基于下一代测序的乳腺癌聚合风险评分位点基因分型局限性 背景介绍 在遗传性乳腺癌（Breast Cancer, BC）的预测中，多基因风险评分（Polygenic Risk Scores, PRSs）正在日益广泛地应用，作为个体风险预测的一个重要工具。PRS的计算依赖于精确再现变异等位基因频率（Allele Frequencies, AFs），从而准确地预测PRSS的值。然而，目前使用下一代测序技术（Next-Generation Sequencing, NGS）进行多基因风险评分基因型分析时，存在不少技术上的限制。本研究的背景在于这些技术挑战，对改进和优化乳腺癌风险评估模型具有重要意义。 研究来源及作者背景 本研究由来自德国遗传性乳腺癌和卵巢癌联盟（German Consortium for...

通过计算方法提高对PAX6基因错义变异的解释 背景介绍 PAX6基因是一种高度保守的转录因子，在眼睛发育中起着重要作用。PAX6的杂合失功能变异可导致一系列眼科疾病，包括无虹膜症。然而，许多PAX6基因的错义变异目前被分类为不确定意义的变异（VUS），这对分子诊断提出了重大挑战。虽然计算工具可以用来评估基因变异的影响，但其预测的准确性有所不同。在这项研究中，作者们评估和优化了计算预测工具在PAX6错义变异方面的性能。 来源介绍 这篇文章由Nadya S. Andhika、Susmito Biswas、Claire Hardcastle等人完成，来自曼彻斯特大学生物科学学院进化、感染与基因组学研究所，曼彻斯特大学附属NHS基金会信托，欧洲分子生物学实验室（EMBL-EBI）等多个机构。这篇论文...

结构变异检测及在6224个未解决的罕见病外显子中的临床解释 研究背景 罕见病的诊断与研究一直是遗传学和临床医学的重要挑战。结构变异（SVs），包括大片段缺失、重复、倒位、易位以及更复杂的事件，均可能破坏基因功能，导致罕见疾病。然而，目前的外显子测序（ES）在处理小体内变异如单核苷酸变异（SNVs）和短于50个碱基对的插入-缺失（indels）方面的分析流程，对于SVs则尚不成熟。本研究旨在提高诊断率，尤其是通过检测和解释ES数据中的SV来解决尚未诊断出的罕见病病例。 研究来源 本研究由German Demidov, Steven Laurie等人联合完成，涉及来自不同研究机构的专家学者共同努力。文章发表于2024年在《European Journal of Human Genetics》上，...

荷兰药理遗传学工作组抗癫痫药物CYP2C9、HLA-A和HLA-B基因-药物相互作用指南 背景介绍 药理遗传学（Pharmacogenetics, PGx）研究基因变异如何影响个体药物反应，其目的是利用这些知识指导药物选择和剂量，优化药物治疗，预防药物不良反应，达到更安全和更具成本效益的药物治疗效果。尽管药理遗传学在全球医疗领域已有广泛认识，但其在日常临床实践中的应用仍面临挑战。 为了帮助临床医师实施药理遗传学，荷兰皇家药剂师协会（KNMP）于2005年成立了荷兰药理遗传学工作组（DPWG）。DPWG的目标是基于系统文献回顾开发药理遗传学指导剂量推荐，并将这些推荐整合到计算机化的药物处方、分发和自动化药物监控系统中。DPWG指南的双重目的是提供翻译PGx检测结果为预测表型所需的信息，并为在本...

POT1肿瘤易感性研究：更广泛的相关恶性肿瘤谱及附加筛查计划的建议 研究背景 POT1（Protection of Telomeres Protein 1）蛋白是Shelterin端粒结合复合体的重要组成部分，负责调节端粒长度。一些POT1基因的病理性变异（PV）会导致端粒延长、基因组不稳定以及癌症风险增加。POT1肿瘤易感性综合症（POT1-TPD）遗传模式为常染色体显性，且渗透率未知。它与皮肤黑色素瘤、慢性淋巴细胞白血病、血管肉瘤和胶质瘤的风险增加有关。此项研究旨在描述与POT1-TPD相关的更宽广的癌症表型。 研究来源 作者: Marta Baptista Freitas，Laurence Desmyter，Cindy Badoer，Guillaume Smits，Isabelle V...

Noonan综合征患者RAF1:c.770C>T p.(Ser257Leu)变异表型相关性研究报告 学术背景 Noonan综合征（Noonan syndrome, 简称NS）是最常见的RASopathy类疾病之一，这类疾病主要由于RAS蛋白和有丝分裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号转导通路的上调所致。这类疾病的特点包括面部畸形、先天性心脏缺陷（congenital heart defects, CHD）和肥厚型心肌病（hypertrophic cardiomyopathy, HCM）、生长障碍、骨骼和外胚层异常、淋巴系统发育不良、隐睾和神经发育迟缓/智力障碍（intellectual disability, ID）。 在NS患者中，肥厚型心肌病（HCM）是导致发病率和死亡率的主要因素。研究表明...