癌症は世界的に重大な公衆衛生上の課題であり、その発生および進展のメカニズムは極めて複雑です。長年にわたり、腫瘍微小環境（tumor microenvironment，TME）の免疫、炎症、血管新生などのプロセスが広く注目され、腫瘍の生物学的挙動の重要な決定要因と見なされてきました。近年、「がん神経科学（cancer neuroscience）」という新たな学際分野が誕生し、神経系が神経伝達物質や神経ペプチドなどによって腫瘍の発展を調節し、また神経－腫瘍細胞間の直接または間接的な相互作用を通じて、腫瘍の成長・転移・浸潤に影響することが明らかになってきました。「末梢神経浸潤（perineural invasion, PNI）」など神経関連現象が注目されているものの、腫瘍疾患における「神経浸潤」の...

癌遺伝子の正確な特定は、がん基礎研究および精密医療分野における核心的課題です。最近、吉林大学と浙江理工大学の研究チームは、『Briefings in Bioinformatics』誌に「Cancer gene identification through integrating causal prompting large language model with omics data–driven causal inference」というタイトルの独創的な研究論文を発表しました。本記事では、同論文の研究背景、学術的イノベーション、方法論的フロー、研究成果およびその深遠な意義を網羅的に整理します。 一、学術研究の背景 1. マルチオミクス癌遺伝子特定の必要性 がんは、世界的に死因トップの疾患の...

一、研究背景と学問的最前線 がん予後解析は、医学分野の中核的な研究テーマであり続けています。近年、ハイスループットシーケンシング技術（high-throughput sequencing technologies）が広く応用されたことで、科学者たちはがん患者の分子バイオマーカー（biomarker）や臨床的特徴をより深く探求できるようになりました。これにより、臨床医は患者の生存リスクをより正確に評価し、個別化された治療戦略を立てることが可能になりました。伝統的なCox比例ハザードモデル（Cox proportional hazards model）は、生存解析の古典的ツールとしてその優れた統計的基盤と適応性の高さから、がん予後研究で広く利用されています。 しかし、深層学習（Deep Lear...

学術的背景 生物発光技術（bioluminescence）は、外部光源を必要とせず、生体内でリアルタイムかつ高感度・非侵襲的なイメージングを可能にする技術です。ルシフェラーゼ（luciferase）は発光反応を触媒する鍵酵素ですが、天然のルシフェラーゼは、タンパク質の折り畳み不良、巨大な分子サイズ、ATP依存性、低い触媒効率など多くの限界を抱えています。これらの制約は、生物医学研究における生物発光技術の広範な応用を妨げてきました。近年、定向進化（directed evolution）などの方法で天然ルシフェラーゼを改良する試みも進められていますが、これらの限界を完全には克服できていません。 この課題を解決するため、研究チームは深層学習ベースのタンパク質設計手法を用い、de novo設計（fr...

背景紹介 フェロトーシス（Ferroptosis）は、鉄依存性の脂質過酸化によって引き起こされる細胞死の一種であり、近年、がん治療において大きな可能性があると考えられています。がん細胞は、さまざまな分子変化と代謝再プログラミングメカニズムを通じてフェロトーシスを回避します。その中で、グルタチオンペルオキシダーゼ4（GPX4）はフェロトーシスの主要な調節因子です。GPX4は、有毒な脂質過酸化物を無毒な脂質アルコールに変換し、脂質過酸化を防ぐことでフェロトーシスを抑制します。しかし、GPX4の安定性とがん細胞におけるその調節メカニズムは完全には理解されていません。 本研究は、がん細胞がPRMT5（プロテインアルギニンメチルトランスフェラーゼ5）を介したGPX4のメチル化を通じてその安定性を高め、...

研究背景 腫瘍微小環境において、高度に侵襲性の高い腫瘍は、cGAS-STINGシグナル経路を抑制することで免疫系の攻撃を回避します。cGAS-STING経路は、細胞質内の二本鎖DNAを感知し、免疫反応を開始するための重要な経路です。cGAS（cyclic GMP-AMP synthase）は、DNAに結合した後にcGAMPを生成し、cGAMPはその後STING（stimulator of interferon genes）に結合し、下流のTBK1とIRF3を活性化し、最終的にI型インターフェロン（IFN）の発現を誘導し、抗腫瘍免疫反応を引き起こします。しかし、腫瘍細胞がどのようにしてSTINGの活性化を抑制するかはまだ明らかではありません。本研究は、腫瘍細胞が低酸素条件下でADSL（aden...