，导致不同程度的身体和认知功能障碍。近年来，靶向B淋巴细胞CD20抗原的选择性静脉注射（Intravenous, IV）B细胞消耗疗法（B-Cell Depleting Therapy, BCDT）的二、三期临床试验显著改变了复发型多发性硬化（Relapsing MS, RMS）以及活动性进展型多发性硬化（Progressive MS, PMS）的治疗格局。然而，对于长期BCD疗法持续B细胞耗竭如何影响临床和影像学稳定性的问题，研究相对有限。 尽管已有部分研究探讨了减少BCD剂量或延长BCD剂量间隔的可能性，但在多...