複数の先行知識を持つグラフニューラルネットワークによるマルチオミクスデータ分析

複数の先行知識を持つグラフニューラルネットワークによるマルチオミクスデータ分析

医学多組学データ分析における多重先験知識グラフニューラルネットワーク 背景紹介 精密医療は将来の医療保健において重要な分野であり、患者に個別化された治療計画を提供することにより、治療効果を改善しコストを削減します。例えば、乳がん患者の複雑な臨床、病理、および分子特性を考えると、同じ治療が異なる効果を示すことがあります。バイオ医学技術の急速な発展に伴い、多組学データを通じて疾病の特性化が可能になっています。多組学アプローチは単一組学アプローチに比べて、複数のデータ間で一貫性と補完的な情報を捉えることができ、より正確かつ深くモデルを構築することができます。例えば、がんゲノム図譜(The Cancer Genome Atlas, TCGA)は、mRNA 発現、DNA メチル化、およびコピー数変異(...

ヒストン3リジン9アセチル化特異的プログラムが食道扁平上皮癌の進行と転移を調節する

組織ヒストンH3のリジン9位アセチル化(H3K9ac)特異的再プログラミングの食道扁平上皮癌(ESCC)進展と転移における役割メカニズムに関する報告 背景説明 食道癌は世界的に最も普遍的で侵襲性の高い悪性腫瘍の一つであり、毎年50万人以上の癌関連死亡を引き起こし、癌による死亡原因の第6位を占めています。食道扁平上皮癌(ESCC)は全ての食道癌症例の約90%を占めており、主に東アジアおよびアフリカ地域の人々に影響します。近年、治療において顕著な進展がありましたが、ESCCの全体の5年生存率は依然として20%未満です。これは主に、ESCCの早期症状が不明瞭で、多くの患者が診断時には既に局所進行期かまたは局所リンパ節転移を伴っており、腫瘍病巣の再発または遠隔転移を招きやすく、最終的には致命的となる...

質粒遺伝子治療による腫瘍微小環境の修飾により免疫を強化

Guilan Shi、Jody Synowiec、Julie Singh、およびRichard Hellerで構成される研究チームは、『Cancer Gene Therapy』誌に「Modification of the tumor microenvironment enhances immunity with plasmid gene therapy」というタイトルの論文を発表しました。この論文の研究背景は、現在の腫瘍免疫療法分野における挑戦的な問題、例えば腫瘍細胞がMHC-I分子およびPD-L1の発現調節を通じて免疫監視を回避し、T細胞の殺傷作用を妨げることに起因しています。したがって、これらの分子の上方制御メカニズムおよびその応用可能性の研究は重要な臨床的意義を有します。 研究背景と動...

シュワン細胞由来のプレイオトロフィンが線維芽細胞の増殖と神経線維腫における過剰なコラーゲン堆積を刺激する

本文では、神経線維腫症1型(neurofibromatosis type 1, NF1)に関連する叢状神経線維腫(plexiform neurofibroma, PNF)におけるシュワン細胞と線維芽細胞の相互作用を探求しています。研究背景は、NF1の高発生率に基づいており、全世界で約1/3000の新生児に影響を及ぼしており、一連の特有な臨床症状を伴います。PNFはNF1患者において一般的な周囲神経鞘腫であり、約50%の患者がこの病にかかり、生活の質に大きな影響を与えます。数十年にわたる研究にもかかわらず、PNFは依然として治癒が困難です。現在の治療法は主にNF1関連のシュワン細胞に対して行われており、一部の臨床効果が得られています。しかし、多くの治療法、例えば選択的MEK阻害剤Selumet...

GRIN2A 突変は複数の癌における免疫チェックポイント阻害薬の受益者を層別化する新しい指標です

GRIN2A変異は多くのがんにおける免疫チェックポイント阻害剤の利益を享受する層別化の新しい指標である 背景紹介 免疫チェックポイント阻害剤(ICIs)治療は、細胞毒性Tリンパ球抗原4(CTLA-4)およびプログラム死(リガンド)1(PD-(L)1)経路を調節することにより、多くのがん治療において革命的な進展を遂げました。しかし、ICIsの有効性が顕著である一方で、異なる腫瘍患者間の臨床反応には依然として顕著な差異があります。そのため、ICI反応を予測する信頼できるバイオマーカーを識別することは、より精密な治療介入の開発において緊急課題となっています。現在の研究では、免疫チェックポイントのレベル、腫瘍変異負荷(TMB)、非整倍性スコア、挿入欠失変異、単一ヌクレオチド変異(SNV)の新抗原負荷...

インスリン受容体基質のNeddylationがインスリンサイニングの正規レギュレーターとしての役割と癌細胞の移動への影響

インスリン受容体基質のNEDD化におけるインスリン信号調節剤としての役割およびがん細胞移動への影響 学術背景 近年、がんと糖尿病との関連が注目を集めており、その主な原因は重複する病理的メカニズムおよび疫学的関連性にあります。疫学的研究によれば、2型糖尿病(T2DM)患者は膵がん、結腸直腸がん、前立腺がん、卵巣がんなど、複数のがんのリスクが顕著に増加することが示されています。インスリン調節異常は2型糖尿病の顕著な特徴であり、この異常はインスリン信号経路を妨げ、多くのがんの発展リスク要因とされています。 インスリン信号伝達の中で、インスリン受容体基質1と2(IRS1およびIRS2)は重要な役割を果たし、インスリンの効果が細胞内部に伝達されるプロセスの媒介者として機能します。がん細胞では、インスリ...